ERG_FOXK1

CAP-SELEX sample FOXK1_ERG · 1 runs in PRJEB66722

Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000

Top enriched selection-pool candidates

Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.

Candidate data via API →
Candidate sequence Length log2 FC Class Monotonicity
CCGGATTGCATGTTTTTTGACAGTAGTCCTCGCAATGTGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:12c60b4aca0b
40 — — —
TTTTAATCGCTAATGCCTGCTACAGACTACTTAGATCACA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:389cc74faeb6
40 — — —
ACGTGTGCCGTAAGGTGAGCCAGCCCTTCCGGCATCGGCT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:d9ac87e5ddde
40 — — —
GCTTCCGGTTCGTTGATCGAGCACCGTACACGTAAGTATA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:408f96258c2a
40 — — —
CTGACGTATGGCAACAGTAAGTGAACTTCCGGTTGCTCTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:4dc3eb0492d8
40 — — —
GGTACTAAGGCTACAGCGATGACTAGACCTAATTCAAGCG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:ef5f6d9e78fe
40 — — —
ACCGGAGACGATACCGGAAGTGGTAAACTTACGTGTGTCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:43fda3e17a9a
40 — — —
TAGCCACTTATCAAGACCCCACTAGTACCCATGGCAACAC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:85c00bb46b48
40 — — —
TCTGATGGTGTTGAACTACTGTTTGAAACAGAGTGAAAAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:64b2f1e26385
40 — — —
GTCTATTTTCCTGCACGGGACTTGAGGCCCGGAGCCGAAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:ad4e3beb1d95
40 — — —
ATAAGTGTAACGGAAGCAAGCTTAGCGTTACTTTGTCCAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:4e336761a1f0
40 — — —
TTCCGTATGTTTAGGTACATCCGGTATGACTATCCGGGTG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:5a0e09fe89bd
40 — — —
CCACAGAACCGTATTTCCGTTTGTACACGTAAATCCGGGA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:fee55fbd840f
40 — — —
TACGAAAAAGCTCAATAATTGGACATTTACAGCACGGTCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:8cb4186c28c3
40 — — —
CACAAAAACGTCACAGGAAGTCGCGACTGCCGGTGAGCTG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:af16a53f5e3f
40 — — —
TAGGTAACGTAAACTACACCGTAAGCGCAACGCATTCCGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:56186f61d58f
40 — — —
TACAAGACCGCTAATTCTCATCAACTCCCCCCCACCTCCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:4100de715e99
40 — — —
CTTAGAGGACCGTAACTGCGGTCACTTCCGGTCACTCTAT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:4fe032f0fa55
40 — — —
CGTTACTTTCAAACCAGAGATGTCGCGCAACTGACTACCT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:8afe3df9aa5c
40 — — —
TCAACACCGTAAGCGTTGGCATCCGGTGTGGTTCCCCTCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:d1ec41dafcba
40 — — —
TCTCAGGTAGATATTCCATTTACCACGCGGGCTTATATCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:6af70fc161d4
40 — — —
GACGAGACCGGAAACTGCGCTTCCTTCCGGCATCCACGAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:456ca8628e14
40 — — —
CTAGCCCATCTGAACCGAATATGGACCTGATTCTGTATCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:216c477d2e22
40 — — —
GCGCATACCGTAAGTTTTTACTTCCGGTTCTGTCGCGGCA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:8f794f27a3f2
40 — — —
ACTGCGTGTACACGGCAAACCCAGGGTTCCGGCACAGCGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:3ad77b460411
40 — — —
ATGTCATGCACAGACCAGTAAGCAATGCTTCCGGCTCTGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:18cdcdb0f10f
40 — — —
GATGTAACCTTCTTACATCCGGCGAAGCGCGTATGTCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:e450d3fe9b50
40 — — —
TTGACCGGTAAACTAACTGCGTTTCCGGTCGCCGACGGGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:a341fe40b4fd
40 — — —
TTCACCCTGTCATTAGGTTTGCCTGCGGAGGAAACCTAAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:e0c2dcc0bc10
40 — — —
CAACCAAGTTCTGCAGTCAACCACCGCGCATTACAGCGTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:cf95a383841b
40 — — —
CACTTCGTCCGCCGGAACTAAATTTATTTCCTTCCGGCGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:942ba10ec5d3
40 — — —
ACGTCTACCGTAAGGGCCCTTCCGGTTTACTACGGAGGAC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:b9917a0ee6b3
40 — — —
AGAAAAACAGGAAGTAAACATACACCTTTCCTTCCGGTTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:252fdfbc4ff9
40 — — —
GCACTTGCGTTAACATCATCCCGTAAGTGATAACTTCCGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:6ba884fee9d4
40 — — —
CCAATTTGCCATCACCGTAAGCGTCTAAGCGCATCCGGTG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:9e23cd372ec8
40 — — —
GCCTAGCCGTAAGCATGCTGCCGGCGGGCGGCTAGATAAC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:eb272c467953
40 — — —
AAGTGATGCCTCATTACAGGATGTTGACATCCGGCGATGA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:03ee1b7f5d0a
40 — — —
AGCAGGAAGTGAACCACTTCCGGCAGATCGGCGAGCACTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:7d8985edff3e
40 — — —
CTTATGTCGCACACCGAATGAAGCCCGATGTAACACATCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:613b447f9dc2
40 — — —
TACACTACCGGAAGTATACTTCCGGCAATGAGAGTGTACC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:70689c227e54
40 — — —
ACCGTAAGCCGCGCTTCCGGTAGGACAACCCGTCCGTAAC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:f6d66d457c37
40 — — —
ACGTGTGTATAACGCGAAAGTGCACTTCCGGTAGCGAGCA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:b19ade8c53b5
40 — — —
AGTGTAAATCTCACGCTTATACCCCAACTCTTCGCCACTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:453bbebed0f8
40 — — —
CACCGGAAGTAGCTACGTCCGGTGGCGAGACGGACCATAT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:540941a21e38
40 — — —
TTGCACGCGTATATTGACATATCCGGTAGCCCCGTTGCAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:959efe5385e7
40 — — —
CCATCTCCGAATTCGTCTGCTACCAGGAACTAAATCCCGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:0cb29b747f3e
40 — — —
TCGCTCTGGCAGGACCGGAACTGTGGTTACGGTCTCTGTG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:79b3b8923d2f
40 — — —
CGACGCTTGCTGGCGTTCTCATTCAAGGCCAGCCCCGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:efb04dc79591
40 — — —
ACCGGAAGTAGACTTCCGGTATAAACGCCACATGCCCAAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:265067f5c16b
40 — — —
CCTTCCAGACAGGAAATTATGCATTTCCGGTGCTGCATGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXK1:PRJEB66722:R3:ee21e7d25a74
40 — — —

SELEX rounds

R3 ·final