ERG_GSX2
CAP-SELEX sample GSX2_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAATCCGGTGCCCTCTGAGCCACGCGCTATTTCCGCCTAA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:6a10e50947b1
|
40 | — | — | — |
|
GGGGTGAGCAGAAATTGTAGCTCGCAACCCATCACCCACT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:98918b8c15a2
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGGAGCGTAATTAAGCCAATACTTCCTTCCGCCCTT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:36dab2095182
|
40 | — | — | — |
|
CGACCGTTGTTGACCGACATCGAGTCCACTGATTCTCGAA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:123355dbe3a5
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCGTAAGGAAGGGGCCATCCTTCCGGCTTAGTGCTGG
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:bb18930c3f21
|
40 | — | — | — |
|
TATTGCTTGATCTCATTTTTATGTCTCTTATTGTACCCTT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:5af3835fcf18
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTGTTATGCTACTCAGGACCAAATGCCTACACTAATA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:3d2d70b2baee
|
40 | — | — | — |
|
TATTGGATGCTCCTTATGTTTAATTATGCCTCTTTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:b5c3875b9479
|
40 | — | — | — |
|
GAACGTAAGTAATGACAACTTCCGTTCCATCATCTTGCCT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:ce681d02fd9c
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGAGTCGCGAAATCGAAGTTGCACTTCCGTTTCCCGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:0ad6e0222107
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGGCAGACCGGAAATGGTATTGTAACGGTGGAGCGGG
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:6f6dcd2afd72
|
40 | — | — | — |
|
ATGCGTGTTCGTTAATTAAATGACATGTTTCATTTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:d12eaffa10f7
|
40 | — | — | — |
|
TTCTTTACTGGTCTTGCGTTATCTGCTTCCTGCCAACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:73f06358ba76
|
40 | — | — | — |
|
GCAGCGGAAGAAGGTAGTGTGACTGTGACTACAGGTATAC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:4b67bd1d3d9f
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCACACCGACGTACTACGGAAATGCCACTTCCGGTCT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:a27486dd100e
|
40 | — | — | — |
|
GATTTGCATCCTAAAGAAGCGTTCATGTTTTATATTGCTT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:e997d1d672d7
|
40 | — | — | — |
|
ATTGACACTGCTGTCTGGAATATTGACTGCCATTCGCCAG
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:32e02ec36748
|
40 | — | — | — |
|
TATCTCGCATCCCGTTTATTTCCTGTCTAAATTTCAAGCT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:be40dca3867b
|
40 | — | — | — |
|
ACATGCGTCCACATCCGCTATGGGGGGGACCGAGTTATCT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:266533706363
|
40 | — | — | — |
|
CATAAGCCTACGCTGAAACATCCTGCGGAAACCTCTATCC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:a53d7d93f276
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGGTTATGGGGATCGCTAGAACCTGAGTTCCGTTCGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:1597012deb55
|
40 | — | — | — |
|
AATGCCCTCGCGGAGCACATGCGATCTCGATGAGTTATTA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:a04ccc09bcac
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTCTATTTCCGCCAAGCGATGGTTATGACGTAAATC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:405f13130237
|
40 | — | — | — |
|
AACCGACCATACAACCATCATGACACTTCCCATCAACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:6678f434ba34
|
40 | — | — | — |
|
TGTAGGAAGCTAAAGTAATTTGGCGTTATGCTAGCTTTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:693589934c6f
|
40 | — | — | — |
|
AACAGCTAGCCTTTCCTGCGCTTCCGGACCACTCCCTCCA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:dc83673491cb
|
40 | — | — | — |
|
GAGCCGGTCTCTCATTAGAAGTTAATTACGCGTAATTTAC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:fefa11782e40
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGAAATCGCGGCTAAACATATACGTGAATGATGGGGA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:3ea2c5be6094
|
40 | — | — | — |
|
AACTTCCGCTCCACCGTGACTGCTTGCTTCCGTCCAACCC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:5f38c9378016
|
40 | — | — | — |
|
CAATACCGGAAGGCTGCGTCCCGCTTCCTTACGGCGGTAC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:d8cb28e41c7e
|
40 | — | — | — |
|
GCTGTTACGCAATACTTTCGTTTTGCGGAACCTTTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:1bc4183cdcb1
|
40 | — | — | — |
|
CGTACGTTAGAGCGGTTGTGATTGTTGCATGTGACTACGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:ac9fc39d3b2a
|
40 | — | — | — |
|
TGGGATTGCTCGCGAAGGAAACGGAAACACCGCTTCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:34d3631bb63d
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCTCGTAATGCTTGCCAGGATTAACTCGGGCTTAGTA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:d5b13256c353
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCATCCGGTCAGGAAGTAGCGCAGTGCGTTGCGCACG
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:0e637e5957b9
|
40 | — | — | — |
|
GAACCAACCCTCCTCGTATCCCACCGGCATACCTTACATC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:811060e0f6e6
|
40 | — | — | — |
|
CCATCCGCTTCTGAATGCTTCCTTGCTTTTATTTTACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:80c7c6d14109
|
40 | — | — | — |
|
GGCAAGCAACACCGGAAGTCACCACTTCCGCGTACGCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:701155737b8a
|
40 | — | — | — |
|
CTACAAGTTGCATCGTAAAAAGCTGTTTTCCGATAACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:8e908ab46899
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCGTAGGGATGATTGCGTTTTTATACATCTGTACATC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:3e185c35d907
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAGGGGCAGCCTTGCCTACTTCCGTTCCACATACATA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:1e4d8912095c
|
40 | — | — | — |
|
TTGAAGGGGAAGGCCGTATGCATGCATCCGGCGTCAGTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:3704cf20e7c4
|
40 | — | — | — |
|
ACAACAGTAGCACAGGAAATGAGGACACTTCCGGTGGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:8f2710df0268
|
40 | — | — | — |
|
TCCACTTCCGGCGTCGACGTTCGGATCGATACGACTGTAG
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:626ecb08c2e7
|
40 | — | — | — |
|
ACCATTTCCGCCCTGAGATGTGCCAAGGCTAAATGCTTGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:62d8034f4207
|
40 | — | — | — |
|
GATTAGCATTTCCTTCCATTAGGGATGTCATCACGCTGGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:cd9a8ef9f8e4
|
40 | — | — | — |
|
CCTATTTGGTAACATACGGGCATCACACCGTTTCCTCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:6e9b6fb8c7d1
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTGTCCGAACCAGAACGGAAGCCGACTACTTCCGCCC
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:69b33f9fb75e
|
40 | — | — | — |
|
TCTGGCGACGGAAGTCCTTACCATTCTCCGTGGGATAAGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:9fb3e2eecf97
|
40 | — | — | — |
|
TGAATTCATGAACCATAGTCCGTCCGGACACGCCCTTTGT
PANAPTA:P11308:ERG_GSX2:PRJEB66722:R3:9c309fcc72f0
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final