ERG_FOXO1
CAP-SELEX sample ERG_FOXO1; Mixture-SELEX sample ERG_FOXO1 · 2 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GTGACAGTAAGTGGATAGCTCACTTCCGGTCCTTGACATA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:cefb945d1dce
|
40 | — | — | — |
|
TTCAACCGTAAGCGCGCTGCCGGTTGCCTATGTCTCGGCA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:4c45ce98eb4c
|
40 | — | — | — |
|
GATGGTCACCGCGTATTTCCGGCCATCGAGCTCGTAAATC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:005e1d2af5d8
|
40 | — | — | — |
|
GAGGGCAGCACCGTAAGTCCACGTACTTCCGGTACCTATA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:3361fc9e6e34
|
40 | — | — | — |
|
TTCCTCAAAGCCGTAAATACATTTCCGGTTTGTGTCGTCC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:72ddba92f61d
|
40 | — | — | — |
|
ATACACACGTATGTAAGTAGGTAAACATCCGGTGTAGTAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:1b0bb65ec1e6
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTATGTCCACGGTAAGTACAGTCTTCCGGCGGACATC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:7f9a64a4e47f
|
40 | — | — | — |
|
AGGAGCATAACTGCCATACCGGAAGCCTGCTTCCTGTATC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:9282d6ca7310
|
40 | — | — | — |
|
CCACACAGCGTAAATAGTGCATAGCGTCCAGCACCATTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:9749fb9679db
|
40 | — | — | — |
|
CGTCCATGAAGCGTACAGTAAATTTAAATTGCCGGTACGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:3093ee0a8b76
|
40 | — | — | — |
|
TGTGACTTCCGGAATGTGATTCTGTAAGTAAATAACCAAC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:3f0f1c21befb
|
40 | — | — | — |
|
CAAGCGCACAATCCGCGGATAAGTATACCACATGGTGCCT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:d7f3c883e533
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTCCTGTGACGCCGTAAATTAAGATTGCCGGCGTACA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:d2c11cea69cd
|
40 | — | — | — |
|
ATACCTGGGAGCGCCCGTAAGTTAACGTACTTCCGGCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:ad0ec7293ad1
|
40 | — | — | — |
|
TGGTAGGTTTCCGGTGGAACCGTAAACCTCAGGTAACAAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:59f0cf2c91ee
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCCGGTTTCCTTATCCATGTATCTAAACCGTAAGTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:023a5b31363b
|
40 | — | — | — |
|
AACAGGTCCTCAAACCGTAAGTCACCACATCCGGTTTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:dad3260cc39e
|
40 | — | — | — |
|
CGTGGCGCACTCAGTAAGTTCACTTCCGGTATGGCTGGGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:b571839a2608
|
40 | — | — | — |
|
GGTTTACCGTCATGTATTTCCGACCGTAAGTGCGTAAATC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:f58977f215de
|
40 | — | — | — |
|
GATGGAGTCAGACATACAGTAAATATAGTATTTCCGGTAT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:8587a747c472
|
40 | — | — | — |
|
CAGAACTTCCGGTGAAACGCGTTAAGTAGGTAAAGTATTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:117af66d0081
|
40 | — | — | — |
|
GACGACTCTCATATCAACGTAAATGGAATTGCCGCTGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:900c45eb51be
|
40 | — | — | — |
|
CAGAGCCATACCGATAAACTGTTTACGCTTCCGGTATGGA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:1b07eeef4ee6
|
40 | — | — | — |
|
GAGTACCATGCTTCCGGCCTGCCGTAAGTACTGGTTATAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:58f36f757c68
|
40 | — | — | — |
|
GTAGATGTTGACTGTAATCGGAAGGAAGCTAGCTTCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:cc6ad33c2de3
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCGTGAATAACAAGGCAACATCCGGAAGTAGTACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:f42636abf571
|
40 | — | — | — |
|
AATAGCAAACCGGAAGCGTGAACACGCACCATGCCATTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:bc84d23be04c
|
40 | — | — | — |
|
GCAGAACGAACAAGCCGTAAACAAGTGTCCGGTTGCACCG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:63f0869faad5
|
40 | — | — | — |
|
TAATCCGTGATAAGTAACGTAAACGAGTGTTTCCGACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:73ba1b5fdf1b
|
40 | — | — | — |
|
GGGAAGGCAGACCGGATGTTTGCAATTACACACATACGGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:763163b81236
|
40 | — | — | — |
|
GCATTCATTTGCCACGTAAGCAGTAAGTTGGGCCAACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:aac3e10b7b62
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGCACTAGCAAAACCGTAAATCACGGATTGTCCGGTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:cf4f98be5ff8
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTAACTAAGTAGTCACGGAGGTATTCATGACCACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:b3be31051ad3
|
40 | — | — | — |
|
TACTAAACACCGTAAATAAAGGGATTGCCGGTGTGCCAAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:4d6921f6bbe6
|
40 | — | — | — |
|
GCAATTTAACCGTAAGTAGACGAATAATTGTCGTAACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:2c14c496dfde
|
40 | — | — | — |
|
AATATGATAACCGCTAAATGGTTAAGTGCATTTCCGGTCA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:d790fac80913
|
40 | — | — | — |
|
TAGCACTTCCTGTGATGGCACCGGAAGTGATATGATCAGT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:f20171d7053a
|
40 | — | — | — |
|
TCAGTCCAGCACAGTAAGTGAACTTCCGGTGATCAACTCG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:e08718958a35
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCTCCACCATAACATCCGGTACAGTAAGCCTAGCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:295f8b57d7a8
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGCTAAACAAGTACCGTTAAGGAAACAAGCTTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:795e675a7a25
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAATTGGCCATTTCCGGAGTTGCGTACTATGGTCGTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:493d8cb54421
|
40 | — | — | — |
|
AGACACGTTGCATGCCGTAAGTAACTTGTTGAGTTCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:7627594c299c
|
40 | — | — | — |
|
CTGAAGTTCCCCCATAAATCCGGCTCGGGTCCGATATTTC
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:b0adc6aefcf7
|
40 | — | — | — |
|
GGTAACAGGAAGTCGCGAACTTCCGGTCCGGATGTGTGAA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:1601e1986e88
|
40 | — | — | — |
|
TAAATATGTCCTCCCCGTAAATACATTTCCGGCGACGGTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:6a4dec949def
|
40 | — | — | — |
|
GACACGACTTCCGGCGTTACCAACTACCGTAAGTGACTAT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:af051401af55
|
40 | — | — | — |
|
GACTTGACATTACTTACTGATCTTCTCCGGAAGTACGCTT
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:fa64231edf4d
|
40 | — | — | — |
|
CTAATGCACTTCCGGTATAACCGTAAATGATGGATACTGG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:1b02d3ba0386
|
40 | — | — | — |
|
TATCACACCGTAAGTTGCGACTGCCGGTGTGATCGATAAG
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:a9d7d4506c3e
|
40 | — | — | — |
|
ATAGAGCCATATCCGGTATAATGACACGCGTATATGGTGA
PANAPTA:P11308:ERG_FOXO1:PRJEB66722:R3:6577d1371b31
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final