ELK1_NKX2-3
CAP-SELEX sample NKX2-3_ELK1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCTCCACCTGCGTATCGTAGCGGAAGATCACTTCCGCCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:3682dd94eee5
|
40 | — | — | — |
|
CTTCATCTATCGGATGTGTCATCAACACTTCCGATATAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:298254efe6a1
|
40 | — | — | — |
|
CTAGGCGGAACATCGACCGGGACTGAGGTTTCCGGCCCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a2ab58588776
|
40 | — | — | — |
|
TGAGAGGCAGGAAGTAGTACTTCCTGCTGACACAATTAGA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:658f4d51da9a
|
40 | — | — | — |
|
CCCAACTTGGGCAACAGCTTCCGCTCCCTATGCACTACAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:cb73e8d6aa73
|
40 | — | — | — |
|
GTTGTTCCTACGCCCCTCTGTTCCACTTTCCGGCACTCAA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:cc2a923909c9
|
40 | — | — | — |
|
CGGATGTCCTCCTCCCTGCCGGATGTGCATCACTTAGCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:8b4b5ab44774
|
40 | — | — | — |
|
CCACGGTGACGTAAAGCTACATCCGCTGAATGGTATGGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:f9e57faee340
|
40 | — | — | — |
|
TACTGCCAACCGGAAACACACATCCGGCATGCATCCGGTG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:5573bd88c52e
|
40 | — | — | — |
|
TCGGACCGGAAGTGCCACTTCACTCTCCAAAGACCAGTGG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6f55b45099a7
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGACAACACGTGTTCCGGTTCACACACTACCGCATCC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:ef160b511792
|
40 | — | — | — |
|
GGATAGTAACCCCTACTTCCGGCTAGCAGCGTTATGCTCT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:7c0a0996bedf
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCGACGGAAACGGATTGCCGTCGTTGAAGTGGCTCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:88198f2ad0e9
|
40 | — | — | — |
|
ATTTAACTAGGAAGCAAGCTTCCGAGTGGTTGTAAGCCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:80fc4238c6d2
|
40 | — | — | — |
|
GCGTCACGAACCGCGGAAGCACCTTGTACTTCCTTTAGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:5e56c51a713c
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTTCCTTCCGTCGCGAATCAGCGCATCCTCCATCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:d99077fd2072
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCCACCGCGGATGCAGTTTCCTCCTACAAGCAGTAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a6f42b254f1e
|
40 | — | — | — |
|
CCCGGTGTCAGCTACATCTCAGGAAGCAAGTGTTCCGGTG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:d5ffcfee73d1
|
40 | — | — | — |
|
CGCATCCGCCATATTCCGGACGTGACGTCTGAAAGACTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:d5b7ebd387c5
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGTGGCTACTTCCGTCCAACGCCCACTCGACTTTACG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:e78ec1d61f96
|
40 | — | — | — |
|
GGATGCCAATTAACATTGCTTACTCGGATCTCGAGCATAA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6379189887af
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTATCGGCGCACTCCGGAAATGGCAATTCCGTACAGT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:160b64ec7372
|
40 | — | — | — |
|
GACGTTCCGGACGTCCTAACCCGCTTCCGGTTCGCGCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:602da020b6b3
|
40 | — | — | — |
|
TCACACTTCCGGGACACGAAAACCTAGGCCCTATTTGGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a9e7223b6a48
|
40 | — | — | — |
|
TATCCTAGCCGCGACGACAACTGGCTTCCGTAAATCACCC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:265008a10401
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCTTAAGTGTTTACGGAAACTACGAGCTTCCGCATCT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:19ca2297cc03
|
40 | — | — | — |
|
TCCACAATACACTGGATGCTTCCAACTTCCGGCATTGCAG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:8aa8c1ddfaa8
|
40 | — | — | — |
|
GCATCCGGACGCGAGGCGTACGACAGCGAAATCATTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:e52a70202a15
|
40 | — | — | — |
|
GGTATAATTGATTCATACAAATCCTTCCGGTTGATAAGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:ff1806c61c69
|
40 | — | — | — |
|
CTTTATCTTCCGGCGTTATGTGCTCCCCTGCCCTCTTAAG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:cde6e00402b7
|
40 | — | — | — |
|
AATACATACCGATCAATTTACAGTTACCGTCAACTTCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:62a589557c21
|
40 | — | — | — |
|
AGTACGCGTTACCGGAGTGGCATTACGGTAACACTTCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:025ec2acd220
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGGTGACAGCCTATGCTAATAGTTCGCATAACTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:587bbbe29310
|
40 | — | — | — |
|
CTGAAGCTTGTCGAGCACGGACAGTTGACCTTCCTGCCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:3cd20b91e454
|
40 | — | — | — |
|
CGGCATAATCGGAAGTAAGTGCATGTATCGGATGCCTATC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:cf9658d9f870
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCATCGGAAATACCAGATCACCGATGGCGCTACTGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:6dcf0c55eafb
|
40 | — | — | — |
|
CTTCGGGCAACGCACATGTTTCCAGACGGAAGTAACCACC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:17bd56b05579
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTCTTCCGGATGAGTTTCATCTCACTGACGCACTTCT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:7662cdb89636
|
40 | — | — | — |
|
CCACCCGAACTACATCCGCATCCGTTTCCTCATCCGACAC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:db38186638e8
|
40 | — | — | — |
|
GTTCCCCCAGCTGATGAGCGCAGCAATAACAGTTCCGGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:b3eeeee51814
|
40 | — | — | — |
|
GATCGAACTGTCCCGCCGTGCCGGAACCGGACATTATACC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:a9b574abb2de
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGACGTGAAATCCGCATGTGGTGAGGACATTTCCGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:66595abcfbf5
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCACTTCCGCCGACAACCTGCATTTAACGTAAGACAT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:24e59cce56f4
|
40 | — | — | — |
|
CTTACAGCACGTATTTCACTTCCTCCTCCCGCGAACGGAA
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:82b8679980eb
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCACCTGAGTAGGCATGCTCGGATTTCCGTCCTAACT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:b5c4c7a7b50d
|
40 | — | — | — |
|
ATTCTCTTCACCCATGACCTTCCTGTCCGCTGAAACATCC
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:19b0ea68c096
|
40 | — | — | — |
|
CTTCCCTTACACTTGCATGACGGAAACAGCGGAAGTTCTT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:ced379b4c1e7
|
40 | — | — | — |
|
ACCACATCCTATTTCCACATGGAATCAGTAATCCGTTTTG
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:0d5b020376ed
|
40 | — | — | — |
|
TTAACATCCGGCGCCCCACATCACACGCCATGCAACCTAT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:e09b040e11db
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCCAACCCTGGACGCCCTTCCGGTACCACCTCTTCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_NKX2-3:PRJEB66722:R3:37659d5cefaf
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final