ERG_HOXD4
CAP-SELEX sample HOXD4_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGGACGCGTAACCACAAGGTTCCGGTCCGGATGATACGCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:409f1f4f1f5c
|
40 | — | — | — |
|
GTATTCCGTATGTCCCGGGCACCAGCGACATCCGGAAGGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:9b25683a5c54
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGCCCTGGTCCGTAAGTGTGGAGCACACTGCCGGAGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:783125f665e0
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTGTGACACTGATACCGGAAGTACTACTTCCGGACGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:8eb89e97e8bc
|
40 | — | — | — |
|
GCAATCGACACCGTAAAGTAGCTTTCCGGTGTGCGGAACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:3657cb1a4ea0
|
40 | — | — | — |
|
CCGATATGGTAATGGACGTAAGTGAACTGCCGTCCTTATT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:4660c16084ca
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGTCGATAACACGTAAGCAGGAGCATCCGGTTTATGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:6b4e7053a0e8
|
40 | — | — | — |
|
CGCACCGGAAATGGAAATAGACGTTACATTTACGCGTACG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:77c319b95b7b
|
40 | — | — | — |
|
CGTAACCGATAAATGTCGGAGGCATTTCCGGTCGGCCCCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:6b5a5ca1854d
|
40 | — | — | — |
|
ACTCCGTAAGTCGCTGACTTCCGGCGTGCATGCCTAACGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:22a3b7f85233
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCACCGTAAGCACGGCATCCGGTAAAGACGTAATACC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:a401cd2cbf71
|
40 | — | — | — |
|
GCTGACGTAAACACATTTCCGCCAACGAGGAGGTGCCAAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:5af877a575e8
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCCTGTTAGACAACAGGAAGTTTACTTCCGGTGTCGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b5d9fba43b72
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACCGTAAGTTCGACTTCCGGTTCGCTCTCAACGCAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:80459791524c
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACTTCGCTCCGTAAACAACATTCCGTTTCCGGTGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:2dec5b1f772e
|
40 | — | — | — |
|
GGTGCTTAGCCACAACCGTATGTTAGCATCATCCGGTTAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:a026e58424e3
|
40 | — | — | — |
|
AGAACCGTAAGTCAACTTCCGGTTAGATGACATGATGTCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b113ee1d4107
|
40 | — | — | — |
|
GCAATGCCACTCATCCGTAAGTTACGTTCACTTCCGGATG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:58ffc4f55171
|
40 | — | — | — |
|
ATGGCGACACCGTTAAGTACGCTGTACTTCCGGTCGCTTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:44c9ecfe364b
|
40 | — | — | — |
|
AACTCAACGCGTAACCGCATCCGGCTAAGCCGTAAGCGGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:a171a53ae560
|
40 | — | — | — |
|
CGAATTTCAAACGTAAACGAGTTTCCGTTTGCGTAAGCTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:f6c0e18dc426
|
40 | — | — | — |
|
GACGGCCAGACGCGTAAGCTACACTTCCGGTTGGTTGTGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:7234242a9c3d
|
40 | — | — | — |
|
GTGCAACTGCGTGCCGCGTAAGTGATACTTCCGGCACGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:c7a0fa13eb16
|
40 | — | — | — |
|
GCCCATGTTTGACTTACTGACTCCTCACGAGTCCGGAAGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b00fca2abf0f
|
40 | — | — | — |
|
GGTTTGCAGCACCGGAAGTGGACTTCCTGTGCTACGCACT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:f48a4507477c
|
40 | — | — | — |
|
CGGGTTCCGTAAATAAGGCGTTTCCGGTACACACGGAGCG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b0eda1ff0598
|
40 | — | — | — |
|
GCATGCCGTAAATCAGTGTGATTTCCGGTCTGCCATACAT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:c53c78c7815f
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTTCCTTCCGGTAATGATACCGTAAACAAGCGTTGGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:39c9c996eafe
|
40 | — | — | — |
|
ACAATCACCTTCCGGTCGGAAGTCCGTAAGTGATCGGTTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:cebdbcc25f97
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGGTTTTCCGGCTTTCCTGCCGTAAATCAACGAGGAA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b11102c3eba7
|
40 | — | — | — |
|
GCCGGAAACGTAAATGGGCCGAATTTCCGTTATGGGAAGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:fb9d987922e6
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGTCCGTAAGTTTAAACACGTTCCGGACATTGTCACA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:bbda486423f4
|
40 | — | — | — |
|
AGACCGGAAGCGGAATTCCCGGTTTACGCTTCCTGGCCAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:34ec0fb7de76
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCGTAAGGTAATACGCCTTCCGGCGAGCGGTGGTGTC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:685575d30c5e
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCTTGAGCGGAAAGGAAACCGTTATTTCCGTCCGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:215bbc1bbcbb
|
40 | — | — | — |
|
CGATCGTACTTCCGGCAGTGCATCCCGTAAGTTCTTAGTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:0ec0d33f087c
|
40 | — | — | — |
|
AGGGTCGCTAAACGGTAAGTATCAACTTCCGTTTGGCTTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:6b2af8596f5d
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCTGCCCCGGTACCGCTAAACGGCGTCGTTTCCGGTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:34dab1667b51
|
40 | — | — | — |
|
AACAGCGTAAAGTAAGCTTGCTTCCGTTTCGCCTCTCACC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:6ea1688ee826
|
40 | — | — | — |
|
CAACAGTAAGTAGACTTCCGGTTAATCTAGACAGGCCCGT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:28e10c2e1040
|
40 | — | — | — |
|
ATATCCGACTAACGCGTAAACGAGCATTTCCGGTTCGTTG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:0fd2a4e30725
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGGAAGCAAGCGCATCCGGCGAAGCAGCTGCAGCGG
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:b0c815d521a9
|
40 | — | — | — |
|
CATTTAACACGTAAGCACATGGTAGCTTCCGGTTCTCTAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:fe9f42d3d846
|
40 | — | — | — |
|
AGCAACTGTAAGCATGTGCTTCCGGTCGCTGTGATTCGTT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:63810863a75d
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGCGAATTTCCGGCGAGACCGTAAATTGGCGTGCAC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:81e0d69a258f
|
40 | — | — | — |
|
CCGAAAGCAGATAAGTCAAGGACTTCCGGTTCAGCTAAGA
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:ba68df482690
|
40 | — | — | — |
|
GCTTATTGCACTTCCGGTTTGACACACAGGAAGTGCGACC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:1d219825baeb
|
40 | — | — | — |
|
CCAACCTGTGTGGAACGCGGGAAATAGCATTTCCGGTTCT
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:9ec2c6d30d8d
|
40 | — | — | — |
|
CCGACCGTAAACGTGTTATCCGGTACGCAAAGTTAGTGGC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:7eee4e30b6a3
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGTAACTACGAGATCCGGCGTTGCTGCGCAGAGGCC
PANAPTA:P11308:ERG_HOXD4:PRJEB66722:R3:fa5d9c064b7a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final