ELK1_OTX2
CAP-SELEX sample OTX2_ELK1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCAAACCACACCTTGCCACGGTAAGCCTAAGTCGTTACGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:948d85a073a6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCATGAGCGGAAGTCCGCTACCCTGAACGTACTTCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:1c16be8576ad
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGTTCCGTTCTGGCGCTTACGATCCTCTCCTAGCTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:6c373a4f6b9f
|
40 | — | — | — |
|
CCACCGGACGTACCGTTGCCGATACCGGACGTCCCGCAAT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:7cab96c5f212
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTAGCCCGGACGGAAATCATGCAATTCCTTCCGACGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:e02c90cff859
|
40 | — | — | — |
|
GACCGGAAGTTCCGCAAGTCCACACCTAACCATCCTGCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:cdce46118cc1
|
40 | — | — | — |
|
ACATCCGTCACTCCGAAATGAAGCGTCGCTTCCTCTCGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:9c6edcf4080b
|
40 | — | — | — |
|
CGTTACGTAAAAACGGACATCCGGTACGACGTAAGCCTCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:bac9282eb871
|
40 | — | — | — |
|
CCCAGCACTGCTTCCGTCGCGCTACGGAAGCTGTCTTACA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:77be2f631a58
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAACCGACTCTCAAGTTAGTAACTTCCTGTTCCGCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:40f09d2f37c6
|
40 | — | — | — |
|
GCGGAAGTGCCAAGAATGACCGGCATATCCGCATAATACG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:5e341de71bcb
|
40 | — | — | — |
|
CTAGTAACAGGAAACCCCATTTCCTGTTGCCTTACCGTAA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:f5bf4bf0ab17
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTCTTCCGTCGTAAGTGCTACTTCCGGGAGAACCGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:6375022617b2
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAAATGTGTGGAACCGGATGTGGGTGGTCCCGTCGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:eb1575ecbec6
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAGCTTTTGCACCTCCGGTACTATCGCGACCGGAAG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:4f59b55a8c36
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCAATACTCGGACGAATACATCCGCCTCAAGTCACA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:93e2cb142aa4
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTGAGAGCCGGAAGCGGAAGATACGAACACGTAGTTT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:4876a0a5d7b3
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGCTACGTTATTAGTGCTCAGTTCCGGTGCCACAACC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:98afe9a5c77e
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGTAATCACATCCGGCTATTTGCGCTATTAACGGAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:a6814eec94d2
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTCAAGCATCATGGCACGGAAGTATCCGTACTATTGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:05482befce88
|
40 | — | — | — |
|
GATTCGGCCGTTCCTAGCTTCCGTTGCGCATCAACAAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:71747224938b
|
40 | — | — | — |
|
AGCACGTCCGGCGACTCAACTTGAACACCACCTTCCGGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:a5f812839c21
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTCGACTACCGACGATCACATCCGTAACTTCCGAATG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:206e15d3a0df
|
40 | — | — | — |
|
CCTTCCGTTGTTCTCGCTTCCGCATTAGTTTCAATATACC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:60f50276763d
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTCCCCCTCGTCATGACGGACCGGAACCGCTGTTCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:ac5a95a98c92
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCAGCAAACCGGCCACGGTCCCGCCGGAACTGGTAT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:ad95877adb52
|
40 | — | — | — |
|
TCAAACACAGGTCCTGCGTTCCGGTGGCTTGCTCCGGAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:28ef8cdc3498
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCACCGGAAATACGCGCACAATACCACCAGACCTGGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:74edd4b172ec
|
40 | — | — | — |
|
ACTTACTTCGAAACCGGAAGCAACCCCTTGCCTCGCAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:74ea16126550
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCCCCCCTCGTATCCCACAAGGGACTTCGTACTTACC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:84778bfc009f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGACACGCACTACGGCCTGCAGCAGCACCGTAACTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:fa44dc0a55ed
|
40 | — | — | — |
|
GCAGTTCCGCTATCATCGTTTCCGGTCACTTCCTGCGATG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:9475e8773bab
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGCAGGAAGTGAACAGCACTATCCTGCTCGTTGCCTG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:94a5d73ac4a1
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCCATTTCCTCCCCACCGTGCAGGGCGTCCGGAAGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:54f31627d4a7
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCCGCCTCCCATATTTCCGTGCCGTTTCCTCACCGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:3ab7e9f91bc6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGCTTCCGCACCTCCACGTCCGGTTGCAACGGATTC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:1b0215059077
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGATCCCATCAACGTCGCACGTACCACGTCCGCCGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:07068139d43e
|
40 | — | — | — |
|
CTGCACTAATCAGACCTTCCGGCGGATAAGGGCATCCCTA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:b117dcdbfd4d
|
40 | — | — | — |
|
CGGGGTTGTTCCGTAGCGTACGCGTGATCCCTAAAGTCTG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:923ed5281064
|
40 | — | — | — |
|
TAGCTCCCGCATTCCCGCAATGTAGCGGGACACCGGAAGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:50c587242f55
|
40 | — | — | — |
|
CCCGGATATCCTGTTGATTGGACCGCCAATTCGGCAGAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:16ed2120fc92
|
40 | — | — | — |
|
CACAGCTTGGTGCACTTCCGGATGGGGACGGGTAAGTGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:f482364fa576
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAGGAAGTACCTCCGCTACTTCCTAACTTCCGGACGT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:57f813072677
|
40 | — | — | — |
|
TCCGAATGCCTCCCCCTTCCTTCCTACTGCGCTTCCGCTG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:2886ab276923
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAGCCTGTCACGGTAATCCCATCCGGCAAGCCACGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:0f393cda318f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCACGTTTCCGTAAGCTGTGTGCCTGACATCCGGCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:7a7011ecb38d
|
40 | — | — | — |
|
CATCCCGTAATCAACATAGCTAACTCCACGCCTTGTCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:dbed21b7baa5
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCGGCCTTCCGGCGCTAATCCTCATGCTTCCGCCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:fd267bfe7983
|
40 | — | — | — |
|
CGTTGACTTCCGTGCCGTAGCGTATTTCCTGTGCCTGGTT
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:96f57c818804
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTCCGATGACAGACGGAACGACGTAGCCTACCTGCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_OTX2:PRJEB66722:R3:ce1d9df57f61
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final