ERG_HOXD1
CAP-SELEX sample HOXD1_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGCCTGCCCCATTAGAGAATATAATTTCGCTGTCCTCAGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:7d2fee9e0251
|
40 | — | — | — |
|
CATTAATACGCTACTACATACATGCACTAGGAAAAATACA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:2d6deb4ef120
|
40 | — | — | — |
|
GCACGATGCGCACCATGTAGTACGGAAGTACACACTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:21eaa7cb2bb2
|
40 | — | — | — |
|
CCGAGCGGTAACATCCGTATGTTCGCGCACATCCGGTGAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:d6e09806f30d
|
40 | — | — | — |
|
GTCCCACGTCCACACATTACATCTACCACCAACATTGTAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:148276f7efd9
|
40 | — | — | — |
|
CCAACACCATGGGTAATGTCGACACCACACTATATGCCTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:e5b78580694c
|
40 | — | — | — |
|
ACGTAGCGTAAATTCGTGACCATTTCCGTCCGTTGTAAAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:67da23f9752d
|
40 | — | — | — |
|
GTACGTATTTCGACAAACCGTATGTCCAAGGATACATCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:ace4c70477db
|
40 | — | — | — |
|
TTGATAAATTGAGCGACCACAGGACTTCATCACCGACTCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:9b74b9dcc630
|
40 | — | — | — |
|
GCGACATGTTTTGCCCGTGCACTGGACGCAAATACCCCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:9e9c10b175cb
|
40 | — | — | — |
|
CACAATTGTTTAAATGCTTCGATTGCCACGACCTCATTCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:d29598fc7ac7
|
40 | — | — | — |
|
TGACGTCTCATGCACCTGCATCATAAAGCAGTAATGTGCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:0bc51c515597
|
40 | — | — | — |
|
GAGCAGGTAATGAAAACAACGTTAACGATTGTAATCATAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:fdda80fdbc1c
|
40 | — | — | — |
|
GTAACGTAAACAGATGATACACCGTAACGTCCCGTTCCGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:92874a982ee0
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGCTTGACCTGTGCGCTAACATGTTAGACCACCATTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:199e8f8adb39
|
40 | — | — | — |
|
GCCTTGCCATCACGGACGGTTAAGACTATCGAACTCCTTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:504d519c16f8
|
40 | — | — | — |
|
CACTAACACCTCAACAACAGAACGGGCCTAAACCTCTCCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:4a6486023b81
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGCAATGTTGTACTTGTACGAAAATAATACCCTGATC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:9884035afd12
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCCGCAACAGTAATAACAACTCACCTATTAATGCACT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:348494c03e61
|
40 | — | — | — |
|
TAGGTTTATTTCCGGTACGTGCCCGTAAATGACATTCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:ea68717b3cdf
|
40 | — | — | — |
|
GGCAACCTGTATATTACCCTCAATCACCGCAAAGATTAAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:86b244930521
|
40 | — | — | — |
|
TCAATATACCAGGAAGAGAATGTTTACATGGACAAAGCCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:93253797830a
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCCGCTCCCCCCAGGCTTACTCAATCTTAGCCTCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:b3f2e05d7a9a
|
40 | — | — | — |
|
ATCCCACATCCGGTGAAGCCGTAAGTTTCCACATCCGTAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:9e574169ce0d
|
40 | — | — | — |
|
CATTGCATTCAGTTGACAATTTCTTACGCTATCACGATAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:7a4c0ef6c01a
|
40 | — | — | — |
|
CGCACTGCACAGCGACGCATTTCCGCAGGAAATCCTCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:2e70a49721b3
|
40 | — | — | — |
|
ATATCAATTGATTTAGCCTCCCGTTGATCACCTATATACT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:65c20ccc1b19
|
40 | — | — | — |
|
CACCAAGTGAACCGGAAGTGATTTCTGACTTCCGGAGAAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:90ccb762fea0
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCCGTATGTGACACACGATCCGGCCTAGTCCAAATT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:88a06927f322
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCCAGTCGTTATTCAAGACTCTCCCCTCGCCCCCTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:f74900f6153a
|
40 | — | — | — |
|
TGGACGCGGAAGTAAGTTAGGACGGCGTGGCATACTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:69148bad7b9c
|
40 | — | — | — |
|
CATATTCACCTTCAGGCAGGCGTAACGTTACCCTGCTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:44ee33f46584
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAATCATGCTTTTCCGCTTCCGTTGCGTTGATCGGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:9f10409775bf
|
40 | — | — | — |
|
GGCGTGATCTACTTCCGGTACAACAGCGGAAGTAACAGCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:aa9da667973c
|
40 | — | — | — |
|
CGGGAAGATGGATAGCACAATCATCGACTTCGTGTTCTAG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:6c65450e7531
|
40 | — | — | — |
|
TCATTTAACGCACTGTGTAGCCTTATAAGAGTCTCCCTGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:03eb4d73e34d
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTACGCAAGCTTGTACCTATAACAATGCAGCGCAATG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:240eaaf9d8a9
|
40 | — | — | — |
|
GCTTACTTCCGGTTGGATGCTCTTTAACCGGAAGTTAGTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:d4762e69a646
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCTAAACCCCCCCGCGCCCTCATGTTGGTACAACCTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:39314d142f23
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCGTAACTGTGCGCTAGTTCCGGTTCGACTACCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:01bccf80dd58
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGCGTGAGCGACGTAATCGGCTGACCATGGCACCTTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:ff05af2b06f7
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCAGTCTCCCATGGGCACCAAACTGCTTGAGAATCTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:be92ff9c0197
|
40 | — | — | — |
|
CACCGCTCGTAGTACTTATGGCCCCCCGTCCCTCAGCGAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:1b738804ea26
|
40 | — | — | — |
|
CGCGTACGCGTACCAACATGCCCGCGCCGACGTCCTCGCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:36489859030d
|
40 | — | — | — |
|
TGCTGTTTGGACTCTAATTTGCACTAAATAAATGGTCGTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:71e1f219e341
|
40 | — | — | — |
|
AGACAGGAAGCGCATGACGGTGCACGCTTCCGGTCTAGAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:bade12a5013b
|
40 | — | — | — |
|
AATGCAGTAAGTCTCGGACTTCCTGCGACAAAGGAGGCAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:cf5c2a5a0b86
|
40 | — | — | — |
|
TCGTGGATGTCCGGCACTCCCCGGCTAAACGAAACTGATC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:30bf4eab29d9
|
40 | — | — | — |
|
CACGCTTCCGCGTTTCCTGCTAAGGGCGGAAGCGGCTTCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:37783ae79e14
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGCAAACTACTACGTCCCAGATCCCACCACGGGACCA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD1:PRJEB66722:R3:ca0712f95e63
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final