ELK3_USF2
CAP-SELEX sample USF2_ELK3 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TCAAGCGCAGCCGTTAAGTTCACTCGAAACTTCCGGCAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:c3d43d4f3e1b
|
40 | — | — | — |
|
TTACGCTCGCCCGTAAGCAGCGTCCTTCCGGGCTCGGTTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:1b6d4efccc86
|
40 | — | — | — |
|
TACTCAGATCCGTATGCGTTAGACGCATCCGGCTCTGGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:1f790aad575c
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTCCGGCGGAACTCATCACGTGACCTCGCCTTCCGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:f8129b1eb163
|
40 | — | — | — |
|
TTTACTCGATAAGTGGGACTTCCGGTATAACACAGTCGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:83c4f60503dc
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTACTTCCGGCGTCGCCATCACCGTGTCACGTGCCAT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:e4bb7a88b0ec
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTTAGCACTTCCGGTCACGTGCTCGCATTCGTCCACC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:f28b43c31ead
|
40 | — | — | — |
|
GGATTATTACCGTTCCCGTAAGTTCATACTTCCGGGTACT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:be6e1c17cff7
|
40 | — | — | — |
|
TCCCAAAGCGACGCGTAAACAAGTATCCGGTCGGACAGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:c6620c18b9f8
|
40 | — | — | — |
|
TAGATCACGTGATCCACTTCCGGCCCTAGGCACGCTGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:03ca6cf341e2
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGCAAACCACGTGTTTTAGCAACGCACACTTCCGGTT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:9bb26725831e
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCACGTGACGCACCCCCACGCACCCACTTCCGCCGGA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:608387b0021f
|
40 | — | — | — |
|
GAAACGCGCCAAGCCCACGTGTCACGTGTTGCTAGTTGGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:a65b18c4cb75
|
40 | — | — | — |
|
CGACAGGGGACTTCCGCCTATTTGAGGCACGTGACTCTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:1753d86a5b5f
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCACCAGTAGCACGTGACGTCCGAACCGGAAGTCAAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:757eb8ee0e56
|
40 | — | — | — |
|
TCGGACACCGGAAGCCATCTTGGCACACGTGACAGGCAGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:d8d32716f32e
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCACCGGATGTGCCCATACCACGTGACTTTCACGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:6f56c060210c
|
40 | — | — | — |
|
ATGAACTTCCGGTCACATGAAGACGCGACCCCCACGTGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:0beaa481de73
|
40 | — | — | — |
|
AACGAGCGGAAGTACTATGCCACGTGACCCGTGCTCGCCA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:785a98e2eced
|
40 | — | — | — |
|
CCCACTCAGACTTCCGGTGGGGCCCGTACCGGAAGTGGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:27366dcf795c
|
40 | — | — | — |
|
CTACCGGAAGTGAATAGGGGTCACGTGATTCCCCTCCTAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:af4049dc7ea9
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTGCAGTTTTGCAGCACACCCCACGTGACCCAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:67eb2cdce20a
|
40 | — | — | — |
|
TCGATCCGTAAGGGCTACTGATTATCTCCTTCCGGAGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:52243852cd1f
|
40 | — | — | — |
|
TACGAGTGACTTCCGTCCGCAAATCACGTGACCCTACCAA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:97e15a1c85bc
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAATGCCACTTCCGCTCCCACGTGACGTACTTCCGAT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:7dfd9c6f693e
|
40 | — | — | — |
|
TTCACGTGACATCCGGTCGTTCCCTATACTTCCGCCGGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:af4dd512ada8
|
40 | — | — | — |
|
GAACCATCGTTACCTAAACACGTGACATACTTCCGGCGCG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:026f34a021b4
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTTTACTTGACACGTGACCATTTTTCCTATCGAACAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:070c76776097
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACGTGCCGGAAGTTCAGTAACGGCGAGGACACGGGT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:e0af6b4002d1
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCAACTTAACGCTTCCGGTCTCCCACGTGACGCTGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:8250dbb91d47
|
40 | — | — | — |
|
ATTAACGGAAGTAACATTCGACCTAACGAATCACCACGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:9ff8c6bec10e
|
40 | — | — | — |
|
TACCACTTCCGGCATTACTCCTGTCCGGTCGCATCACGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:4583ee353dea
|
40 | — | — | — |
|
GACTATAGAGCAGTATGTAAACATCCGGCAAGTGCACCCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:984cc85b67ab
|
40 | — | — | — |
|
CTGACACCTCCTGACTTCCGCTCACATTCTGTGTCACGTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:3637504a7e65
|
40 | — | — | — |
|
GAAATGCCTCCATGACACTGACACACGTGACCCGTGCCTT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:7ce72cf605f7
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGCAGATTCCGCTTACCTAACAACACGTGACGTCTCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:533d9c53fcff
|
40 | — | — | — |
|
AATAATCAGGCAGTATGGTTTCCATAGCCATCCGGCCTGT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:c581cd87c190
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCACCGCGTACTGCAATGCGCCGCCGGAAGTACGACA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:6a1b6428cf3b
|
40 | — | — | — |
|
ATCAAACCACGTGTCCCGTCCGTTACTTCCGCTTCTCTTC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:072f67f7f331
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTGCTGGAGGTCCGCCGGACGTCACGTGATGGATCTG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:876d15545256
|
40 | — | — | — |
|
AACACGTGACCTGCTTCGTACATCCGGTGTACACCAATGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:6b8ebacfc2bb
|
40 | — | — | — |
|
ATGCATTGAAAGTAAGTACAGTAACTTCCGTCCAACCACT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:644209504bac
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTAGATCACGTGACTTTGTTGAGTTACACACAGGTCA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:ea1281fa7cb6
|
40 | — | — | — |
|
GCATATCCGATAACTTTCAGTTCCGGCTTGCTAACAGATA
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:fd3a090c443c
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCCGCTTCCGGCCTAACAATGTCACGTGCTACACGAT
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:598229b484a1
|
40 | — | — | — |
|
GAACTAGCTTACTCCCACCCGCAAGTCACGTGACACACGC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:fdfbc3ea723a
|
40 | — | — | — |
|
AAGCGGAAACTGGAAGCACAATGCAACTGTAGCACGTGAC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:b593513d277b
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACACTTCCGGTCCCCTCCTCACGTGGTTCCTCAGCC
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:af2fc8932a57
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTAAAACCTATCACGTGACCGTTGCCGTGTTGCAACG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:db828ec4b8e6
|
40 | — | — | — |
|
TGAAACTTCCGGTCACGTGTAACCTCGCACGTACCACATG
PANAPTA:P41970:ELK3_USF2:PRJEB66722:R3:d1c6d0ffc85b
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final