ELK3_HOXD12
CAP-SELEX sample HOXD12_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATCCACATCGATCATTCCGTAAGTTCTCGTAACTTCCGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:bc5ab830fca9
|
40 | — | — | — |
|
CGAATTTCCGCGCGCTGCACGTAAATAAATGATTTCTGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:d5e3b68246cc
|
40 | — | — | — |
|
TGCATGCCCGTAATTCGATAATTCCGGTCTCGCGCTAGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:689c1841f5b1
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTGATCCGTAAGCACTGTTTGACTTCCGGCTCAGCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:1296ac74d49b
|
40 | — | — | — |
|
GATACTGAACGCCAGACCGTAAGCATGGCTTCCGGTGCGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:05834d35039f
|
40 | — | — | — |
|
CAACCACTTCCGTCCGGTTTACAAAACGGTAAGGAAGTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:b2e3d6c37023
|
40 | — | — | — |
|
AGTTATGACCGATAAGCAAGCTTCCGGTCACTATCAGGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:5788fa6b0d52
|
40 | — | — | — |
|
CTATGCGTGAACTGATCCGGAAGTACCTACTTACGCGATA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:548b1cd4d7e4
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGTCACAAGCTCGCACAGTAAGGGTGCTTCCGGTGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:b8cc5bf7ff7d
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGCTTAGTTCCGGTTATAACGCGATAACTTGTTGCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:82cf5f596614
|
40 | — | — | — |
|
TCACTGCTAACCACTGGCCCGTAAGTGATACTTCCGGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:fb256111cf0c
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTACCGGAAGTGGCTTACCGGTAACCAGCATGTTAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:5594514f3ccd
|
40 | — | — | — |
|
CCTCTGATCCCCGTAAGTGTCACATCCGGGCAAGTCGCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:28a6d2a679e7
|
40 | — | — | — |
|
CTGTTGTATGAGCCGTATGCCCGCATCCGGTTCCGACAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:123203e6349f
|
40 | — | — | — |
|
AATCCATGACGGAAGTGAACAATTTACGTCTTGGGTATTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:e4d3c7a4c06e
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTCCTGTCAGCGTAAGTGGGATGCACTTCCGGTGTCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:ded6e66f67b9
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTCCGCGACTTCCGTTGGGAAGAACGTAAGTGTGCGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:331c48e61438
|
40 | — | — | — |
|
CGAAATGTCGTCCGGTAAGTTCGTTAAGACTTCCGGCCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:b267273f5515
|
40 | — | — | — |
|
TACCGTAAGTGAGGACTTCCGGCACGGGACTTGCTTGATG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:358bf79b2f06
|
40 | — | — | — |
|
CTGATGCCCCGTATGTGACCGTGGTTACATCCGGCGATAT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:d7138cf6f5c4
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTCACCGCCGTAACATAAGCTGTGCCGGCTGTGTAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:fc647746c639
|
40 | — | — | — |
|
ACGAGTACCGTAAATATAATGGGATTTCCGGTGCAGTTAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:7aaecac1393c
|
40 | — | — | — |
|
GGGACATAAGGTACGCGTAAGTCGTGCTTCCGGTACCGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:bb26bb4781f8
|
40 | — | — | — |
|
ATTATTACGGGATCAGCTTCCGTAAGTATAGACTTCCGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:3919aea9117a
|
40 | — | — | — |
|
GAGGAGTGTTTTCCCGTAATTCTGGTATTCCGGCAAAAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:25f0cccc88e1
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGCTGTGCCGTAAGTTTGCGACTTCCGGTAGAACCCT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:fb83064b093a
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGTATCAACTACTTCCGGCAATGTCGTAAGTAATTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:b4a90806f94b
|
40 | — | — | — |
|
CGATTCCGACAAGTAGGATACTTCCGGAATGATAATGAGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:f9ceb65e448b
|
40 | — | — | — |
|
AGCATTTGCGACCGAAGGCGTAAGTGTACTTCCGCCCTTC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:e4890218e97f
|
40 | — | — | — |
|
GGCCACTTCCGGTCTTGCGTCCCGTAAGTTGGGTGTTGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:c9ba59ec5314
|
40 | — | — | — |
|
TACTACTCCCCGTAAGCTTGCGTATCCGGGGTCGTAGCCC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:b365e2b8d368
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGGAAGTCTAGAACTTAAGGGATACGCACTTCCGTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:722df5eeb05b
|
40 | — | — | — |
|
CGACGGCCGCTTCCGGTCCTCTAACCGCTAAGCTAGGCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:56f672644749
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCCGTAAGCGCGCCATCAGCTTCCGGGGGACCGTCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:d7df69888aa2
|
40 | — | — | — |
|
GAATGCGTAAGTGTGACTACAACACTTCCGCATATCTCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:38d0f5854dd5
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTAAGTCCGTCCCGTAACAATGGTGTTCCGGGAGATC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:f2c5c744977c
|
40 | — | — | — |
|
TGTATGCCGTTGTATTAGTTGCCGGTTGAAACCGTAAACT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:dd8ab768a28c
|
40 | — | — | — |
|
TAGCAACTTCCGGCGAGTGCCGATAAGTCGGACCGTAGTT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:ae46e1bab3b1
|
40 | — | — | — |
|
GGAGGACGTTCCCGTAAGTAGGATGCTTATGACTTCCGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:7ac083b879c9
|
40 | — | — | — |
|
AGTGGTCGTAAGTAACCTGTGTTCCGTCCGACGGGGGCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:00039841a1ff
|
40 | — | — | — |
|
ATAACACTCTTGGGGCACGTAACTGTGTGCAGTTCCGGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:87ce2b326267
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAGTGGTGTGAGTGCGAAGGTTCCGGCGTAGCACGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:c09f79e79619
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCAGAAACCGAGAAGTAACGATGTCACAGCCGGTTTC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:f3a6692e451a
|
40 | — | — | — |
|
GGACAGGGTTCCGGTCGCGTTTTACGACGCGTAACTGTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:1d06bc038e87
|
40 | — | — | — |
|
CCTTCGCGCTTCCCGTAACCCAACGTGCCGGTAAGCGGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:d142fcb863c7
|
40 | — | — | — |
|
GTACCGTATGTTACACATCCGGTGAATAGGTCTCGGCGCT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:4f57750d9d1b
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGGGGCTTCCGGGATTCAGTTCCCGTAAGTCTTGCGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:805a818cb401
|
40 | — | — | — |
|
TACTTCCGGCACACAACTACCGGAAGTTGCTCTCAGTAGT
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:0acfec17b1b2
|
40 | — | — | — |
|
ACATGACCGGAAGTTACAATTTACGGACTGCGATCGACAC
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:d3ef24e13408
|
40 | — | — | — |
|
CAAGAGCGCACTTCCACCGATAACCTCAGTTCCGGTCTGA
PANAPTA:P41970:ELK3_HOXD12:PRJEB66722:R3:334db425df06
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final