ERG_RHOXF1
CAP-SELEX sample RHOXF1_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCGTAGACCGTTAAGGAAGCGCACGAACTTCCTTCCGGTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:bb3241bbe6df
|
40 | — | — | — |
|
CAGTACAGATAAGGAAGTGTCTCTTCCTTCCGGCACTGTT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:f04e90548cf8
|
40 | — | — | — |
|
GTATCCGTAAGTGTCGCTGATCACTTCCGGTCGTTGCCGT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:de1d5c5576d3
|
40 | — | — | — |
|
AAATCCTCAAGCACCCAGCGATGAGAACTGATTAACTACA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:8df7b578503d
|
40 | — | — | — |
|
GTGAACGTGAGCACCGGAAGTCGCTACTTCCGGTCGACCG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:4d6ab6e80cf2
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGTAAGTTGACTTCCGGTTGACGGCACTGCGCGGACA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:0b9c01d1f5c5
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGAAAACGTATTTCCGGTAATAGCCGTAAATCCGTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:55c978749cdf
|
40 | — | — | — |
|
TCTGACGGATATACGCGTCTCCTGCGGATATACGTTAGAA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:7e8322c5557e
|
40 | — | — | — |
|
CGGCAAGAAGAACGTAAGTACACTTCCGTTCTCCGCTGCC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:d737860be05b
|
40 | — | — | — |
|
GAATGCAACCGGAAATTCTCATTATTTCCGCGTTGAACGG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:baf41b9f423b
|
40 | — | — | — |
|
AGCACAGGAAACGTTTGTTTCCGGTGTGTCGTTCCGCTGT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:92cffaf66e98
|
40 | — | — | — |
|
CAGGGCCGTAAGCTTTGGGGCTTCCGGACCTAGGATCGCG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:fd4c5f160efd
|
40 | — | — | — |
|
GCACGCGCTAAATGCCAAGACGGCATTTCCGGTGACGGTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:4405a6b238e6
|
40 | — | — | — |
|
CCGTACAGCCAGTACGCCGTCGCCACCCAGCGTGACTGGC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:815662b9f0a5
|
40 | — | — | — |
|
ATGTCAACGGAAACAGTACCGGAAGTTGACTTCCGGTCCA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:cd167305f987
|
40 | — | — | — |
|
ATTCAGCAGCGGTAAATGCATTTCCGGCTGCGAATTCGTT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:b1b819729e1a
|
40 | — | — | — |
|
GGAGAGCAGTATGTTTTTCCTGGTCTACATCCGGCTCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:70e3feb61791
|
40 | — | — | — |
|
AGGCCGTAAATTAGCCATTTCCGCCTGGCCCTTCCGGCGA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:c34b124b4313
|
40 | — | — | — |
|
TCAACAGGAAATTAATTTCCGGTTGTACGAGCCTAAGGCC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:a62b2917bd70
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGTGCGTAAACCGTGGGTTTCCGACTTCACGGCACTA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:96d4701466b7
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCTAGCCTCGGCCGTAAGTCCTGAACATCCGGCCGA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:39a5df6f6c55
|
40 | — | — | — |
|
AGTTGCACATCCGGTGCATCGCACACGTAAGTGCCACTTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:b1673854a33d
|
40 | — | — | — |
|
CCTTAAGGAAGCTAGCTTCCTTCCGGTTCCCTTAAGTGTG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:713b5f39fe7f
|
40 | — | — | — |
|
GCAAACACCCCTGTTACCCAACCACCTCTTACCCACCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:2f841e4e62a9
|
40 | — | — | — |
|
CAACTTCCGGTCTCAGGTGCCCGTAAGTCGCACGACACAC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:7dd80fc8b268
|
40 | — | — | — |
|
GTGACCGCAATAGCTAACCGGAAATGCATTTATCGGTTTG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:4c0e1e53165d
|
40 | — | — | — |
|
TGTATCATCGGATTGCCCGCGTTCAATCGATCCATCCATC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:c54c1cc6a6d9
|
40 | — | — | — |
|
TTTATTCCCTGTCCCCCCGCCGGCTAATCACAATTCTTCA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:492027bf8d07
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCCACGTCCGACCGGAAGCCCGCTTCCTGTTGGCAAC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:481def179801
|
40 | — | — | — |
|
CAGACGCGTAAATGAGCTAATTCCGGTCTGGATCACATGC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:e20693c424bd
|
40 | — | — | — |
|
GGTTATACCGTAAGGAAACGCGGTTGTTTCCGTCCTTCGT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:639f9e9521a9
|
40 | — | — | — |
|
CACCGGTCATTTCCGGTACCTTCCGTAAATGTTATCGGGA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:c5ee737502cb
|
40 | — | — | — |
|
GCGGAACGGAAATCCGGTACAACACGTATGTCCGATGCAA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:c73645239ff9
|
40 | — | — | — |
|
TTCCTGCTCACATCCGGTTCCTACCGTATGTGACCTTAGT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:2a66c2e7f9b6
|
40 | — | — | — |
|
GTTCGTGTGGGTGATTTCCGGTCTTGTCCGTAAATCAGTT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:d11671b86bc8
|
40 | — | — | — |
|
CATTCGGCACAGGAAGTTCACTACTTCCGGTGACGCAAGT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:e616c24add61
|
40 | — | — | — |
|
AATACAGACAGCGATGCACCACTGCACCACGGATACTAGC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:a69e6472f302
|
40 | — | — | — |
|
ACTAACCGTAACTGCGCACTTCCGGTCAGACCGTGAAATC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:f8cad2e4bbd1
|
40 | — | — | — |
|
GCCGGTAACGTGCATCTTCCGGTAAAACCGTAAGTAGTCT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:68727f83084b
|
40 | — | — | — |
|
GATCGCACATCCGTAAGCGAAACTTTGCATCCGGTGTGCG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:204930888566
|
40 | — | — | — |
|
TGTTACAATCTCTAAATGTAGACACCTACCCTTACCACCC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:dd9839827139
|
40 | — | — | — |
|
TAGGCACCGGAAATAGCCACTGAATTTCCGGTACCTCACG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:2c8f2239ab72
|
40 | — | — | — |
|
GAACGGAAGTCAGCTACTTACGTTACGACATCCTGCCTGA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:a37861451b76
|
40 | — | — | — |
|
GGACACGTAAGACTGTCTTCCGGTCAGTAAGCTACTTGCT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:1f6ee25a0ce9
|
40 | — | — | — |
|
ACGGTTTCGCGTAAGCAATCGCTTCCGGAAACACACATGA
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:403f9ea33f1d
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCGACCGGAAACGTGTTTCCGGTTTGCCTTATTACTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:cbbee5b83437
|
40 | — | — | — |
|
ATACCGTAAGCATACTTCAGCGGTAAGGTGCAATTGGACG
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:ae2b87281607
|
40 | — | — | — |
|
AAGGCTACATTTAGGGAAGATGTAATCTCGAATTGGCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:d685a5ea21e2
|
40 | — | — | — |
|
AGTTTCCGTAAATACCAGGTGTACTTCCGGAATGACAGTC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:6ade37433b94
|
40 | — | — | — |
|
CGGTACCGTAAACGCACCAGGCAACGATTTCCGGTGTCGC
PANAPTA:P11308:ERG_RHOXF1:PRJEB66722:R3:23f179cc1ae0
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final