ERG_TFAP2B
CAP-SELEX sample TFAP2B_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATGAAAGTGAATTGCGAAATACTAGTGTGAACGCTTACAT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:ed3002db9354
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGATTAGCTAAAATAGCACGCCTTGTCATTCCCTCT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:bd502deef36f
|
40 | — | — | — |
|
CTGACCGTGATGTCCGAGCACAGCTGTCGATACATCCGGT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:89a9439ea4b7
|
40 | — | — | — |
|
TAGATTACGTATGATCGTTCTGGAACGTGCCAGAGTGTTA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:7d793107def9
|
40 | — | — | — |
|
TTTTAGGGTTACCCGTGCGTTTCATATGTAAGACATCAGG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:d7557810030b
|
40 | — | — | — |
|
AATCGCTATGCATTACGAAGGAAGTGAGTAAGCCTTACCT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:2d698552ab8e
|
40 | — | — | — |
|
CCATATTTTAATTGAGGTAAGTTTGGCTATTAAGGTTCCT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:7a43e21b4890
|
40 | — | — | — |
|
TATAACCGAAAGTAAGGTGCGCCTTCCGTCCGGTAGTTCT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:282ef1d15b29
|
40 | — | — | — |
|
TCATAATCGCAAAGCATTAAAATGGCGCGCGCATACTACG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:93c680acbc02
|
40 | — | — | — |
|
GCCAGGTATCCTGAGAATTATGTAACGCCGAACTACAACC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:49150048060d
|
40 | — | — | — |
|
CGCACGCAATAATTGCTAAACCGAGCGTGTAACCCAGAGA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:f792212b5436
|
40 | — | — | — |
|
GGCTCCGCTCACCGGAAATGTCGTGCATTTCCGGTCGACC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:3e92bf6c805f
|
40 | — | — | — |
|
AATTTAAGTCGCACACCCTCAAGTAAACGCCCCTCATTCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:3a4ba5a58a61
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGGCCGGCGTACCGTAAGGATGTCCTTCCGGTAGATA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:e061c636e2a3
|
40 | — | — | — |
|
GGGCCCGTCTTATCAAACAGTTGACCCTTACCTCGGGACG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b7d11d59eb71
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGCTACCGTAAGCCCTGACAGCTTCCGGTTCCTCTGA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:dddeba7ee3fd
|
40 | — | — | — |
|
GCACACGTAAGCACGTAATCACGTACTTCCGGTGCCCATT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:d7759b5c0636
|
40 | — | — | — |
|
GTAAATATGTGACCGGAAGTACCATAAACTTCCGGTACTA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:df6d8fde5abe
|
40 | — | — | — |
|
CTCCAGTGTCGTAAATTCAATTTCCGCACTTATCGTGCAA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:eb23e22d1f15
|
40 | — | — | — |
|
ATTGATTAAGTCAAGTCGTGCAGTGCCCAGACCTATGAAT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:5b2351677717
|
40 | — | — | — |
|
CGGCTCGACACAGGAAGTAGACACTTCCGGTCCGCTCCTG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:582db0dd0974
|
40 | — | — | — |
|
CAGGATGGACCGGAAGTGTGCAACTTACTTCCGGTCCGGA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b10dcc3e6a27
|
40 | — | — | — |
|
AATAATAATACTAGACCGGCTATCGAGGACCCATTAAAAT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b35c4589871f
|
40 | — | — | — |
|
AACCTTGAAAGCAATGGCACACGGATATCGTCAGTTTATT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:aa641f86c873
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCGTCCCAAAGACGTAAAACTGCTGCCGGGCGGACCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:14f91ab3967c
|
40 | — | — | — |
|
CCGAACGGGAAGTGCACCGTAAGCACAGACTTCCGGTCCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b90ab4612a98
|
40 | — | — | — |
|
CGCTAATCACCATACCGCCGCCTCGTGGATCTTATAACCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:83b7071b7034
|
40 | — | — | — |
|
AGAGGATGCACCGTTCTTCCGGAGTATCAGTAAGAACGTT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:7cc168089e3b
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGACGTACAAGTGCTCTTTCGCGAATGGTACTAGGGG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:21dd7d90ba54
|
40 | — | — | — |
|
CGACCCCACAGGTCGCGAGCGTAAATAAGGATTTCCGCTC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:5d8ecaa9f8f9
|
40 | — | — | — |
|
GTTCACCCTCTAGCATTCATTGTCAGTTATCAAAAGTACT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:9acd30365ec7
|
40 | — | — | — |
|
GACATATAACACAATTAGATAACATAAGCAAGTGCAAGCC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:3746165257e4
|
40 | — | — | — |
|
CGGAGCGTAAGTTTACTTCCGGTCCGGTCACAGTGGATAG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:9ddf3cb00b6d
|
40 | — | — | — |
|
GGACGCAACCCGTAAGCATCGTTACCGCTTCCGGTTGAGC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b3850e222273
|
40 | — | — | — |
|
CGACTATAGACGTACCACCGGAAGTAACACTTACGGTGCT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:8c5093b68cc5
|
40 | — | — | — |
|
TACCCTAAACAAGCTAACGGACACCCATAAACGTAATAAG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:9bc87fad8d55
|
40 | — | — | — |
|
AGGACATGTGACACCGCCGTAAACGGGATTTCCGGCGGAA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b17c20e9efad
|
40 | — | — | — |
|
AGGTTGCACCGTAAGTTGACTTCCGGTCTCCATGGGAAAT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:450b9575de73
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCTCAGTACCGGAAGCCGATTATCGCTTAGCGGTACT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:98c37ae931af
|
40 | — | — | — |
|
AGCGAATCTACGCAACAAGTATAACGCAATGTGCCATAGT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:208257442046
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTGGGTGTAAACGTAGATGTAAAGTGCGGATAGAGCC
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:92420b5d8789
|
40 | — | — | — |
|
ACATCCGTATGTGGACACATCCGGCTGTGCCCGACCACAG
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:ae67a91ca5c0
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTGGGTATGTCCGGTCATTGCATGATCCCTAGCTTAA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:b068a2f2d4b7
|
40 | — | — | — |
|
ACTGGCAGGTAAGTGAAAGCATGTTCACTTCCGGCCAGGA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:da43dd43a994
|
40 | — | — | — |
|
TTAACTCTCAGACCGGATGAACACATGATCATCCCGCTCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:5a134cb87f4e
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCTACCGGTCTAATTCCCGGGCCATTTCTACGTCCA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:fa4627412d55
|
40 | — | — | — |
|
TCGACCGGATTTCCGCCACTTCCGACGCAACATGCCTAAT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:054039b2cf89
|
40 | — | — | — |
|
ACGGCCAACCGGAAATAACTCATAACCCAATTTCCGGTTA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:f5295801b7c7
|
40 | — | — | — |
|
GTGACGAGAGGACGGAAGTTAAGCTACTTCCTTCCTCTTT
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:fac74dbaa415
|
40 | — | — | — |
|
CGGACGTAAATTACCATTTCCGGCACGAGATAACTTAGGA
PANAPTA:P11308:ERG_TFAP2B:PRJEB66722:R3:0c9938ab0ef5
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final