ELK3_HOXA2
CAP-SELEX sample ELK3_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AATCGATTGCTAATGACCACCCATCTCACTTCCGGCACTC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:075704d060e4
|
40 | — | — | — |
|
CTGTAGTCGCATCTGGCCTAATTACACTTCCGGCCACTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:2ba14786daa9
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTGTCATTACACCTCCATTATGTGGCCTAATGACGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:991c963e5552
|
40 | — | — | — |
|
TAACGACATCCGGAAATAATTAGCGGGAACTGCATCCGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:cf520522e6c3
|
40 | — | — | — |
|
TGATTACGTACGCAATTAGCCGTCGATACCGGAAATCCGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:643a36fbb62d
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAATTACCGTCCCTCTAATTACTTCCCTTTCCGGATC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:e44dca77adab
|
40 | — | — | — |
|
TACACTTCCGGTCATTAATGACCCATCCCGCCAGTCCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:3b69c7437483
|
40 | — | — | — |
|
GAGGAAGTACCTAATTACCCGGTGGTTAATTACCCTCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:89f1a3f624c6
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTGCGACTTCCGGCGAACCGTAAGTGCTGTGCGCAAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:d431b39f2c78
|
40 | — | — | — |
|
GATAATGTGTGGCGGAAGTGACTAATTACGCCCTGTGACA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:c69d6b8add55
|
40 | — | — | — |
|
TGCACGGACCACCGCGTAAGCAAGCTTCCGGTTGGCTATG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:5495e228cbdc
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGGAAGTACGTCGTTATCGCGACGTAATCAATTAGGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:1a72e31a406c
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGTATTTCCGGAAGCAATTACCGCGAATTGTACTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:19c54f63efb9
|
40 | — | — | — |
|
AATCGATATTTAATGTCTACCTTCCGTCGTAGTCACCCTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:fa61292a3a52
|
40 | — | — | — |
|
GACGATCCTGAGAGTAAGTAGGCGGTAGCACTTCCGCTCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:6afe0bf9d065
|
40 | — | — | — |
|
ACCAGGAATACAGCGATAACGCATTAAAAACTCATTAGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:d5a366a14fe1
|
40 | — | — | — |
|
TCGCCCGATGCCCTAATGGTTATTTAATAGCTTCCGGTGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:13a1569441cb
|
40 | — | — | — |
|
TGACATGTGGCCCGTAAGCCCTGCTTCCGGTCTCTGTCTA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:1e8c5b15240c
|
40 | — | — | — |
|
CACCAACCACGGAAATGCCTAATTGCCATTTAATTAGCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:59cb77cec8e0
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGTGGGACACTAATTACCACTTCCGGCACTAACAACA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:a29e0a5730de
|
40 | — | — | — |
|
AGATCGTTATGGCAGAGCTCTGTCTAATTGGAACCGGAAG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:4f8756b0afe5
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGAACAAACCGGAAGTCATCATCGCGCTGAAGCCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:3815fb9922fa
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGGTATGAATGGCCGCTACCGCATAATTACACGCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:88465144bf0c
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACCTATTAAAAAGCAATTAAGACTCCACTATACGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:011813577402
|
40 | — | — | — |
|
TACTAATTACTAATTAACGTCTGCCGGAAGTACGGCACTC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:3a867acc3f2d
|
40 | — | — | — |
|
CACAAGGACGCGCATTTCCGGTGTAATTAACGATCGATAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:28a4280636ba
|
40 | — | — | — |
|
ACGACTGACGCATTGCTTAATTAGTTACGGAACTAATTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:ee3b20fe09d0
|
40 | — | — | — |
|
CCTACAAGCTGACCGTAAGTAGTTCATCCGGTCACGCGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:aa7197e5e58a
|
40 | — | — | — |
|
GTAAACCTGCATCCGGTAATTACCGTAAGTTGCTCCCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:c89abd71f586
|
40 | — | — | — |
|
GTAATTAACATCCGGCGGAACCACGGTAACGACTCCACCA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:23cdbc827472
|
40 | — | — | — |
|
TTATATGGCCTTAATGACGTCCGTAAGCCTACTTCCGGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:61b50adc93ba
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCCGATTCCGGCACTCATCATTAAAATCTAATTATGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:46e19f662e96
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGTCATTAATTCGTAATTATTATTCGGTTCGCAAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:5b9dc3c6d847
|
40 | — | — | — |
|
CGTCTTGTTCCTAATTACATCTTCCGGTCAACTAATCACT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:c787248faadd
|
40 | — | — | — |
|
AACGGAAATAGCTAATTAGTGTAATTAACACTGAAGCAGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:9addc7f2f6e9
|
40 | — | — | — |
|
GGACACGTAACCTACCGATTCCGGTCCTAACTAGCAAGCA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:6b50fcf37c56
|
40 | — | — | — |
|
CTCCATCCGGATCCAATTAAGAGGCAATTAGCGCCCCCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:f961e7c1040d
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCCCTAATTAGGGCGCATCCGTTGTTAATTAGCCTAT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:8d15e6bcc333
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGGTAATGCGTTACCTAATTACTTCCGAGCCTAATTA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:a557d50ba2ce
|
40 | — | — | — |
|
AGAAGCGGCCTTCCGGTATCGATTAAAAAACGATCAACTA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:1ef083f95fa7
|
40 | — | — | — |
|
CCCTACACTTCCACATTACATTAAAAGCTAATTAACACGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:e2af4c76eb5c
|
40 | — | — | — |
|
AACAACGGTAATTACCGCACAAAGCGCTAATTAACTTCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:61e6e9f68d80
|
40 | — | — | — |
|
TAAAAACCCATTAAGCAGATCCGCTCGCATTCCGGCGACG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:8d8683191931
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACGTCCGTGATTTCCGGTCATTAGAGCGCCGCTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:d1059cd30135
|
40 | — | — | — |
|
CGTCCTAATAACGCACTAATTACTTCCGTCCGACGTTCAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:d044017cfb7b
|
40 | — | — | — |
|
AATACTTCCGGTAACGCTAATTGTGCAGCTAACGACTGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:5eb91168d962
|
40 | — | — | — |
|
GTCCACCAAGGCAATAAACGCACTTCCGGTTATCGTTAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:ea265fb076fa
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTCCGGAGCTAATTAGAATTCAATTAACAATTTGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:ce98caeef4d7
|
40 | — | — | — |
|
CTTACCCTAATTACCTCCGGTTCCCTAACGACCTACGCAA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:0e1948407e6d
|
40 | — | — | — |
|
CAGGAAGTTAATTAACTAGTCATTATGTACCCAATTCTCT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXA2:PRJEB66722:R3:165408acb463
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final