ELK1_HOXA2
CAP-SELEX sample ELK1_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACGGCTCGCCTCGGACTTCCGCGATAAACACGTAAACCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:8d73e3506af6
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTAATTACACGCTAATTACCGGAACAACCTACGTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:271ffa30066d
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTACGCGGAAGAGGCACATTAGGCAAATCCGCTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:8b5f26bc47d4
|
40 | — | — | — |
|
GGTGGACATGCACTAATTACGTGTCATTACGGAACTAATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ec4a06d3fb93
|
40 | — | — | — |
|
CATTATCGTTAGGCCCTAATTACATTTTCCGCTTTGTGAT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:fe83cfe1d597
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGAGGTCGTTACGCGTTAATTACTTCCTGCACCTTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:274d9e37b0a7
|
40 | — | — | — |
|
TGCTCCTTCCGGTTGTAACGATAGCAATTAGACCGCAATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:55fad5308703
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGCAAAGTAATTAGCAACACATTAGTGCACCCCAGCT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a277d3572e29
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTATCTAATTAACCATAATTAGCAGCGATTCCGGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:c71083cd7761
|
40 | — | — | — |
|
AATCAAGATAATTAGCATTACGGCCTTTAACGACTTCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ad54bbe65b1f
|
40 | — | — | — |
|
TCCCTAATTACTGGTCATTAGTACCCATTAATGACCCCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ca3d6caee49a
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCCTTGCCCCGAACCACTCCGTCATTACCAGCTCATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:6bed71a88684
|
40 | — | — | — |
|
GTCGTACCACCGTAAGCGAACTGCCGGTGAACGACCGCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:03ad87f49f21
|
40 | — | — | — |
|
TGCTAATTACTTCCGCGCGTACACTAATGACCTTCCTCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1602982b78d4
|
40 | — | — | — |
|
CCCCATTAACGACCGGATGTCATTACCGAGTCCATTAGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b83d829f9a20
|
40 | — | — | — |
|
TAATTACATCCGGCACGCTAATGTGCGCACAACTCGTGAC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:d7dfaf66dfd4
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCACTTATCTGGCACTAGCCCGCTAATGACTTCCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ebe04fb627e8
|
40 | — | — | — |
|
AATGACGTCATTAATCGTTTCCTTCCAGACGCGGAAGTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:5bd1d6796c52
|
40 | — | — | — |
|
CCCACATCCGCTAATTACTTCCGTTAGCCTTAATCGACTT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a5a2fccabc79
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGTCGCGTTAATGATCGCTAATTACCAAGAGCCGTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:04d89d2175d2
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGCGACAATTCTCACTTCCGAATCCCATTACCGCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:1a3b0abff540
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTCCTCATTAGCCTGATTGCCTTAGTATCCCGCTTT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:524c86067eeb
|
40 | — | — | — |
|
TCCAGCCCGTAAATTACACTTCCGGCATCCATTACGCATC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:2cecc01509f6
|
40 | — | — | — |
|
AATTACTTCCGCCGCCTTAATGACTTGCCCCTCTTTCATC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:01ace07a2e55
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGACGTAAGTACTTGCACTGCCGCCGGAAGAAGGGGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ba600b357007
|
40 | — | — | — |
|
AATGACTAGAGCGTAATTACTTCCGCCTACTAAGAGCCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:caf61ac88891
|
40 | — | — | — |
|
GCGTACCGGATGTCCGTTGGACTGCTCATTAACCTACATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:153f4f608633
|
40 | — | — | — |
|
AATCGACTATAACGCGTAATGCGTTTCGGAAGTCCTCGTT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:79fc1f27df4b
|
40 | — | — | — |
|
AACACCGCTAATTACGTTCTATCCCGCTAATTGCCGCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:98d82d3c123a
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCTACCATTTACCGTAATGACTGGCTAATTACCCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:6f103c1bf6b8
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGATGTCATTAGCCTCATCAACGGTTCTACGCACGGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:6e3ac3ffe4d2
|
40 | — | — | — |
|
GATTCGCGCAACTTTCCGTGACATGCTAATTACCCTCATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ac10c619988b
|
40 | — | — | — |
|
GCCGGTCATTACGAGGCCCTTCCGCCTCGCTAACGACTTT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0db770e00232
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGCTACTAATGACCTTGCCGGAAGCTCGCCTACGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:ffb71fae4431
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGACTTCCGCTTCTCCTTAACGTAGCTGCCGTTCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b14df19b4a94
|
40 | — | — | — |
|
CGCCACATCCGCTAGTAATTAGCGGCCACAATGCGCAATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:78c4a0dd1770
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCCCAACTCCATTAGGCCCCTTAATTACACCGGAAGC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:efb1c5c5c157
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCGCATCCGGTAACTGGCGCGGCAATTACGCCTAATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:b46d9615278e
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCGCTAATTAACTTACTAATGACCTACCGGAAGATGC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:e11b96034e01
|
40 | — | — | — |
|
CGACCCATTAACAACGCATTACCGGAAGGGTCATTAAGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:20b8164e3797
|
40 | — | — | — |
|
AATTACCGCTAGGTAATGGCCATTTCCGCAATTACCATCG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:65a4b4d3dfd1
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGCAATCGGAAGCGACCTGATCGCTACCGGTCCGCT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a67fd65cc197
|
40 | — | — | — |
|
TAATTACCATAATTAGACAGCCCGTACCGGAACCGGCGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:345099a4ac26
|
40 | — | — | — |
|
GATGTTAACTCTAATTCCGTTGCGACTAATGACTTCCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:23cc452804a6
|
40 | — | — | — |
|
CGTCTGCCTACTTCTCACGGCTAATTACCTCATTACCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:277f682d4c63
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCCCACAGGCACTAACCGGACGTAATTAGCACACATT
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:910f140ab3bf
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTCCGAAAAAGGCAATTAACGCATCTTATTACACCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:3a03f2f10cb8
|
40 | — | — | — |
|
AACCCGGTAATGACAGGAACGCTAATGATTTCCGCACATC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:2258284bbbef
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAACTAATTATCGGCCCATCGTATACCCTAATTACGA
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:0fbda91566ba
|
40 | — | — | — |
|
GTCCGGAAATCATTATTATCACATTAACGTCCCTGTGCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_HOXA2:PRJEB66722:R3:a343cc6cdd9e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final