ELK3_PDX1
CAP-SELEX sample PDX1_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGCTATCATACCGTAAGTCCACACTACTTCCGGTACAAGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:5858847db917
|
40 | — | — | — |
|
GCCCGTTATGCCGCTAAGTGGACCCTTCCGGTATAACGGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:4c5028c7b511
|
40 | — | — | — |
|
GGCGGCCAGACATACGACGAAACGTAAGTTACCACTTCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:e5699aad2cb1
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCGCCCGCCGTAAGTAGGTGACTTCCGGTTTTCCGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:7374162426cc
|
40 | — | — | — |
|
TAGAGATATAGGCTGAGATTACGTAAGTTAATTACTTCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:3acf24eee004
|
40 | — | — | — |
|
ATGGTACAGTATGTACTTAACGACATCCGGTACTATCCAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:fdd5bb3f864f
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATTCCATAACACGTTAAGAATACTTCCGGTTCTGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:185de043c0c5
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTTAATACACCGTAAATTGAGACTTCCGGTTTTGCAG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:c7822c763eb9
|
40 | — | — | — |
|
TTACCGTAAGTGCACTTCCGGCGTGAATGTGCAACTATAT
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:cf26dcbcd419
|
40 | — | — | — |
|
ATCGTGAAGAGGACGTAAGTACGTTTACATCCGCCCAGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:669c4802859f
|
40 | — | — | — |
|
TAAACTACAACGTAAGCTTGCTTCCGGTAGCCACTGCGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:1578e37b6fab
|
40 | — | — | — |
|
TAACAAGAGCACAGCTCGTTCCGTAAGCGCGCTGCCGGAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:f69c23670d43
|
40 | — | — | — |
|
GGTGACGCGTAAGTTTATTCACTTCCGGCCAATGCTCAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:62262c46b715
|
40 | — | — | — |
|
AACTGTAAGCCGCCGTAAGTATTAACATCCGGCGACGTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:cde90ff3b8f5
|
40 | — | — | — |
|
TTAACCGTAAGTAACGAATTACATCCGGTAAAGGTAATCC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:a9ad062ccfa5
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGTCACGTAAGTAAAATGGTAAAACTTCCGGACTTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:366d298762fa
|
40 | — | — | — |
|
ATTCCCGATAACCTTAGTTCCGGCAACACATCACTTATGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:983c559269d3
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGTAAGTAGACTTCCGGCGCAACCGATGAATTAACTG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:c0e2ce1473e5
|
40 | — | — | — |
|
CCGGGTTAGCCGTAACTTAACCTGAGTTCCGGCCTCATGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:7b4aecd2ba36
|
40 | — | — | — |
|
GATTTCCGGGATACCCGTTAAATGCTGTTCTGTGTTAGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:83e7c0c6fe61
|
40 | — | — | — |
|
CACGCTTGGTGCTCTACGTCGGAAGTCCACTTACGATGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:6045e111baf1
|
40 | — | — | — |
|
ATTCCGGTATAACCGTAAGTAAACTGCTGGAGATGTGTTG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:116867a41190
|
40 | — | — | — |
|
GCTACTTCCGGCAGAACCATTGTCGTTCTGCAGTAAGTAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:e6c914728f22
|
40 | — | — | — |
|
ATTGACGTAAGTTTCCACTTCCGCCTAACAGGACCAGATT
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:8f7a5c4755c0
|
40 | — | — | — |
|
GATGGCGCAGTAAATGGTTATTTCCGGCATCATATTACAC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:5da895990cf8
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCTACCAACCGTAAGCACTTATGCTTCCGGCTTGCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:c3fd81b6f389
|
40 | — | — | — |
|
GTGGAACGTAAGTGCAGTGAGTCACTTCCGCCCAAGGCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:df4a7f3b7b52
|
40 | — | — | — |
|
AGCTTCCGATGTAATGCGTAAGCTGCAAATGATATGCGTC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:5d4fed6a8dbc
|
40 | — | — | — |
|
CATAGTATCCGTAAATTGTATTTCCGGAAGCAGGACTCGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:a07cdbf1384b
|
40 | — | — | — |
|
GTACCAGCCAGTAAGTAAACACTTCCGGGCAATGGGCGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:90a9151193e8
|
40 | — | — | — |
|
GCCCACATCACACATGCATCCGGCAACAGCCGTAAGCTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:3ed2f0aa1b4b
|
40 | — | — | — |
|
ACAATGACCGTAAGCTAACGACTACTTCCGGTCCAGATGC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:190fc92b43b9
|
40 | — | — | — |
|
AATGTCGCACTTCCGCTTACGGATGACACCGGAAGCTGAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:b50bbc787284
|
40 | — | — | — |
|
CGAGCCCTCCGCCCGTAAGTTAATGCTAAGAACATCCGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:5bfc0dfb0c8d
|
40 | — | — | — |
|
AGAACTGCTTCCGGTACGTCACCGACCCGTAAGCAAGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:a89c0cde5fff
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTAAGTGGACTTCCGGGAATCGCAAACTACACGTAAA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:33aa98aeddb7
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCACACCGTAACAACAGTTCCGGTGCGGTAGGCGCAC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:7f9eb1efe954
|
40 | — | — | — |
|
GATCGAGGAAGCTCAGTAAGCAGGCGTTCCGGAGCTTATT
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:30073af983a8
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGCCCGCTAAGTCAATGGCTTCCGGGCCAGACCGCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:fe59fac94495
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTACTTCCGGTTAGAAAAAAAACAGGTAAGTAAGTGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:dc403e05f843
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCTTCCGTAAGCTTACTTCCGGACCTCTACTAATTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:eb3d64998ac5
|
40 | — | — | — |
|
AATACGGACGTGCCGTAAGTGGCTCTGGATAACTTCCGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:b2ce44927e2d
|
40 | — | — | — |
|
GGATATGAGGCTTCCGGCCCCGTCAGTAAGCCCAATGTCG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:ba5ed9be434b
|
40 | — | — | — |
|
GGCTAGCGCTTTCCCGTAACAACTTGTTCCGGCAAACGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:dde64820562a
|
40 | — | — | — |
|
TGTGAGTAGCGAACGATTCATGCGTAAGTGTGACATCCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:5b2d99de401d
|
40 | — | — | — |
|
AGGCGTAAGTTGTTCAACTTCCGGTCGAGAACCAACATAT
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:831eefea8d82
|
40 | — | — | — |
|
GAGCGAAATCCCGAACGTATGTATGATGACATCCGCTCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:e998fb38cc9b
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTCCGGCCCTATCAAGGGCACGTAACTGAGCCCCACA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:d8e9ebd5e724
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGTTACGTAAGTTGTGGATACTTCCGTTACAGAGCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:9abd1123bb4c
|
40 | — | — | — |
|
GATAAACAACTTCCGGTACAATTACCGTAAGTGCCGACGG
PANAPTA:P41970:ELK3_PDX1:PRJEB66722:R3:d515bfc47f28
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final