ELK3_LHX5
CAP-SELEX sample LHX5_ELK3; Mixture-SELEX sample LHX5_ELK3 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGGTAAAGCGGATATAGATATACGTCTTTATCTTGACAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:b4c202835cc9
|
40 | — | — | — |
|
AACGTTGTCCTCAAAACCGTAAACCTATTCCGGTGTTTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:a2b614e8e97e
|
40 | — | — | — |
|
TGTGAAATACCGGAAGTCCATGGGAACCGCTAACCAGTGC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:a12e298e80d9
|
40 | — | — | — |
|
GCAAATGCGTACAAGCGTAACTTGAGTTCCGGTACCACAG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:931da2b4d43b
|
40 | — | — | — |
|
AGCCCCCAGGTCCGTAAGCTCAACTTCCGGTCTATATATA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:16ed6a0e3bd9
|
40 | — | — | — |
|
GAATAGGGCCAAGCCGTAAGCGAAACTTCCGGCTCTGAGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:62ad411cc33c
|
40 | — | — | — |
|
ATGTATAATCGCGTAAATCCGGCGTTTTCCGGAAATACAT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:a043a57a3bc7
|
40 | — | — | — |
|
TAAATCCCCACATCCTGACCGGAACAATGCCTGCCGCTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:8241586c5146
|
40 | — | — | — |
|
TATGCCTTTCACGTAAGTCTTCGTTCACTTCCGGAAAGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:ef062bf3509f
|
40 | — | — | — |
|
TACATCCGGCCGTTACCTGGCCGTAAGTCGACCTTTTCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:dde9bca4fa93
|
40 | — | — | — |
|
TCATTGATTGCTTCCGGCGAGTGCCGTAAGTATACCATGA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:dd40d2348d5b
|
40 | — | — | — |
|
TGTTATGACCGTAACCACGGCTCCGGTCGTGAGGATCGCT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:33bc7a50f07a
|
40 | — | — | — |
|
ATACAACCACTTCCGGCGCACCGTAAATGCTGTGCAACGA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:b3338459a01b
|
40 | — | — | — |
|
CCGTATCCGTAAGGTATTCCTTCCGGTAACAGGCGCGCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:fef3a97ff0ec
|
40 | — | — | — |
|
ACACCACGAGATCAGTATAAGTGCACTTCCGGAGTCACGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:28832081c30d
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGGATACCGTAAGTCCAACCGCACTGCCGGTTTCCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:d78ebdbba3a5
|
40 | — | — | — |
|
GGCCAGATAACCGCACATAGCGGTTCCGGTCCCGCGGCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:4f1c1b0d3e46
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCCGAACCGTAAGCTGTGCACATAGCCTCCGGTTGGG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:7a19040d3fb7
|
40 | — | — | — |
|
CCGATAAGCAAATGTAAGTTTGAGTGACTTCCGTTTGTGC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:1be3c675cf79
|
40 | — | — | — |
|
TAACATCAACCGTAACTGCTAGGGTGTGCCGGTTAATTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:28b335fd1c14
|
40 | — | — | — |
|
TAACGGTCGGAAATCGGTTATTTCCGCTGCGTAACGATTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:cd8e933e9b21
|
40 | — | — | — |
|
ATTTTCCGGAAGACAGACCGGGATACTCAACAGAATATGC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:89707ab5d66b
|
40 | — | — | — |
|
ATACCGTAACCGCAGTTCCGGTTTCGCTTGAATTGGCCGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:d52e1307220d
|
40 | — | — | — |
|
AGTCCCGTAACCTGTAGTTCCGGTCCCGCAATAGCACGAT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:4595772a77fa
|
40 | — | — | — |
|
AACAAATACACTATAATGTACTTCCGGTCGGTGAATATCT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:e1d6a9acbb17
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTAAATTACGAGCTGACCGGAAGTCATTATTGCGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:020ea0fe4fc2
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGATGCTTATGGCACGTAAGCCTAAGGCCTTCCGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:3b31d50fae94
|
40 | — | — | — |
|
ATGATAGACAGTAAATTAAGAGTTTCCGGTCGATCAAATA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:a732b5cdff4f
|
40 | — | — | — |
|
CAAACGTAAGTATAACTGACTGCCGTTTAGGGAACAAGCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:2769337619fc
|
40 | — | — | — |
|
GCATGAAGGGATAGTAAGTCTTAAGGGGACTTCCGACCCT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:8f5639caa95f
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGAGTTGAGGCCGTATTAGGGACCGGAAGTGCATTTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:2194a7403291
|
40 | — | — | — |
|
CGGTGCTGCCACTATAGCTAGCGGAAGCCGCAGTAACTTC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:2d64fc9ec7b4
|
40 | — | — | — |
|
TTGCAAACGGAAGTACACTTATCGATTGAAGCCTAAATTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:bb5e76799f5a
|
40 | — | — | — |
|
TTTCCGCCGGAAGCCGAATTGGTATTAGGGTTAGGAAGAT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:8503e2ccff11
|
40 | — | — | — |
|
GATGGCCGGATGATTAGCTTACGGGCTCAAAACGCTTTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:b3daf8d11e4f
|
40 | — | — | — |
|
ATGGGGAATGAATTCCGGTCTCCGCTGTGACCGATAATTG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:7462be3a3453
|
40 | — | — | — |
|
TCCTAATCGCGGTGACCGTTAAGCACTGTGCTTCCGGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:4ad18570b989
|
40 | — | — | — |
|
TTACTTCCGGTGTTCCGTAAGTACGAGCTTACGTTGGGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:00204d85afdd
|
40 | — | — | — |
|
TAATAGAAGGTAACGCTTCCGGTGCTGGTCGTAAGCTTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:9d5d52bc7a1e
|
40 | — | — | — |
|
GATTCCGTCAAGCGATCCGTAAGCGAACGCCTCCGGATTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:1032734ffd51
|
40 | — | — | — |
|
ACCCTCCGTTAATTAGGTGTAACACTAACTTAGCCGGCTC
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:bc1c992abd53
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGCTCACTAGTCATCGATAAGTATAACTTCCGGTGA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:4bf74542059d
|
40 | — | — | — |
|
CGCCACTTCCGTCTTATCACTGGCGCAGGCGTTCCGGCTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:93a2574361d9
|
40 | — | — | — |
|
GAGCTAGTCAGCAGTAAGTTGTGACTTCCGGTGACACGTT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:defcea7b147e
|
40 | — | — | — |
|
TACGCCGCACGCACCGGAAGTTTCATCTACTTCCGCGTCG
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:f885b080c25e
|
40 | — | — | — |
|
GCCCGCCGGAAGATAGAGTGGTTACCACCTCCAGCCATTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:98892f0ea2cd
|
40 | — | — | — |
|
TCCACCGGATATAGCATCAAATCGGTGTGGTCATAGTCAA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:07ce3f638552
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAGTGCGCAATTGTACCGTAAGTCGGTACATCCGGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:bea772299889
|
40 | — | — | — |
|
TATGTCTTCGATCGAATGATTAACACGTAACCTTAATCAT
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:5d3c59349079
|
40 | — | — | — |
|
CGTAATTGCCCTAACACTTCCGGTACGGACCAGCGTAATA
PANAPTA:P41970:ELK3_LHX5:PRJEB66722:R3:97af1b840337
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final