ERG_OTX1
CAP-SELEX sample OTX1_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CAGCAGGCGTAAACCAGTTGCCGCCTGCACATGCAATCAT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:3c7ab7b69798
|
40 | — | — | — |
|
TAAATACCGTAAGCTTACTTCCGGTAACGCGTCACTGTCT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:9e06f4e92024
|
40 | — | — | — |
|
GTAGGTTCAGGCTAGCACTCGTAAGTATACTTCCGGTGCT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:5130e948aa3d
|
40 | — | — | — |
|
TCCGGTAAGCGGACGGAAGTTCTACTTACTTCTCGCTAGG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:c37dfabc5b2b
|
40 | — | — | — |
|
TATCGTATTTCCGTTGCAGGGCGGAGAAAACGTAAATCCG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:c3e8fc5c9eb1
|
40 | — | — | — |
|
ACACCGTAAATCACGGCTTTCCGGTGTTCTTGTGTTACCA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:e6aa9f3a9c48
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCCCCAAAATCGCATCTCCCCTAACCGCCTTTCCACT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:39bfceb46602
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGCACTCGTACTTCCGCCAGACTGACGTAAGTCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:9d58107d926f
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTCCGTCCCCCAACCGTAAGATATCTTCCGGTTCAAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:73e83a831a0a
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGTAAACTAGTTTCCGGCGCGACCTAGTTGATTTGC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:a7ef690aea41
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTGTCACTTCCGGCAACACCGGAACACCGGAAGTGGT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:c6e833b764a5
|
40 | — | — | — |
|
CTGTATCGACGTAAATAGCAATTTCCGCCGAATTCAGATT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:47f44103bf4d
|
40 | — | — | — |
|
GACATGGATCCGTAAAAAGTGTACATATTTCCGGCTCATG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:44ac35c17123
|
40 | — | — | — |
|
CGGCTGAGCACACCGTATGTAAATAAACATCCGGTCTGCC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:5ca5929933e8
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTCAGGAAGCACGCTTCCGGAAGGCCTAAGTCAGCTT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:dae71d5f9174
|
40 | — | — | — |
|
TACTGCAGTCGTAAGTTTACACTTCCGCTACGCTAGCGAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:7a624d81f7db
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTCCCTTGCCGTAAACAAACGTCGTTTCCGGCACAAT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:e3a20777e8bb
|
40 | — | — | — |
|
GATAATACGAACCTTAAATGGAGCCATTTCCGGTTGTGAA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:443a62a86d54
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCACCGACCGGAAGTAATCTTACGCGTCGCACGTGCT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:ad1934007b38
|
40 | — | — | — |
|
GGTAGCACCGGAAATGATGATTTACGGGGCAGGAACTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:bfd2c7d5288d
|
40 | — | — | — |
|
GACACCGCGAGAACGTAAGTTGACTTCCGCTCACCGTTAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:47a4cdeb1a5b
|
40 | — | — | — |
|
GTGAGCCGTAAATGTGCACACTATTTCCGGTAACACAGTA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:cf85f374c8a2
|
40 | — | — | — |
|
AGCAAGGCACACAACGGAACGTAAACTGGTTTCCGCTCCT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:b9e75252b8ce
|
40 | — | — | — |
|
GTGGCCGTAAGCTTCACGTGTGCTCGCTGCCGGCCGAAAA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:b93ecf580733
|
40 | — | — | — |
|
GACACCGTAAATTTTCATTTCCGGTTAGCGAAATGCTCTT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:41f48ee726b0
|
40 | — | — | — |
|
TCCATAGTTAGCGTATTTCCGGTCCAAGACTGTAAATCCG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:6933be1301f6
|
40 | — | — | — |
|
GCTTGGTGTGTTCCGTAAGTGTAGACACATCCGGCCCACC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:2b5acb740aac
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCAGCCGGTACCGTAAGACGTGTCATCCGGTCGGTCT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:441978670921
|
40 | — | — | — |
|
CATCAACGAGCGTAAGTTCACCTAACTTCCGGTCGTACGT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:b44fda967e97
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCTCCGAAAATGACATTTCCGGTGCGTAAAGCCAAAT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:d95b53f966ef
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGCATGACGGAACGTAAGTTTGGACTTCCGCTGTTAT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:282ce0123c9c
|
40 | — | — | — |
|
ACGAACCGTAAATACCAACCAATGATTGCCGGTTCTATGA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:26974bc2d521
|
40 | — | — | — |
|
AGAACCGGAAATGGTTCATTTACGGTACTAATTTCGGATC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:3b92f759ac8b
|
40 | — | — | — |
|
TACGCTCCGGAAGTGCGCGAAGCTGTTACTTACGGATCGA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:1b054037acb1
|
40 | — | — | — |
|
GAACCGTAAGTATAACTTCCGGTCAATTACATCATTTCAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:6c7d0753d98e
|
40 | — | — | — |
|
ACTTACAAACAGGCGAACGTAAGCTGGTGCTGCCGTTCGA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:6e7f497803a2
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTGAGCGACGTAAGTTAGGGCCACTTCCGGCTCACAC
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:db3e59b7e682
|
40 | — | — | — |
|
GAGGCCAAGGTCCGTATGTCTTTGTCATCCGGTCCTAATG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:a465fda39b4a
|
40 | — | — | — |
|
ACGAGACCACGAGCCGTAAGCGATGCCGCTGCCGGCCTGT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:ab40ca9a32f0
|
40 | — | — | — |
|
AGGTAAGACGCGTATGCTACAGGCATCCGGTAGAAATGCG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:5095b86407b7
|
40 | — | — | — |
|
GTAACCGTAAGTATTGCCTAACTTCCGGTATGTCAGATAA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:dcd28fd1bf68
|
40 | — | — | — |
|
CTGTCGGTCCGTAAGCTAGGAGCTTCCGGCTCACAGCAAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:6d05046fbeb4
|
40 | — | — | — |
|
TACTCCTGCTTGTATGACCCCGAATCTACGATCCGTATTT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:d33ec783ea8a
|
40 | — | — | — |
|
GGTACCGGAAAAGCATACATTTACGGTATCAACAACCGGT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:8dc595a39286
|
40 | — | — | — |
|
AAATGCAGTAAATCACGTGGACTTCCGGCATTTCGATATG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:3a7505fc952d
|
40 | — | — | — |
|
CAGAACGGACGTAAGCGCGCTTCCGCCCAGGGCCCCAGTA
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:beac44cd4755
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTCGGAGTGAGGCTTTCACGTAAACTGTGAGTTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:e6d26c856ec9
|
40 | — | — | — |
|
AAATCACAACTTCCTCCAGCCTACAATGAAACATTGTGAG
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:a5a7ac7b3521
|
40 | — | — | — |
|
TAAACAGTAAGTACACATACATTCCGGTTTACAGCACATT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:cf4da84fc371
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGTCTAACTCGTAAGTTGACACTGCCGACTTATCTGT
PANAPTA:P11308:ERG_OTX1:PRJEB66722:R3:af12cf0e37ad
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final