ELK1_OLIG2
CAP-SELEX sample OLIG2_ELK1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAAAATAGTGTTTCCGCCTTGATTACATCGTTTTACCATC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:782599b6bf03
|
40 | — | — | — |
|
GATGTTTGCATCCGGATCATTTGTATATGTTACGTTGAAA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:4ffe3f0aa588
|
40 | — | — | — |
|
GTAGGCCGGACAGGACAGCTCGAGAGTAGCGCGATCGTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ca225716dcca
|
40 | — | — | — |
|
GTACCACAATACACGGAAATGCACTTCCGTCATTCGAGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:918fcf266c35
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGTTGCCCCCTGCGAACCGACCTTCCTGTTCCGCTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:987469608a5e
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTGCTATCTCGTGGAAGAGGAAGTACATGACTTCCGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7d7782db3c73
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTCCGTAAGCATACGCCTCCCATCCACTTGACTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:dd5f8497cf4b
|
40 | — | — | — |
|
AGGAAATAACTCCACATCGGGACCGGAAGCTTACCTCAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:8c8995abb6ab
|
40 | — | — | — |
|
TGAACTTCCTTCCACTCCGGACGTCCTCCGCCACCATTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ad3ae070650f
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTAGCACGGCAGTTAAAACCACGACGAGGTGCATCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:c923772a6c7f
|
40 | — | — | — |
|
ACCACCCCTCCGTACTTACGGAAATCCGTCCGCCCGGATC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:2b9583b57e56
|
40 | — | — | — |
|
CGACATTGTCTTGCCGGAACACGTAAAGTTCCGGACTCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:d1833e8ec038
|
40 | — | — | — |
|
GACAGGACTTTCAGTGTCTTCCTCCGGAAGTGTGCTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:e3f42fa8cb9d
|
40 | — | — | — |
|
GAAAGGCATCAGGAAAACTCTGTTTCCGGTACACCAACAG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ce93aec6aa07
|
40 | — | — | — |
|
GGGAAGCCGCTCGACATGTCACTTCCTGTGTCTGGCTACC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:98121f8bdffe
|
40 | — | — | — |
|
TAACCTTGACTTCCTGCCAGCTGAACGGGACGGAAGTTGA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:90e64e61fa7c
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCGCTGCCGCATAACCATATGAGGAAGCGTTAAATCC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:107ea0b066d4
|
40 | — | — | — |
|
TAAACTCTTCCTCCCTTTAGCAAGATGACTTCTTCTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:4a8c060f9824
|
40 | — | — | — |
|
GACACGATGGAAACCGTAAGCATATCCGTTTCCGACTTCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:1605080cb8e4
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCCTCCTAACCCATAATTCCTTCCGTGACATTTCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:d29bed9d5247
|
40 | — | — | — |
|
TGCCACCGTAGGAACAGTAAGCAAAGTTCCGGTTCCGTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:79cef83d35ad
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGGACATATGGTCCGCCATGAGACTTCACCGTTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:faf0a9fd17af
|
40 | — | — | — |
|
TATTGCCGGAAGTTGGAACTTCCGTCTTCCTCGCTCGCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b3efc6b1848b
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCGCAAAAGCCGTGAACGCTTCCTGATGAGTGACGGG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ece44456e9d7
|
40 | — | — | — |
|
GAACGTAAGTTCCCGTCACTCATTCCGGCGAAACCGCCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f5ea24d33079
|
40 | — | — | — |
|
GAATTCCGAGATGTTTCGTACTACCGTTGTGCTTCCGTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:9396aea628fe
|
40 | — | — | — |
|
TGGAAGCGGTTGACCAGGATGTGCGTGACGTTTCCGGTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:c4ac2e3d2b78
|
40 | — | — | — |
|
GATGTTCTCAGTCACACCCTAAACTCGATTCCGTCCGGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7dbd3a5bbbbb
|
40 | — | — | — |
|
GCTATCCGGCCCCAACTTCCTTCCGCAGGCTACACATCCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:1336fd227248
|
40 | — | — | — |
|
TTGGTGTCGTAAAGTCGCGTTATCCTCGCTTCCGGTAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f2d450665df3
|
40 | — | — | — |
|
GTTGAAGGATACATGCCGATAAAGGGAAGTGACGTTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:783f4ee36235
|
40 | — | — | — |
|
CTAAGCTCTCCATTTGCCGGGCCAGGCCATGCATCCGGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:6b87eec2866c
|
40 | — | — | — |
|
GATGCAGTACTTTTCCGCTCGTTATTCGGAGTTGCATCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:b464fb8a9c7f
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTGCTTCCCTGGTTACGTAATTGTACACTTCCTCCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:45e5d0e918ba
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGAACTTCCTGTTCTAACTTCCTATATCGTCAGCTGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:13867896807b
|
40 | — | — | — |
|
GACGTCACCGGGTCACCCTCCACCCCATCCTTCCGCCTAT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:71bde811b96b
|
40 | — | — | — |
|
GATGTGCACATGGCGTGACCGCCGGATGCAGGGCTTCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7cc53731dd26
|
40 | — | — | — |
|
GACGGAACTGTACTCATCAACTTCCGTGTAAGTTGCGCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:5c0030323138
|
40 | — | — | — |
|
GAATCCTTCTAGTGTACATCCCGGAAACCTCCACTTCCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:7681c9b0522c
|
40 | — | — | — |
|
TACGTTATTCCGGCTTCCGTGTTCCGACGTAGTTCGTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:01021162525b
|
40 | — | — | — |
|
GAAATGCGAGGAGCTATAGCTGCCTTCCTCCAAGTCGATC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:bccd6ad8ecbd
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGGAAACGGTAAGGCATAACTCTTGCTTCCGTCTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:73419d9e1cff
|
40 | — | — | — |
|
TATTTCCGTCGTACGTATCCGGTCCGCTCGTAAAACCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:f01e827f082e
|
40 | — | — | — |
|
TAACCCCGAACGCCATCCTGTCCGCACGACATCCGTCGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:2a4aa460a5f5
|
40 | — | — | — |
|
GATACCAAACCGGATACGTATATACGTTACGTGTAAGGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:239b7ec666a8
|
40 | — | — | — |
|
TTGCAGGAAACTCTGCCGTGACGCCGGAACAGTATGCTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:694f3f79ca2a
|
40 | — | — | — |
|
GAAACCACAGACGCAACGATGCCGACCGTTTCCGTCTCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:3b49655f55e0
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTCCGGAACGGACGGAAGTATCCTAGCAATCCGCTGA
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:63380f947487
|
40 | — | — | — |
|
TAGAGCGGAAGGAAGCTGTAACTTCCTTACGTAATTGGTG
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:1f3af0474c34
|
40 | — | — | — |
|
TACACACCCTTTACAAACCGGACGTCAGGATACATCCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OLIG2:PRJEB66722:R3:ee77fe20f041
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final