ERG_HOXB5
CAP-SELEX sample HOXB5_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GAGCAATTTCCGGTTGAGCTAACCGGAAATGTTCCTTCAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:6c1110e577d7
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCGCGTAAGGGGACGTACCGCCTTCCGGCACCAACGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a1470815e179
|
40 | — | — | — |
|
TGATCGGTAGCCGAAAGGAAATCGGGAATTTCCTTCCGGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:24d306529974
|
40 | — | — | — |
|
AGGATTTCCGGTGGCACTCGTAAATCCGGTCACGTACACA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a2aed70ae972
|
40 | — | — | — |
|
ACGACGTGGGCAGACCGTAAACGTTGTCGCGTTTCCGGTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:02298a614079
|
40 | — | — | — |
|
ACTAAGTCATGTAGCGATAAGTTGTACTGCCGCTACACGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a523c6ebd46f
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGCCACTTCCGGTTGAGGAACAGTAAGTTGCCGCAGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:4f60588689d8
|
40 | — | — | — |
|
TTGCACAGTACGTGTCACCACGTCCGGCGCAAATAGCACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:0c6d55eb14e6
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAATGACGCCATTTTCGATCCGTTACACTTCCGGTTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:c92fc63b4b49
|
40 | — | — | — |
|
CAACGTCATTTTTCGACCGGAAGTGAAGCGGCACTTCCGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:abdbd92f89c5
|
40 | — | — | — |
|
TCAGACGACAGGATGTGCCTCACATCCGGCCGTGCAATGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:112de8b5048e
|
40 | — | — | — |
|
GGAATCGAAGGTAGGCGTAAGTCACCACTTCCGCCTTGCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:c52615fc1658
|
40 | — | — | — |
|
TGCTCATATCCGGTGACGTAACCGCTATATGACCTCATGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:12d332230361
|
40 | — | — | — |
|
GCGTAAATTACGAACGGAATTTCCGGCGTAGCGTATCGAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:13be1c276d07
|
40 | — | — | — |
|
CATCTTAGTTTCCGGCGGTGAGCAGTAAACCAAGTATGAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:30fe5feb9e1e
|
40 | — | — | — |
|
ACTGAGAGACCGGAAATAATTGCCATTTCCGGTCACCAAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:74bb8e7123f0
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGCACGTATGTTGGTTTTACAACATCCGGTCGATGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:4d377454a2d8
|
40 | — | — | — |
|
ATCCAACGCGTACGTCGACACGTCCGGTTGGTCACCCAAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:8e0b7f6c2012
|
40 | — | — | — |
|
GCTGACCGGAAATGCATTTACGTTGACAGCCCTTTCCTCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:0d128dd0ae5f
|
40 | — | — | — |
|
GCCGAATGACGCGGAAATGCACTATTTCCGGTCCATGCGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:b02d53fb40c0
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGCGCCTACCGTAACCACGCTTCCGGCATGCGCGGAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:72d1dabc4e9f
|
40 | — | — | — |
|
CACCGTAAATGCATATGCATTGTCCGGTCTGCATCATTTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:b5d36f4b8826
|
40 | — | — | — |
|
GAGAGCGACGTAAACGGCAATTGCGTTTCCGTCGCGGAAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:5fb6d4731861
|
40 | — | — | — |
|
GCACACCGGAAATGCAACATTTATCGGGCATCATTCGCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a503be5c2976
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTCATACCAGCAATGCCGTAAGTCGAGACATTCCGGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:f6f2dbb0420f
|
40 | — | — | — |
|
AAGTCATGTGGATATCCGGTGATAGTCACCGTATATCAGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:85a6a7ce2f4a
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTCGTGCCGTAAACGAACGCGGTTTCCGGCCCTGTGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:23952e3e0a8c
|
40 | — | — | — |
|
GGACAACATGCCGTAAGCGCAGCTTCCGGCATTACCCACC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:90dc1c65121b
|
40 | — | — | — |
|
GTACTAAGTAAACGATGGGGTTTCCGTAGTATCTGGCGCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a49cd59b7135
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTAAGTTGTCAAAGCTTCCGGTGTATCTGCACGGAAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:ef070c864172
|
40 | — | — | — |
|
TATCAAAACGTAAGCATCAAGGCTTCCGTTTTTGTCATGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:3b933070e10a
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGAAGTTGAAACTTACGGCCACGGATATACGTTAACA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:cd1b7b8f53ab
|
40 | — | — | — |
|
AGGAACACACTTCCTTCCGGTTCTCGTCCCTTAAGGAAGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:3403dd67c8c5
|
40 | — | — | — |
|
CTACTGCGAGGATACCGTATGTCTAGTCATCCGGTAACGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:74a385968789
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTAATGTCACCGGAAATGTCACATTTCCGCTCCGCTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:5461f09f3d13
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATGGAACGTATGTCGTAGACATCCGCTCCCAGCGCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:c3c2a406d285
|
40 | — | — | — |
|
AAAACCACTCCGTAAGTGTTACCAACACTGCCGGACGTTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:1344959db87d
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCGTATGCGAGCAGCCGGCGATGTGCACAACAGCCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:49d1062b4928
|
40 | — | — | — |
|
GGATCCGTACCCGTAAATAGTGCGGCTATTTCCGGTAAAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:767f1dc5ce1e
|
40 | — | — | — |
|
GCGTATCGGAGGACCGTAATCACGGTTTCCGGTCCCCACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:287fc9a820b9
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAATGGAAAAGGCATTTGCCTTCATTTACGTTATTCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:be666d096891
|
40 | — | — | — |
|
TATTACATGAGAGTAAATCAGCGATTTCCGCTCATGATTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:4c7b42477fa9
|
40 | — | — | — |
|
CATGCCAGACAGGAAATTGACGTGACATTTCCGGTCCGAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:a057a9f133f8
|
40 | — | — | — |
|
ACGAGGATAACGTAATTTTGCAATTCCGCTACACTCATCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:eae5da0edc7b
|
40 | — | — | — |
|
TACTTCCGGTTACTCTCTGGATAACACGGAAGTAAAGTGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:add25ad1ec6c
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGAGCTAATACGAACACGTATGTTCACACATCCGGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:f6b0a4252ea0
|
40 | — | — | — |
|
ATGTTTCCGGCGCGGGGTAGCCGTAAACAGCTGGCAATGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:0b3edf0e0964
|
40 | — | — | — |
|
CGGACGGATGTTAAACTTCCTTACGTCGTGATTTTGCTTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:6406fe21bfac
|
40 | — | — | — |
|
CGGGCCTCTTCCGCCTGTGATAGGTACCACGAGCGGTAAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:bed5ca5de33c
|
40 | — | — | — |
|
GTAAAGTCGTAAACATGATTTGTTGTCCGCTTTTGCGCCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXB5:PRJEB66722:R3:0de253ac8cba
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final