ERG_PITX3
CAP-SELEX sample PITX3_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TACAAATCGTGCAAATTATGAGTAATTAGCACAGCAGCGT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:55773c60ee77
|
40 | — | — | — |
|
CCTTTGACCTCCCTCTCCAGCCCGCCCATTTCACCTCTTG
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:38f3831e1d1a
|
40 | — | — | — |
|
TTTTCTATATACAACATGCTCCATCTGTATGTCATAATCT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:84115259c0d1
|
40 | — | — | — |
|
GGCGATGCTACGTTGATTTCCCGTAAAGCCGGGGTTGCCA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:38d22e77bd31
|
40 | — | — | — |
|
GTTACGCTAAGAGACATAGTTGACCACACCGAACGCTCAC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:32a606997828
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTTCCCTCAACATGTGCAGTGGACCGCAGCTAACCAC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:d35be5978183
|
40 | — | — | — |
|
ACAGGGAGACAGGTGCAAAGTACTAGTAAGGCGGTGTGAG
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:29356089ebaf
|
40 | — | — | — |
|
CAACGGGTCAGGTCAATCGGTGTATGACATACTTTAAATC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:8d54b099053b
|
40 | — | — | — |
|
CATAGAACGGCAACCGTACCCACTCCTCATTCGAACTAGA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:7156b1192a63
|
40 | — | — | — |
|
TCTCCTATCCGCGCCGCGCGCCCATGCCGCAAGTTGATGT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:a650cc22cd8c
|
40 | — | — | — |
|
TAACCTATTATTAGGCTAACATCTGTGCGAATAATGATAT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:1442ac574a75
|
40 | — | — | — |
|
GACGTGCCGTCCCATCTCTTCATACTGGATGCGCTCATTT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:b75d0afa8110
|
40 | — | — | — |
|
TTAGCAAATCCCGACTTAGCCGTCACTTCGCACGAGCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:5362460f7f04
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCCACCCGCTGCTTGCCCCCCCCCAACTAGTACGCC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:008d204730e5
|
40 | — | — | — |
|
GACTTCGCAGACTGTGATCGGGCTAATGGCAGTTTCTCGG
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:fb8e40348dd1
|
40 | — | — | — |
|
GTCCTGCAAGATATAATGACGGTAATCCAAAATACCAATC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:a3093bf2e513
|
40 | — | — | — |
|
TAATTCCACGATGGATAAGGGAAGGACAGTAAGGCGTAAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:92c9d34240bb
|
40 | — | — | — |
|
TGAGAAGTATCTAGGAATATGGATTCAAGCAACGTTGAAT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:589b6ba1a60b
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGTATTTCCTGAGTACGACTGCAGTAAATCCGGTAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:dd2758d080e8
|
40 | — | — | — |
|
GACACGTTGTACATTCTCTGCTAAAGCATTGAACACGCTT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:5f5a7f3098d4
|
40 | — | — | — |
|
TAACTGAGACCCATTAGGCTGACATCTATCCACTTTCTTT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:b82116b65c2f
|
40 | — | — | — |
|
TCGACGCCTCAGCCTCCTCTACCAACACTTGTGCCCAACT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:6d656b7752e4
|
40 | — | — | — |
|
TGATAACAACCGTATGGTAGAAAAGACGAAATTTGCTCAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:a674d7b6c162
|
40 | — | — | — |
|
GCCCTAATTTTTCGTTAATGAGCAATATAAAAGCCTCGAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:eb966f78feb0
|
40 | — | — | — |
|
CAACGGCATTACTCTAACGGTAAAGAACAACAACACTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:b780c4fd5f53
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACCACTCCATATAGACACAAACGCGACTGTGCTCCC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:0f82ab012556
|
40 | — | — | — |
|
TTCAAAGCCGAATTGCATTCGTAAAGCACTACCTTTATTT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:b118c8097a10
|
40 | — | — | — |
|
AATACCCTGCTTAGTAGCATTCCTCACTAGTTTCGGCCTA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:c04cf19b0a3c
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGAATTGGCCCACTGATACGGTTAATAACTCCTGCGC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:cdd999078122
|
40 | — | — | — |
|
ATTCAGGTCGGAGGTGGAAACGCGAATAGCACAAACTTCC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:6fbbe92c7ad7
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCCAACGTAAGCTAGCATCCGTTGGATCTTTCGATGA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:3624f25f21c3
|
40 | — | — | — |
|
CGAAACTTCACGTAGAACAACTGACAAGACTCGTAGCAGA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:9deb18c09532
|
40 | — | — | — |
|
CTGCTCCCTTATTCCAACCCTTATACGACATTGTTATCCA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:3c5a4115973a
|
40 | — | — | — |
|
TCACACAGCCCCGATACAACCCAACACCGCTACTTCCGTT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:e339ca37c9a5
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCCATGATGATCAATTTATCGATCACCATGCAATAAT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:84817b7ff180
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGCGGACAGAGCTCCTTCTCAATTACTGCCTGCTATC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:77d780e8d444
|
40 | — | — | — |
|
TTATCCGTATCTCGCCACCCCTCGAATTGTTCTCATAATA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:28c5d7194c1a
|
40 | — | — | — |
|
TCCCTCTTACCTGCCAATTCCGGCCTACTGTTTTAGCCCT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:258b3934c56d
|
40 | — | — | — |
|
AAAAAATTCAACACCCTTTTACAGACAATTCACGTCGAAG
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:d3797506155d
|
40 | — | — | — |
|
GGTACCGATATTTATTTTGCCATGTAGCGATCGATTAGCG
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:db250a304e12
|
40 | — | — | — |
|
GCCTTTGTACTTGCAGACATCTCCCTAACTTCGCGTGGGC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:0673dc20848b
|
40 | — | — | — |
|
GTTCATGCATGAGTCGTAAATTGAGCGTAAGTAAACTTCC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:443f9bbe0b18
|
40 | — | — | — |
|
TCAAAGGCTACGCGTACATCCGCCACTAAGACGTATGTCC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:52fc35bdff35
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGAACCACCTACGTCACTTGATAGCTGTCTCCTGATT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:46fdbe3f0235
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGGTGACGACCACCCCTTTGCGCGTCACCGTAAGTGA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:3c93a587d444
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTCTGCAGAAGTTTAGTATCCAGAGAACAGCTCGTGA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:02794782a356
|
40 | — | — | — |
|
ATCTACAGCCCGATCGCTGAGACTCAGTATATTACGATAA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:0ebeaf4ddc53
|
40 | — | — | — |
|
ATCAAACGTGTGCGACTACCACCATGGCATTTTAATCATT
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:3f464e591233
|
40 | — | — | — |
|
GAGGAGTCGTCATTTGACTTAGCTTCTTAGCAAGGCAACA
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:e8979e91a931
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAGGAAGGGCAAACTTCGCCCCAAACATTGTGTAAGC
PANAPTA:P11308:ERG_PITX3:PRJEB66722:R3:2b0d351cb44f
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final