ELK1_ISX
CAP-SELEX sample ELK1_ISX · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATCATCCGCTACCCCGCTGCGAAGCGCTCCCGCACTGATT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:8a88635afd49
|
40 | — | — | — |
|
TCGTCCTCTCACCGTTACCAACCCTCGACACACCGCCTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:810ec1afb58d
|
40 | — | — | — |
|
GTTGACTGGGCATAGCCACCGATATCTACGCCTCCAGAGC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:b664031dd2a2
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAATCCCCCTTGACCCGTCGCACACCTCCATCACCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:b9271142859d
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTCCTACCACACCTCACTTCAACCCTAATTACCCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:cae5af278e45
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCTCCCCACCCGGTGCCCCCCCTCCATCCTCGGCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:f19c7c12220c
|
40 | — | — | — |
|
TCACACTGCCGTTGCTCCCACCAACTCCACGACCATGACT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:edbd22ed3ded
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAGCTCTTGCGCACTCACCGTTCCCCTCGGGCCACCG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:2ea0da2699d3
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGAGGCACCACTAGCTTTCTTCCCTGGACCATAGATC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:5b6c0ff4d193
|
40 | — | — | — |
|
CCCTATACCTCGCCCACCTGTCCCCCTCCCTCGTGCGACC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:ec99158167cf
|
40 | — | — | — |
|
CATCCGCGCGGCCCGTAACGGCGTCGCGAGCCCCTTAACC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:0856f794d72c
|
40 | — | — | — |
|
GCACCACCCTTGCACTGCTACCCCCCGTCGACCCCCAGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:a429ada77f7b
|
40 | — | — | — |
|
GCACCCGATTTACATCACGTTCGCTATCTTAACAACCATT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:1fe9fb5f7896
|
40 | — | — | — |
|
GACCTAAACCGTCCATGTATCCACTGAGACAGTTGACGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:e3d84b9db69e
|
40 | — | — | — |
|
CACCATAATAGCAATTAATCACTTTAATTGTTCCTTCGTT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:13074635cbd6
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCGACACCACTAGTACCCACACCAGTGTCCTCTACAT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:b1313c0ad34d
|
40 | — | — | — |
|
TTCCCCCCACGCCGCAAACCTCCGATCCCGCGCCCCTCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:4378b8f37157
|
40 | — | — | — |
|
TCATGTTCGTGTCACGCTAGACACCTAAGCCTCATAGTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:5aa6e8328b07
|
40 | — | — | — |
|
GTGCACTTCCGGTTCATCCGTAAGTAAAGAGTGCCCCCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:7aba3bf276c1
|
40 | — | — | — |
|
GCGTCCCACTACCCCTTCCTACCGCTCCCTGCCTCTCTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:ae59d8cd2a21
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGCTTAACCGAACGGAAGACCTAATTGGCACTTCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:6072839b5c14
|
40 | — | — | — |
|
GACACAGATACGTATGCATTGTGCAGTTCATTTTAAGGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:79be196b45c0
|
40 | — | — | — |
|
ATAATCCCGTGCTCACCGCGCATCGCTCTGCACGCGTACA
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:2e56859b04b2
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCTTCGGAATCCACTCCCACCGCCCCCCTCCTTTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:d66b521d554d
|
40 | — | — | — |
|
ACCTCCTTCCGCCACTTGACTGACCCCGCTGATTATCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:e1d96ac8c42f
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCATCCCGCAACCCCGCCACGTACACCCACCCAACAC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:c6574bc1a9a3
|
40 | — | — | — |
|
TAAGGTCCGCATGACACGCCCCACCCTCCACCCCTATGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:51320a119b1d
|
40 | — | — | — |
|
CCAAATGGCATCCCCGCCCTCACCGCCCTCTCCAACAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:e7b08b069cf5
|
40 | — | — | — |
|
ACCCAACACGCATCCATCCATTCTCCCCCCCTTAACCACG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:d22b199bf69f
|
40 | — | — | — |
|
CACTACTGTATGACCTGTCGCAATCACCATGCCTTACACC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:9316b45899ba
|
40 | — | — | — |
|
CACTGTCAACAACCATCCCTTCCGGCCTACCCCCCTAGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:f1e6666c23f9
|
40 | — | — | — |
|
CAACTGCACAGGCGCGCTTCAGTCGCATCCTTCGATCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:727d971963bf
|
40 | — | — | — |
|
CCACCGATCCTCGGCCGGCCCGTCTTGACATCGGGACCGT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:90c378d64037
|
40 | — | — | — |
|
TCGACAATTTATCCACCGCAACACCTTATGACCACTTACG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:3e16c336326f
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCTTCACACGGCCATGCCCTCGACTTCCACCTCTCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:7fef2671490c
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATTGATGTTGTCTCAATTAGCATGCTTCCGTCACT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:2051f8dfbb37
|
40 | — | — | — |
|
CACGGCTCCACCCTCTAGATGTTCCGCACGCACTGACCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:b56be35ce9a9
|
40 | — | — | — |
|
ACCAAGCTCCCCCCGCCGTCACACCCGCCTCACGCCATTG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:41879f5206d0
|
40 | — | — | — |
|
AGCGGTCCGTAAATGAGCACTTCCGGTCCTCACCAAGCCA
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:cfb371651897
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTGCATATTCCACCGATCTGGTCACTCTTGCATGACG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:ca18e6454598
|
40 | — | — | — |
|
ACTCGATACACCGCACAACACTTATCGGAATTCGCCAGAT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:ad177add493f
|
40 | — | — | — |
|
CGGCGTACTTCCGGAGAATTAATCCTGCCAGTTACGTATT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:29cd296a58d2
|
40 | — | — | — |
|
TACCCAACCAGGTCTAATCCCTACCAATACCTCTCCAACA
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:fda621122ca3
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCTCAACCCCCAACTCTTATCCCTGTGCTTATGCCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:6269566863df
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGAATTTCCGTTCCCCGCTACTGTGCCACGTTAATC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:01b161e6ce2f
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCTACCACCACCCGCACAACCTGCTACAAACTCTCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:9a7a37df34d7
|
40 | — | — | — |
|
GTGCGCCTTACCGCAGCCGCAGTTATCCTCGTCCACCTCG
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:f518d8a107c3
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAAGTGATAGTCCATAACTTCCGGTTCCGCTTTCATT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:255e2f664bf6
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTTTATATCTTGCCCAACTAGCATGACTTCCCTTCGT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:c27998de94d8
|
40 | — | — | — |
|
ACCCACTTCCGGGCAGCACAACCTGATTCGTGCGGTAATT
PANAPTA:P19419:ELK1_ISX:PRJEB66722:R3:e7402f38b8af
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final