ERG_HOXC10
CAP-SELEX sample HOXC10_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCTACACAGCCCTAAATAAGATCGTAGTTAAGCACTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:2843086b2674
|
40 | — | — | — |
|
TGTAAAGTGTATATATTGACTAGGGAACATCTGAGCTCGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:1ff8f93e55e7
|
40 | — | — | — |
|
AATACGTTTTATTGTACAATACGGCCGTCTCGCCTTTGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:1e565b7e1f4c
|
40 | — | — | — |
|
TATGTATATCACTCATTGTCGCTCCCCTCCAACCCCAGCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3afb500e3b7b
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTGTAACTCGGAGTCATAACGACCCAACATAGATTTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:51c3fa9d557b
|
40 | — | — | — |
|
CAGAGTATTATTTGCTGAGATTAACAACCGTAGACTACGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:d45ae6755b7c
|
40 | — | — | — |
|
TGTCTGTGCAACGCGTCTTAGTCGTGTCCTTGCGTACGTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:8ef8f213dbfb
|
40 | — | — | — |
|
GCTCTCACCAAGAGCAGGTTGCAGTTACCCTTTTCAGCAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:44e90713e8d5
|
40 | — | — | — |
|
CAACCGTCCTAGTTAGGTCGATAAAACGAATACATACTTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:af3c05466334
|
40 | — | — | — |
|
CACACCCCAAACATCGCCAAATAACAAAACACTCGGCCAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:e1d3b58402be
|
40 | — | — | — |
|
ACAAAGTACTCCAATACCCTCTCCGAACGCGAGGCAACCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:c3f4cfb4ef64
|
40 | — | — | — |
|
CTGAGGCGATAACGTAAGGAAAGTTATTCCTTCCGCTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:26f30c7c240d
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCAACTCTTAATGACGCAGCGCTTAAATTGATCGTGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:9a0d9999476b
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTCCACCGCGAAGTAACAACGCACTTCCGGTGAGTGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:ddc3297e0186
|
40 | — | — | — |
|
GTTACCACCAGGAAACCCTGTCTGTATCAAGAAAATAGCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:432677417c5f
|
40 | — | — | — |
|
GTAATCGTACCTTGGAACCAGCCGCTAAATCGTTATGCGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:5458595a2ed0
|
40 | — | — | — |
|
TTGACCTTTATTGCGAAAGGAGAAGGTAAACATAACCCCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3a7c6d278df2
|
40 | — | — | — |
|
ACAGTTCCGGCGTAAATCGCCACTTCCGCCGAAACTGGGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:f42009bde031
|
40 | — | — | — |
|
AAATAAGTATCTTTGCTTAATGTGTATAGGACTCGGAGCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:385566cc19b5
|
40 | — | — | — |
|
CGCAACCGTAAGTGTCATGCTTCCGGTATTTGGCGTACGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:995ed9c64094
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCAAGCAGGAAATAAACCATATTTCCGGCCGGCTGCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:1dab8bc0785a
|
40 | — | — | — |
|
CTCTTACCGCGGTTAGCGTCTTGCGAACAAAAATTATTGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:119f28e1739a
|
40 | — | — | — |
|
TCTGAGTTGCAGTATATGTCACCACCCTGCGACCATTATA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3d4a4c740b7d
|
40 | — | — | — |
|
ATTGATCCTATTGGGAGTCCACCAATCTCCCCTCCGCCAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:8f15beb511b6
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGACGTAAATGCGATTTCCGGCATCCTACACTTCCTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:07f1f577bf37
|
40 | — | — | — |
|
TGGACAACAACCTCACATGTATGCTCCAAGCCCGAGCCCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:79b8e9f306cb
|
40 | — | — | — |
|
AGGGAGTCCGTAATTAAACTTCATTTCCTTCCGCCAAGGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:07d2b84c50aa
|
40 | — | — | — |
|
GTTAGATCTGTTTTGTCAAGCTATTGCATACGAACTGTCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:e844326682a3
|
40 | — | — | — |
|
ACATCGTGCTGTGATGAAAAATTGATGAGCCAATTATGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:1d18b52b0474
|
40 | — | — | — |
|
AGAGTACCGGAAATGTGCACCCCTCCCCATTTCCGGTGAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:fa5b4b3587f0
|
40 | — | — | — |
|
GTGCAAGATTTGGCGAAAAGGAAGCATGCTTCCGTCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:6f81e5587ecd
|
40 | — | — | — |
|
TATGCGACTTATTCTCGCGAGAGTCACCAGCGAAGATCCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:a61979aa3e7d
|
40 | — | — | — |
|
CATGCCGTAAACGTGTTTCCGGTAGCACAATGCCAGGCCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3dfc8102acd1
|
40 | — | — | — |
|
TATAGGCACGCGACAAAGGAGTCACCATCAACGTAGGGAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:2678992b4394
|
40 | — | — | — |
|
GTACTGAACCCCAATGGGCTCGCGACATATAGGTGCAGAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:de6c0b2ddbe7
|
40 | — | — | — |
|
TAACATTTCCGGCCAGCACGTAAATGGTCAGTGTGTCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:4ef88fc901f9
|
40 | — | — | — |
|
CCCATGGAACGTAAGGAATACGCAAGTCCTTCCGTTCCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:59beba9ebf0d
|
40 | — | — | — |
|
TTATGGCCTAGCAGCCGTTTTAGTATGCGCAGTGCTGACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:e1bb76fc9d36
|
40 | — | — | — |
|
GAAGCACTAGCTCCTAAAGCTACACGGTACAACACCCTCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:6fb7c115b896
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCCCTTGCGCGGTGCTAAGTTACCTCATATTCACACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:ee822a7d67e1
|
40 | — | — | — |
|
CGGAGACGAGGCCGTTGTCTTGCCTACCATAAACTGGCGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:f85b79cd07c8
|
40 | — | — | — |
|
GATTGGGGAAGCGAAAGTAACGTATGCACTTCCGCTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:4485cfbdc8f0
|
40 | — | — | — |
|
TACCGTCGTCTAACCTAAGTTTTTAACTTGTTGATCCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3932467a9fb5
|
40 | — | — | — |
|
AGCCTTACGATGCATTTCCGGCAGGTGCCGTAAATGCTGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:d62676a9fc0b
|
40 | — | — | — |
|
GGTCAAACCGGAAGTGCTTGATCACTTCCGGTATAGCATC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:32c5210b5acb
|
40 | — | — | — |
|
AATAACTGTGGTCAACGACCATGCCCACTCGGCCATGGAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:f43c6129f75e
|
40 | — | — | — |
|
ACACTGTGACTCCTTTGCTCTGCTACTAGTTAGAAAACCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:720b5cfbb4ed
|
40 | — | — | — |
|
AGCCATGTACCGCCTCGAAAGGAAGCGCACTTCCGTCCGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:f027d006a258
|
40 | — | — | — |
|
CGCATTCTCACTCCCACACTCTAGGTCGAAGGCACAATGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:3f2eaa2aa349
|
40 | — | — | — |
|
GAACGTTATTTCCGGTTCTCCGACCCGTAAATGACCGAGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXC10:PRJEB66722:R3:56397f126167
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final