ELK3_RFX5
CAP-SELEX sample RFX5_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCGCCCCACGTCGATTTACACCGCGAACACCGGAAGTGGG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:f84e2342be41
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTATTGAAACCCCCAGACTTCCTGTACGCCGGAAGTC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:f8def0556115
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTCCACTAAATCATTTCCGGTTCACTACGCCACCCAT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e52f0aaa957c
|
40 | — | — | — |
|
TATGTCTGCAACTAATTACGCATGACTTCCGGTCTAGCTG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:5bf2d0f854f5
|
40 | — | — | — |
|
CCGGACCGCACTTAGCACCGGAAGCCGTGCTGACAATGAT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e1b791554332
|
40 | — | — | — |
|
AAATCAAGCTGACAGACCGGAAGAGCTGAACTTACGGACT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:7e96c866fa36
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTTACCGGAAGTACGAAAATTCAGCGTACCAATGCTA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:942b56542fe3
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCGGAAGCGACACACGTAAGAAACATAGCTATTGATA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:5e1400982f11
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTCTTAAAGGTGGCACCGGAAGCACTAGCGTTAACAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:0e955b13acb3
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAGGGATCACACTTCCGGTTCCCGTATCCATGCATAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:0be5ab7036b1
|
40 | — | — | — |
|
AGGCACTTCCGGCAGGATGCGCGCCAACACGCGCTGGAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:abbbbe2fed31
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCTATGCATGCGGTAAAGACCGGAAGTTAACATGCTA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:13f347d0c176
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCCCCACGTCATAACTAAATGGCTAACTTCCGCTCCT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:9e6d1a4e7220
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGCTGAATTTTCCGTAATTGTGAACTTCCGGTAAGCA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:1c7d3473572d
|
40 | — | — | — |
|
CACGAAGTGCACGCGTAAGTTCGAAGTGGACTTCCGGTTA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:b3a35ccb565a
|
40 | — | — | — |
|
CACAACTATATCCGGGTAATAGCAGGAGCTAGCTTCCGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:07706224e33c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCCCGTCGGAAACAAATCATACCGGAAGCATTTCCCT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e2d60e976480
|
40 | — | — | — |
|
ACAACACCGGATGCGCATAGGACTTCCGTTTAAGCTCGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:3c39d5491820
|
40 | — | — | — |
|
CAAGAGCAAAGTTCCGGTACGCCATCCCAATCCGGAAGTA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:7672f40d5617
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGCATACAGTAAGCTCGCTTCCGGTACGGCATTGGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:fea330a7cf16
|
40 | — | — | — |
|
CCGGGTCGCGACGACAATGGAACTTCCGCCATTTATCGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e0e8ab271179
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTTAGCCTCCGAGACGGAAATCAGGGGAGCTACGCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:0a0e09306ed3
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCACTTCCGGATGCTCGGATAAGGTTTGACCGATAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:144df045cfdd
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGAGGCGCGCCAGCCGGAAACTGGTTAGGTCCCTT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:a25016c80611
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTCCGCACGGAAACAGAAAACTAGACATCCGACTATG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e7f26a814b73
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTCCGGATGAATACTGCCTGCTTTACGCACCTCAGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:7fa58e0705be
|
40 | — | — | — |
|
GATGCGTACTTCCGGATCGAGTATCTGTCGTAACAGGTAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:8cc118e8c79c
|
40 | — | — | — |
|
AGAACACGCACGTGGATCCAGTAACTTCCGGTCCCCAGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:cca715d5729f
|
40 | — | — | — |
|
AAGACCGTAACAGCTAACACCGGAAGTAGAGCGATACAGA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e1105ce22fcc
|
40 | — | — | — |
|
AGTGACAAGGTCGCAGCGTTACCTATTTACCGGAAGTGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:b39a3f33db49
|
40 | — | — | — |
|
TCAAATACTACCGTAAGCCATTGCTTCCGGTTGTATGGTT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e58f957e0540
|
40 | — | — | — |
|
CTAATCGGAAATAAACCGGAAATAAATCAAGTCAGGCCGA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:49d21a247859
|
40 | — | — | — |
|
TACTCAATTTCCGGTGAATGCTAAGCAAAAAGATAATCAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:0041c1c20a21
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGTAGTCAAGGTGTCCGGATATCCGGTTTATCTTCCG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:188cbc91250c
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCCGACCGTAAGCCGAGGCTTCCGGTTTGTAAGCAC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:a5a6b0d558b4
|
40 | — | — | — |
|
TTGACTCCGTAAGTTATACTGCCGGAGACAGTGTCTAGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:8c3bb647ef35
|
40 | — | — | — |
|
CCCAGCCACTGATGGTCACTTCCGCATCCACCGGAACACG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:9b7d6a5f8782
|
40 | — | — | — |
|
GACGAGTGGCCGTAAGTTGTCCACATCCGGCACGCGGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:f938bbad22d3
|
40 | — | — | — |
|
GTTGCACGGACTTCTGACGCGTAACATGCTGTTCCGGTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:2ac13a2bb55c
|
40 | — | — | — |
|
CCGAACAGCCCTACCGGATGAGCATCGCTGCTTCCGGCAG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:7ad5ffb43f87
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACGAACAGAGGCTGACTTACCCTCTTCCTGTAGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:6d263c30503d
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTTGATGATCCTAAGTTTATCGAAGAGGATGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:5e9e0811d6c5
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCTGGACCGTAACATGAATGATTCCGGTAGTGCTATG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:5d2f974b1760
|
40 | — | — | — |
|
GCCAACTTCCGGCCCCGTAGCCAAGTCACATGCCACCGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:e4a73a4d1478
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTGTGGCATAAAACTTACGCGGGGACAGCTTCCGTAG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:86c2c09ac739
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTCTCGCGGGGTATGCCTCTCCTTGCAGACGGAAGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:32793b27a828
|
40 | — | — | — |
|
CCACTTCCGGACTGTCATACCGCGCTCTTCACATAACGAG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:867b026cdf0f
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTGCCACCGTAATGAAGTTAGCTCTGGAGTGATCATT
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:795698cb3e98
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCCTAGGAGGACGTAAGTTCCACGTCTGCCTCATCGC
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:cda7c9a8735e
|
40 | — | — | — |
|
GACCGGAAGTCATGCGTCCTCTGAAACTGAAGCGTGTTGG
PANAPTA:P41970:ELK3_RFX5:PRJEB66722:R3:c963505e6f49
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final