ELK1_TBX21
CAP-SELEX sample ELK1_TBX21; Mixture-SELEX sample ELK1_TBX21 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACATCCGGTAAAGGTGTGACCCACGCCTGACACCTCCCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:aa4ebbe838a9
|
40 | — | — | — |
|
TCATCACCTCGCAGGTGTGATCCGGACTTAACACCTCGTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:0afa82efbf26
|
40 | — | — | — |
|
CATCAAAGAGCACGACGTGTGAACGGAAGTAACACCTCGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:fee4f725fbd3
|
40 | — | — | — |
|
CACACTTAGCCAACGTGTGACCTTCAATTCACACCTCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:fd3b9a57589b
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGAGGTGTTACGCCGATTCACACCTTTCACGCCACGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:46fcc2deb7a5
|
40 | — | — | — |
|
AACACCTGTCAGTAAGGTGTCGCACTCTGTTCACACCTCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:40f0272c897f
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCAAGGTGTGAAGCATGTTCACACCCTTCGTCACCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:906c5cbef46f
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACCTACCGTTGTAACCGGAAGTCCGTTCAACACCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:114c40834e6b
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGTGAACACGATTCACACCTCCCTTACCTCAGACCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:935c881c93bb
|
40 | — | — | — |
|
CCACCTTGAACCGGAAGTAACACCTCAACGTCACACCGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:408dc937d474
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCGAGCCGAGGTGTGACCACGCTTCACACCTGGCACT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:d72b81575a5d
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGCGTTCGAGGGAGGTGCGAAAACTAGTTCACACCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:2bd3a80ac2bb
|
40 | — | — | — |
|
CGGAGAGGTGTGAAACAGCCTTCACACCCTGGCTTGACGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:b71c380b9cd9
|
40 | — | — | — |
|
AGCATCAGAGCGGCAAACAAAAGGTGTCACTTCCGGTGTG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:b1c23aee6343
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTAGATAGTGTTCACACCTCCCACTAGCAGCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:ba012c4c0300
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCCAGCCTGCCAACGTGTGAACTTGCTTCACACCTCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:08625476d42b
|
40 | — | — | — |
|
CACACTACGTGTGAAACACTATTCACACCTCCCCGCGTGT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:3e52d2a2e01a
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCACAATGTGTGAAAATCTCCTCACACCTGCCAGTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:c910c7cceacf
|
40 | — | — | — |
|
TCCTCGAATGTGTGAACTTTTGTTCACACCCTTGCGCGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:a2c8ae21c1a1
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAAGGTGTGAACACACCTCACACCTCACACCACATTT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:4628857ff504
|
40 | — | — | — |
|
CAGCATTGCTATGAAGTGTGAAATACGATTCACACCTGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:20d061cdf985
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGTGTACAGTGGAGGTGTGAACCCTCTTAACACCTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:825506678bdc
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGCCCGTCCTAGGTGTGAACAACGTTTCACACCCAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:84ad5a676aab
|
40 | — | — | — |
|
TCACACCTGCACCCATTTCCGGTCTCACCTCCTGTCCCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:44fce4ba9e98
|
40 | — | — | — |
|
CTACCGCCCCAACGGTGTGAAAACATTATCACACCTTCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:0fb06cf9f9d4
|
40 | — | — | — |
|
GAGGTGTTAAGCATCGATCACACCTTTTCTTTGGCGTTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:9e5d4f58dad9
|
40 | — | — | — |
|
GCCCAATAGGTGTTACCGCGACGCGACACCTTTAAGCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:a52e05898da3
|
40 | — | — | — |
|
CACATCGGACGGGAGGTGAGAACACCTTTTCGCACCTTGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:39e5189d3123
|
40 | — | — | — |
|
CTAGGTGCGAAACTAATTCACACCTTCATGCGTGTCCCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:5d93b4cd9d53
|
40 | — | — | — |
|
AATGACACCCTCGTACTTCCGTTCACACCTCCGCACCTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:1c0b76d6d97a
|
40 | — | — | — |
|
CCATCCGCAGGTGTGAACTCAATTCGCACCTTCACGCCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:98791e6f3a5e
|
40 | — | — | — |
|
GAAGGTGTGACCTCCTCTTCACACCCCTCACTAGACCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:6aebca044178
|
40 | — | — | — |
|
GTACCGAAAGGTGTCAATGCGATTCACACCTGCAGATCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:265095cb4fef
|
40 | — | — | — |
|
GCGTCTGAGGTGTGAACAGCTGATAACACCTTCATCCTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:b0c13193c483
|
40 | — | — | — |
|
AACACGAAGGTGTCAGTGCTCGTTCACACCTTAGCGCTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:795c68b9ed6a
|
40 | — | — | — |
|
TTATGTGATGCTTCACACCTTATGAACCGGAAGTAACACT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:587f463101da
|
40 | — | — | — |
|
CTTAAGGTGTGAAATTCGCCTCACACTTCGCGCCCTGCTG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:bc5f3360fd98
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCGCGAGGTGTGAAACCCATGCCACACCTCCTCGCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:63bde5104b2b
|
40 | — | — | — |
|
CGGAACAAAGGTGTGAATGCCGTTCGCACTTCCGCCCGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:d38667509e59
|
40 | — | — | — |
|
CCACGTATTACGCCCAACGTGCGAAAGCAGTTCACACCTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:86afb9aace71
|
40 | — | — | — |
|
CACACCTCCCGTCACCGGATATAACACCTTTACCATGCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:86b7881fec46
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCTGGACCTGCAAGGTGTTACCTTTCATCACACCTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:3dd33010ead9
|
40 | — | — | — |
|
AGTCATCACGACCCTGAGGTGTGAACTACCCTAACACCTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:79c69443a786
|
40 | — | — | — |
|
TGACACCTCACGCACTTCCGCTGACACCTCCACTGTGACC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:c492160a106b
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCTGAAACAAGGTGTGATTCCCATTCACACCTTCAAG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:c9c197930a8c
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGGTGCGAACTGACAAGTCACACCTCTCAACGGCGTG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:49f09c2f3111
|
40 | — | — | — |
|
GTAGGTGTGAACCTACATTCACACCTATTCAAATGTGGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:ff33ca0167f7
|
40 | — | — | — |
|
TTTCACACCTTTCACACCTCGTAGCGGCACCGGAAGTGCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:54678115b37f
|
40 | — | — | — |
|
TCCCTCCTAACACCTCCCTACTTCCGTTTACACCTTGCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:392bba1db498
|
40 | — | — | — |
|
TGCTACAGCACAACTAGGTGTGACCATTTGTTCACACCTT
PANAPTA:P19419:ELK1_TBX21:PRJEB66722:R3:150add6026de
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final