ELK3_MSX1
CAP-SELEX sample MSX1_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AACACTGTCCACCGTTAAGTTGCACTTCCGGTGCACCGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:b368732dd8b2
|
40 | — | — | — |
|
GATTGTTTAGTAACCAACAGGGTTCCGATACAATGCAGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:db4e7f011075
|
40 | — | — | — |
|
TAGCGCTAGCCGTAAGTCCTGACATTCCGGCAAACGCGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:bd2ce6024630
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCTAAACCGTAAGATTACGCGTCCGGTTTATGCGTTT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:88e4c42140e7
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGGTGGCCGTAAGTTGACATCTTCCGGACATGCGTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:08df525f8492
|
40 | — | — | — |
|
GGGAGGAGAATGCCAGTAAACGTTATTTCCGGTCAAGTGA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:b44cfac20185
|
40 | — | — | — |
|
GCCGGACCGGAACAGACAGGTTACGGGACAACGCTCTACC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:787ee28fc925
|
40 | — | — | — |
|
TGATTCCCGTAAGTTGGGTACTTCCGGTTGCTTGGTTGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:1ace9818d226
|
40 | — | — | — |
|
CAATGCAGGGACCGCTAAGTACTCTTGTACTTCCGGGCCC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:500959facc99
|
40 | — | — | — |
|
TTGACAATGCCGTAAAGTTACAGTACCTTCCGGCATATCC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ce1599c3e49c
|
40 | — | — | — |
|
CTTGTGTTCGATACTTCCGGTGGAACAGGAAGTCGTGTAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:d18c3b115d00
|
40 | — | — | — |
|
GAGATGAACGCGTAACCTCAAGGTGCCGGTGTGACATCAT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:2e7dc3af29da
|
40 | — | — | — |
|
TACGTACATCCGTAAGTACACTTCCGGAAGCGCCTTCCGG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:b00c033d4639
|
40 | — | — | — |
|
TGATGAAGAAGATGAACGTAAGCATGCATCCGTTCTCGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:3f3636cbcf7b
|
40 | — | — | — |
|
GCATATTAATCAGTAAGCCAGCTTCCTGTTGTAATAAAAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:dd7ca2d05a06
|
40 | — | — | — |
|
TTACAGTAAGTTACATACGAACTTCCGGTGCCGAGGTAAT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:3348e8dd85e7
|
40 | — | — | — |
|
GACGACCGGATGTGCAACATACTGGCCTACCCAAACGAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:880b247decf8
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGACGCGTAAGCTTCCAGGGTCACTTCCGGTCCTCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ba06bd8c64ad
|
40 | — | — | — |
|
GGTGTCCGGCGAGTAGTGACGTAAGTTGTAACTTCCGGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:9857fa5ac668
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGTGAGTGCCGTAAGTTTAATTGACATTCCGGCCTCG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:64ba993f2848
|
40 | — | — | — |
|
GACGGGGATGTCTTAAGTAAGTGACGTATAACTTCCGTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:a6883082dbac
|
40 | — | — | — |
|
TACAATCGAAATGGCGAGAACTTCCGGTGATCCGTAAGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:8e1ad6768966
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCTTCACCGTAACTAAAGGGAGTAGTTCCGGCTAATG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:38d704b7a68e
|
40 | — | — | — |
|
GGTGATTATGCCCGTAACAACGTGTGCCGGGCAGATAGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ac3a9cd2ce30
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATACACGGTAATTACCTTAATTCCGGTATACGGAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ff3e4c7218bc
|
40 | — | — | — |
|
GATACCGTTAAGCTCCGCTTCCGGTAAGATATTTGAGTGA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ee698a56e230
|
40 | — | — | — |
|
CGTGATTTGCCCGTAAGGCTAGACGGCCGTCCGGTCACAC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:d6c9f1bd9c48
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTCGACTTCCGGATTATCACGTAAGTGGTCGACTGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:f10326a49a5f
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGTTTACTTCCGGTAAGCTTTGTGTGCCCACCGTAAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:e9963d0561e1
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGAAAACCGATAAATTAGATTTCCGGTTCGCCTCCAG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:242ba3bdc160
|
40 | — | — | — |
|
GGTATTTGCAGACGGCGCACGTAACACAATGTTCCGGCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:c14790c22e0f
|
40 | — | — | — |
|
AGTAAGTGTATCGTATTAACGTAAGTAATCGGACTTCCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:7f7d3b8f9456
|
40 | — | — | — |
|
TGAAATTACGGCGGAAGTGCATCCGGTTCGTGTTTAGGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:7879c97e2018
|
40 | — | — | — |
|
GACATACATCGCGTAAATTAACTCACTTCCGGATGTACAT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:58b1235b606e
|
40 | — | — | — |
|
CAATGCCACACAGCAGTAAGATCACTTCCGGCCGCGTTGC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:38d47c766517
|
40 | — | — | — |
|
TGGAACGTAACTTAACGAGCTCAGTTCCGTTCCACGAGTT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:a09397fa205a
|
40 | — | — | — |
|
GATACAGCCGGAACTGAGATCAGTTACGGAAGGAAACGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:f8819ec5d66e
|
40 | — | — | — |
|
TCAAGTCCGTAAGCACCAAGTTGCTGCCGGACGTGTTGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:acadd543f6e6
|
40 | — | — | — |
|
CACCAGCACGTAAGTGTCGGGCACTTCCGGTGACAACGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:9513ea1bb368
|
40 | — | — | — |
|
TTGAGCCGTAGCATCCGGTGAAACCGTATACTCCGGTTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:5d147723bbe5
|
40 | — | — | — |
|
CGTTAGTTATACAAACACGTAAGTTAGTACTTCCGGTTTG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:13a551a9876f
|
40 | — | — | — |
|
GGCATACCCCGTAAGCTAACTTCCGGGATGCCCTGGCGCA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:ab0507cdf4e1
|
40 | — | — | — |
|
GTTTGACCCGTAACTTGAAGTTCCGGCTCGAATATAATGT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:5dd8213c6ad3
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCGTACGTATTATTACGTCCGGAATCAAGGCTAAGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:91abe7a15df6
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACACTAAGATCACCCGTAAGCTAGCATCCGGGAGTC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:dcd65103a183
|
40 | — | — | — |
|
GAGATCAAATCGAACCACGTAAGCATGCTTCCGGGGTAGT
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:61bb16b3114c
|
40 | — | — | — |
|
GGTTACTTAAGCGATAAAAGTGTTTTCCGCTGTAAGTAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:beb70fc1cf79
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCATCTGACACCGTAAGCCTCGCTTCCGGTGGCCCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:957b32879ce5
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTTATGACGTAAATTAGATTGCCGCATAAAAGTGAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:c8e4152bc634
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAAATACCGTAAGTACGGGTTCTTCCGGCGGTGTGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_MSX1:PRJEB66722:R3:2214c94131d5
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final