ELK1_TCF7L1
CAP-SELEX sample ELK1_TCF7L1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACCAGACGGTAAGTCGCACGCACTTCCGGTCTTGCTTTC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:7b3a14163684
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTCGACATCCGGATGTACACTTACGGATACTCCAATC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:8e447c664623
|
40 | — | — | — |
|
GACGATGACCGCTAAGCCATGACTTCCGGTCAGTCGGCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:ad31e9f52726
|
40 | — | — | — |
|
AGTCGAGGACCGGAAGCGACGTTCTTGCTTACGCGTCTAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:aa784fb623e3
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCACACCGGAAATGGCTAATCCTCATTTACGTCCGAA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:cf5b27b9898f
|
40 | — | — | — |
|
AGATCCGTAAGTGGCCCTATTGAGGATACTTCCGGCTTGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:b24a16c98683
|
40 | — | — | — |
|
GGATACGGGATATGACGTAAGTATTGACATACTTCCGCCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:35ed09e97a39
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCAGCACTTTCTCCGTAAATGCATTTCCGGCTCTCAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:1e09b7c73408
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTAAACCGGAAGTAACAACTTCCCGCCCTGCCCTGAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:bbe906b09f05
|
40 | — | — | — |
|
CAAGGTCTTCCGGGAACATTCCCGTAAGTCACACGCAAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:2999ba7288a2
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAGTATAGGAAATGCCTAGTTTCCGACCTGAGTCATA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:5c0ccb36e3f7
|
40 | — | — | — |
|
ATAATTGCACCGTAAGCGCGCTACCGGTAAGAGCAATTTT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:250f52697f2d
|
40 | — | — | — |
|
CCGGATGCACACCCTTTGATCCCGGATCAACATCCGGTCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:90fccb78368d
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGCTCGTAAATCTGTGTATTTCCGGTCTTCAATTAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:0c5941cedc49
|
40 | — | — | — |
|
TCGTGAACATCGCAAGTAATTTAAATTCCGGCGTCGTTCC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:3a6cc79fffdb
|
40 | — | — | — |
|
CATGTGAGCTACCGGAAGCTCGCATCCGGTCACAGCTGCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:fd59706d4fc0
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGCGTACACCGTATGCCATCACATCCGGTCTTACCCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:43a663b1f009
|
40 | — | — | — |
|
TCGGGCGACTTTAACGCCGCCGTAAACTTCCTTTCCGGCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:0c1914c17b31
|
40 | — | — | — |
|
ATAAATGCTGTACGGCATTTCCGGCATACATCCGATTCGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:3a0e4695693d
|
40 | — | — | — |
|
TATCCGTAACCATCTGACAACCGGATATTCCAATTACGGT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:4af13eee4e37
|
40 | — | — | — |
|
CCAGTACAACGTCGGAAGTAAGAAGGCACTTCCGCCCCAT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:2a6dce52ca64
|
40 | — | — | — |
|
CATGGGCTTCCACCGCGTTACCGTAAATCTATTTCCGGAA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:03f5c9d59825
|
40 | — | — | — |
|
CGTTGCCTAAAGCCGCTAACTATGAGATCCGGCTTTACCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:d405d92ef97c
|
40 | — | — | — |
|
CAGGAACCGGAAGCTCGGAGTTTCCGGTTCTGAGTTACAT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:44043d1c077d
|
40 | — | — | — |
|
CAACTGTTTAGTGCATCCGGTATCAAGCTCCCGTAAGTCG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:1399cadb80b9
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCCCTAAGATTCCGGAAGGTCACAAGCTTACGGAAGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:f0909615fd60
|
40 | — | — | — |
|
ACAAATACTTCCGGTCATACGCGTAAGTTTTAATTGCGAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:c7707fa55ce6
|
40 | — | — | — |
|
CTGTATCCACGTATGTACAAATTTACATCCGGTTCGCCAA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:a733a50ac715
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAGTCTAACTTCCGGTTCGCACATAGGGAATTGTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:5a581e63ecc2
|
40 | — | — | — |
|
TTGGTCGATAACCACAGTTCCGACCATAACTCCAATTTCT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:c9af5082af14
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAGTAACAAGATGTTACTTCCGGTAAGCTACCAAGTA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:94864ed0cdba
|
40 | — | — | — |
|
CCTAACACTTGCCAGTAATGACGTGTAGAAAGCTGAGCGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:fa9fbd2fe97e
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTGCACTTCCGGGTTATAGATAGCTCGAACCACG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:f1c8acc428f3
|
40 | — | — | — |
|
GGCATGTACCGTAAGTATTAAATTCCGGTAACACGACGGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:957b9a84485e
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCTTACTTCCGTCACGGTACCGGAAGCCGTTTGATG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:3d511a19d2f4
|
40 | — | — | — |
|
TATAGTTAACGTAATCGAGAAATCCGTTAACTCCCTAGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:27d962eec78f
|
40 | — | — | — |
|
CAGGGAGATCAAACCGTAATATATATGCCGGTTGACCATA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:e0c598138478
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGTACAACGAAACTTGAGAGTTCCGGTACCATTACGA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:b17dd3b265ca
|
40 | — | — | — |
|
AATAAAAGTAAGTAAGAATACTTCCGTTTGTTGCCACTTA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:1aa84e3f8cd9
|
40 | — | — | — |
|
GGCATAAACCGTAAGCTCTCTTCCGGTCCCGACCGACATG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:9d6806ceed50
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTGGGGACCGGAAGCTCTCCCACTGCTTCCGCCCGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:58d943f40ce1
|
40 | — | — | — |
|
CTCAACCACCGCACTTCCGGTGGCACCGGAAGTAACCATT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:982ef8147d3b
|
40 | — | — | — |
|
ATCTCAGCACGGAACCGGAAGCATATCTTAGCTATTCCGT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:87f795a47c47
|
40 | — | — | — |
|
TAGACCCGTTGCCGCCGTAACGACCACGTTCCGGCTAAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:0996041874e5
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTATATAGACACGAAGCATGCTTCCCGTCTTCTATAT
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:11cc33b9d228
|
40 | — | — | — |
|
CTTTCCGTAAGAAGACTTCCGGTCCGCGACACCATATCAA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:94aef573cf92
|
40 | — | — | — |
|
TTGACAGTAAGTGGCTACTTCCTGTCACACTGTCTGCAAC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:99e1873bc246
|
40 | — | — | — |
|
CCGGACGTAACCCGATAGGTTCCGCCCAGGAGACCGGCGC
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:b43b4528885e
|
40 | — | — | — |
|
AAAGCAAAGCACCCACCCGTAAGCTGCTGCTTCCGGGGCA
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:3a10d15d3936
|
40 | — | — | — |
|
ATGTAGCTAACCGGAAGGGATCTTCCGGTCTGTCGTACGG
PANAPTA:P19419:ELK1_TCF7L1:PRJEB66722:R3:1ece7b391913
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final