ERG_LMX1B
CAP-SELEX sample LMX1B_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AATAACAAACCGGGAAGGATACGTCGTATCCGTCCGGTTT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:5a166d5ee554
|
40 | — | — | — |
|
GACGACTTACACTTACGTCATGACCAGGAATGGTTGTCTA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:073da32a7819
|
40 | — | — | — |
|
CCCATCCTACATACGGCCTACTGGCGGACATACACCTGAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:f2aa2088dc57
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCCGTATGTAACCACATCCGGCGACGCCTTGCCGCCG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:21ce3a77e9a6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCAGACTTCCGGCTGAACCGTAAGTTGTGCGACGTCCC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:490738f610ee
|
40 | — | — | — |
|
TCAACCGTATGTTCGCACATCCGGTGGGCAACCGCCGCGA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:697c2532cea2
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGGAAGTGGAGACGGTGGATCACTTACTTACGTACT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:f516ffc5db7f
|
40 | — | — | — |
|
GTAGCGAACGTAAGGAACCTCAGCTTCCTTCCGTTTCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:6d2ecf9cb18e
|
40 | — | — | — |
|
TGGCATCGATTTCCGTACCGGAAAGCCGCACTCCTCGAGA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:8baaa9367f32
|
40 | — | — | — |
|
TTACATCCTGCTGCTACCGGAAGCAGGTGAGGTCAAGTTA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:558397c6a034
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTAAGCAAGGGCTCCGCTTCCGGTGAGGCAATACGTT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:268da6695e19
|
40 | — | — | — |
|
CCACCGAACTAGACAACCATCGACGTATTTACTTACATGT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:f1e5232ed1b1
|
40 | — | — | — |
|
ATGAAACCGATCAATGACCCGCAACGACCGGAAACCTGCA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:5f4e7e647ca4
|
40 | — | — | — |
|
TTTCGCTTCCGCTTCCCTGGTGATTAGATGGCCAATTTTG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:e3fae56b9dbe
|
40 | — | — | — |
|
ACATGGGCCCCACTATTCGCCTTCACTTCCTTCCCTCAAA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:9fd57b563db7
|
40 | — | — | — |
|
CCGTACGTCGCACCGTAAAAAACGGATTTCCGGTACGCAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:4978d8fdc7ed
|
40 | — | — | — |
|
ATTGTTAGTGCACGCCGTATGTTACTACATCCGGCTTGCC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:93f344caf951
|
40 | — | — | — |
|
CTATGATCAAGCATCACATGGAAACCGGATTTCCGTAGAA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:c0b20a8f2423
|
40 | — | — | — |
|
TACCTACCGCGTAGTACACCGTACCCGTTGCTACCACCTT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:8f1820bfda02
|
40 | — | — | — |
|
CACAAAATCACCCTTTCCACCGCTTCCGGTCCGTTTCCAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:6c5c0157ccbd
|
40 | — | — | — |
|
TCTAGCACTACGCTAGGGTGGCTATATTAGCGATCGATAT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:6e9879e66d7f
|
40 | — | — | — |
|
CCTGATGCGCGGCAAGCCGTAAGCCCAACTTCCGGCCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:03aa0615c938
|
40 | — | — | — |
|
TGCGCTGACAACCGGAAGCACACTTCCGGTATGACAAATA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:c0f48a259e3d
|
40 | — | — | — |
|
GTCGGGTAGCAAGACCGTAAATACCTTATTTCCGGTGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:e9680a1c2995
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGGACATCCTCCCCATGATACTTCCGGACGATGTCAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:d648da839581
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCTGACCCCGTCGCACTTTTAAGCTCTGTGAATCAAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:15bda341328e
|
40 | — | — | — |
|
AAGATGTAATGTATGACTTCCGTTTCCGGTTTGCGACCGG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:9cc24932dccf
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTTGTTTTGAAACAATCTTTGCTTGCGGCTTTATTCA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:848da6a425b2
|
40 | — | — | — |
|
ATATCCGCAAGACGTAAGCAAGCTTCCGCTTCGCGCCGCA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:a0b16c5227fa
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCTTCATTTCCGTTAGTCTCTCGCTGCGCTGCTGGGC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:11ed77863e59
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCTCAGGAAATCCCGCTACTACCGCAGTTTCCGCACT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:525240d58f63
|
40 | — | — | — |
|
CTGGTTATTGTCATGATGACTTCCTTCTCCGTGTCGTTTC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:3d702cc4232b
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGGATAACATCCGTAAGTAGTACTTCCGGTTTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:2f6bae13acdf
|
40 | — | — | — |
|
TTGACAGGAAACGCGTTTCCGGTCGTGTTTCCCCGCATGG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:f9492b64166e
|
40 | — | — | — |
|
TAACTGATTTCCGCATTGTTCATGCTTGCTTCCGCTCAAC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:8ac0b25c0bf3
|
40 | — | — | — |
|
CACAGCTTCCGGTCACCCGGGCCTTGCTGCCCCTGAACTA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:742a9be2cfac
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAGTATTAGAGACACTTCCGGTTAACGTACACGTCA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:7340fd332049
|
40 | — | — | — |
|
CGAGCAACGCACTCGGACCGAGTACCCGGAAACTAGTCGG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:9aa45e4374dd
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCAACCGGAAGTCGGACGGACGCAATCGCGACGTTAG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:199b91d20732
|
40 | — | — | — |
|
CTCGGCCCGTGTCTGCGGACGGAAAATGATAGAGACATTC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:5dd4b97b2495
|
40 | — | — | — |
|
ACGGCCCTATTGACCGGATATAGACGGCGTGCTGCTGATT
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:e235d6db2691
|
40 | — | — | — |
|
ATGATCGTAGTACATACATACTTTCTCGTAGTAACGGCGC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:4a92fde7f005
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCCAACAATGTACAGAGGGCCGGTTCCTTGAACCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:a70522376066
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACGTAAGGATATCAGGAACGTTATCCGTCCGCTCGG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:49f3dcc88580
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGCTTAAGACACTCATATCTTGCTCTTGTCTCCCTAA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:b55c66384d71
|
40 | — | — | — |
|
CAATACTTCCGCCACACTGCCTAGCGGCCATGAATTTACC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:e87722d33ba1
|
40 | — | — | — |
|
CAGGACTTCCGGTAAACACGTAAGTTATCTTCCCAGCGCG
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:330a43a127de
|
40 | — | — | — |
|
ACGGAAGCACAGCCCGTGTTTCCGACTACACTACTAGCGC
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:60314f24e7a9
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTACTTCCGGTCCTCGTTCCCGTAAGTACGACATACA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:a53a644f11a3
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACGTAAATCGTACTTCCGTTTCCGTTGGTAGCTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_LMX1B:PRJEB66722:R3:52fa1e355b24
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final