ELK1_FOXO1
CAP-SELEX sample ELK1_FOXO1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTGCCACCTGTTTGCCTGACGCACCCTAATTCCCTCACAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:0d59bb3d298b
|
40 | — | — | — |
|
GGCTATGATTGGACAACGATAAGCTCACATCCGTTGTTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:10fdd867c851
|
40 | — | — | — |
|
GGCACCGTCCACACCTGTGCGGAAGTATGGAAACTTCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:2f0c53db5bdc
|
40 | — | — | — |
|
ACCAACCAGACCGTGAAGTGGACTTCCGGTATAGCTTACC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:8cf77862a46b
|
40 | — | — | — |
|
GGTGACACGCGATTGAACGGAAGCCAGCTTCCGTTCCAAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:8ce267bf0414
|
40 | — | — | — |
|
GCATAAGTTGGGCCGGAAGTGTAGGCCATACTTCCGGCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:d9216a68d36d
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGTGGAACAGGAAGTATACTTCCTGTCAACATCAATG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:9d573ce8f55a
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGACCGGAACTTGCTACAACAATTCAGTTCCGGTCTG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:f53158b46c0e
|
40 | — | — | — |
|
CCTTGAAGAGCCCTCTCAGTAAGCCACGCTTCCTGCGTAG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:0e75fb5d0f5e
|
40 | — | — | — |
|
GTACGGAACACACCGTAACTAAGACAATTTCCGGTCGCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:440b434ee373
|
40 | — | — | — |
|
GCTATCCGTAAGTCCCTACTTATGCTTCCGGAAAGAATGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:4bb8c77412c5
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGTGTGCGAATCGTAAACAAATTGCCGATTTCGACAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:93dcd078c823
|
40 | — | — | — |
|
CCCAATGACTTCCGCCGCGGGTGACGAGGGCGGAAGTTCG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:a4108c0fdaef
|
40 | — | — | — |
|
ACCCATAACGCTTTGCGTGACGGAAATTGGTATTTCCGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:6570a2f016c7
|
40 | — | — | — |
|
ACATCCGCTCATTTTGCTACGGATGAACGTATGTTCGGCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:fd292c4a1732
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGCGTCTTACGTAAATACGGGCTCATATTTCCGGAAG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:7d8908668489
|
40 | — | — | — |
|
TCGACAATTTACGGACATGCTGACCGGAAATAAACACGGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:c3c1b7a78bb6
|
40 | — | — | — |
|
GATCAGGTTTCAGTGTACGTATGCATGGCATCCGTTCAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:6f0b27fd560e
|
40 | — | — | — |
|
AACAGTCAGCCGATACGTTTAAGGTAACGTCCGGCATGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:012c49289e91
|
40 | — | — | — |
|
AGGATGCGTAAGTAGAGTGTTGACTCCACATCCGCGAACT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:61c9feeb64da
|
40 | — | — | — |
|
TACCTCACCCTGCACGTAAGGCACCCTTCCGGCATTGCGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:b68dde6452b3
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTTAACCGTAAACGATGACGCTTCCGGTGCCTTGTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:7886e5804392
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGCACCGGAAGAACTCTTCACGGTGTTGGTGCCAAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:657a575a41b5
|
40 | — | — | — |
|
GCTATATCATGCCGTAACTACAATGTTCCGGATGCCGGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:5b35b1e91863
|
40 | — | — | — |
|
CCATAAGACAGACTAACCAAGTTAAGTTAACTTCCCTTGT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:64561bd32f70
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCGACTACCCTACCGAGAAGTGCACTACCGGTTAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:30e3d772557b
|
40 | — | — | — |
|
GCGGCCAGAAGCGGTAACTTGACAGTTCCGCTCCTGTTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:4de80ea55f2c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCGTAAGACGAAATTGTCTTCCGGTGTGGGCCTTCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:d618bffd9c3a
|
40 | — | — | — |
|
CGCCCCACCCCCATCCCTATCCCTCCACCGCCATCCCCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:5275e53b5f60
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGAGCGTAAGCACGAGCTTCCGCTAGCTTGGACGCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:587e6ec3096a
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTACCATGGGCCGGAAGTGAACTTCCGGATTGTTGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:cd9b6a2069e7
|
40 | — | — | — |
|
ACACTGGGGACACACTTCCGGTTTGACCGGACGCTCACGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:cd603a12615b
|
40 | — | — | — |
|
CGTCTAAGATCCGGCACTGCCGTAACTGTAACGTCGACGT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:1c25bbc42304
|
40 | — | — | — |
|
CGGACATGCTACAGGCACAGATAAGTTGTCACTTCCGGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:6911cc3f94b2
|
40 | — | — | — |
|
CGCCATTGTCCCCCTTACACCGTAACCTGCGTTTCCGGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:029d494ee0df
|
40 | — | — | — |
|
GAGCGGAAGCCACTTGATCTACTTCCGCGTAGATTTCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:c32d580eae7a
|
40 | — | — | — |
|
GGGATTACACCGGAAGGCAACTTCCGGCGACAATACACCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:b30178a1be9e
|
40 | — | — | — |
|
CATGTTCACCGTAACCAAGGTAATGCAGCTTCCGGTAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:d4dabd83d001
|
40 | — | — | — |
|
CCCATCCGGAAGATACTATGTCTCTTAACGGAAATCCCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:b227ff47e9cd
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCAACTTCCGACCACCCACCGGAAGTGTGACATGAAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:301414517b80
|
40 | — | — | — |
|
CTGCAATAGTTGTACCGGAAGCGTGCGTCCGGCGACCTAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:10a442308b64
|
40 | — | — | — |
|
ATCCGGCAACATATCGGAAGTAATACTGCCGATATATTGA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:2a99b5ca860d
|
40 | — | — | — |
|
CAGCTAGGCACCCACCACTTCCTGCTGGCCAGATAAGTAG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:3e540ffc149a
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCTTGAGCACGGAAGCAAGCTTCCGTTCTGAACGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:ac0b9e35072d
|
40 | — | — | — |
|
ATGAGCGTAAGCATCCTATGGTGCATCCGGCTTCGCGAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:f3e6b363d44b
|
40 | — | — | — |
|
CAGGGAAAAGGAAGTACAACATACCGTCCCCTGCTTAAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:1245a3e30b24
|
40 | — | — | — |
|
TAGCCTCCTTGCGCGCGGAAGTTTCCCTTCCGGTCCAAAT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:ae6d1c954f24
|
40 | — | — | — |
|
GGACAAACATCCGGCCGACTTTACCAGCCGTACGTATCAA
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:16fa08d850d6
|
40 | — | — | — |
|
CGACGTTATTCACGGAACCGATAAATTGGCCCTTTCCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:21385bf536b9
|
40 | — | — | — |
|
TGTTCGCGATTCCGCATCGTAACTCTCAAGTTCCGTTGGG
PANAPTA:P19419:ELK1_FOXO1:PRJEB66722:R3:112bc2c212fc
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final