ERG_VAX1
CAP-SELEX sample VAX1_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGCGCACTTCCGGCTGTACCGTAAGTAAGCGCGGCCACTC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:6d050934e63c
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCTTCCGGTCCGGGGGACGCGAGAAGCAGCGCATGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:03707b0e0fe3
|
40 | — | — | — |
|
GGGGCGTTAGCGTAAGTTGACATCCGCTAATGCTTGACGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:974b2e23e8c8
|
40 | — | — | — |
|
CATACCGTAAGTTACCACACTTCCGGTATCATCCGCATGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:62a741492d69
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGACACCGTAAGCGATGACTTCCGGTGTCCTACCCGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:34ce65dddcc1
|
40 | — | — | — |
|
TTTCAAGTTAATGTAGCAGGAAGTGTCCACTTCCGGTTAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:06add4d5ab4f
|
40 | — | — | — |
|
GCCCCGACCGTAAGCGTGCTTCCGGCCGTAAGTACTTCAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:8740e32ace1d
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCGATAAATGCTACATTTCCGGCATGGGCCATGTCTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c65aaa466a7d
|
40 | — | — | — |
|
CTGATCCTATCGCACACCGTAAGTCTCACTTCCGGTGTAA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:bbb17733ccc5
|
40 | — | — | — |
|
GTGAATGCGTAGACTTCCGGTACGCGTCCCGTAAGTAGGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:3a3e3bbbb20f
|
40 | — | — | — |
|
GCTAAAACACAGTATTTCCTAGGGTACGTAAATCCGGTGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:8978587a5b45
|
40 | — | — | — |
|
CACGACTTCCGGAGAGGCGGGCCCTCCGTAAGTCCGTGAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:f4f8fcd68bbb
|
40 | — | — | — |
|
TCCTTCCGAGCACCGCCGGAAACGGTAAGCTTACGGCGGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c74cd25298a1
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCGTAAGCCAAAGCTTCCGGCTCCACACGTCGCGATA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:cb323dea1c14
|
40 | — | — | — |
|
CGCGATTTCCGGTCGTAACTACCCAACCCGAAATAACGTT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:4b8d3aa34cbc
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTGGCACGTATGCTCTGGCATCCGGCCAAGACGACTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c6f11d0b10b1
|
40 | — | — | — |
|
AGCTACCCACCGTAAGCTTGCTTCCGGTCTGCCGCTGCTG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:b49398000754
|
40 | — | — | — |
|
ACACCGACCGTACGTAGACATCCGGTCAACCGCATCGCGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:817d6c37958a
|
40 | — | — | — |
|
AGTGGTCGGCGTAAGTGATACTTCCGGACCGGCGACCGCA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:26b6959ae105
|
40 | — | — | — |
|
TCGCTCTACACAAAGTATACGAACATTCACCAACAGTAGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c607508cb9f3
|
40 | — | — | — |
|
TAGGCTTCCGGTGGCTCACACGTAAGCTTCATTAACAACA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:a3f1d6f9ceb4
|
40 | — | — | — |
|
TGACCGGCAAATTAGCATTTCCGGTCAATGCTTGAACTCC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:fccea832029c
|
40 | — | — | — |
|
CATACCGTAAACTAAGCCGGTTCCGGTATGACCGCACTGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:9bbec150bd38
|
40 | — | — | — |
|
ACCAACGCGACCGGAAACTAGTTTCCGGTCCGCGTGCAGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:097cdf21bfde
|
40 | — | — | — |
|
TCACCCGGATTTACGGTGTACCGGAAATAGGAACGACTGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:446c8d8ef311
|
40 | — | — | — |
|
GACACCCTACCGCACCGTAAGTTATCGACTTCCGGTGCAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:41cf18d45557
|
40 | — | — | — |
|
GATGACTTCCGGCAACACGGTGCCGTAAGTAGCGCAAGCC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:eaeb33e1ca49
|
40 | — | — | — |
|
TAACATGCCGTAAGTATACTTCCGGCGCGTTCTGGGCGTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:d621c2311634
|
40 | — | — | — |
|
TGCACGTAAATTAGGATTTCCGCCCCAATATAACACCGGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c624781fc524
|
40 | — | — | — |
|
GGACCGTAACCTCAGGTGCCGGTCTACTGCATGAAAAACC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:302ffba216e1
|
40 | — | — | — |
|
AATGTACACAGGAAACGATTTCCCTCGTTTCCGGTGCCAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:ddab95573145
|
40 | — | — | — |
|
GCGCAGGAAATGCCAGCATTTCCGGCTTGTACGGCGGAAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:6f617ca49ef8
|
40 | — | — | — |
|
AGGAAACCGGAAATAAGGAATTTCCGGTCTCAAGAAGCAG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:742e5e8ad960
|
40 | — | — | — |
|
AGTAGCACATCCGGCGAAAACGCGCCGTAAGTACATATGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:91a9b1b09a77
|
40 | — | — | — |
|
CACAGACCGTAAGTCTAGACTGCCGGCCTAATCGTACCAG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:86521b7b0176
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTGTTAACACCGTAAGTAGACTTCCGGTCGAACCCGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:7cf21328d4b1
|
40 | — | — | — |
|
CAGTGGACGGATTTCCGGCATTGAACGCAGTAAATCCTGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:872660107e62
|
40 | — | — | — |
|
CGTACCGTAAGTTAACAGACATTCCGGTCGTTCGATGCAT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:d4a3cf455c92
|
40 | — | — | — |
|
ACCTGCTCTACCGTAAACTAGTTTCCGGTTGAACAACAAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:df989d034356
|
40 | — | — | — |
|
GGGCGAGCCGTAAATACCATTTTCCGGTTTGCCAAAAGGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:654b97a115e5
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAAACGTAAATTGGCGATTTCCGCCTGCATAAGGGGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:e166a13b5b58
|
40 | — | — | — |
|
CTCACCAGTTCCCGTAAGTGAACTTCCGGTCCGTTGCCTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:47b976226c1d
|
40 | — | — | — |
|
CCGTTTCCGTAAGTTGAAACTTCCGGAACAATCGTCCTTC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:8ef40eb98a70
|
40 | — | — | — |
|
CGATCTCTCCAGCCGTAAGTATGTTACTTCCGGCCTCCAT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:c9aa2503cff2
|
40 | — | — | — |
|
TAGCCGTAAGTTGTCGGGACTGACTTCCGGCTAACCCGAT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:76921a4875b3
|
40 | — | — | — |
|
ACCGTAAGTGCGAAAGGGGGTACGCACTTCCGGTCTACTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:a53dbdbb0c8f
|
40 | — | — | — |
|
CAACCGAGTATCCGTAAGTCGCATACAAGGACTTCCGGTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:909c096c3a04
|
40 | — | — | — |
|
TACTGATAAATATGTGACGTAAGCATGGCTTCCGCTGCAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:69a0a06e5ae8
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCGTAAGGACACATACTTCCTTCCGGCCCCGGCGCAA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:f6e9bafc53f8
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTATGCAGTAAATGCATGCATTTCCGGCATATTAATT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX1:PRJEB66722:R3:f3bcf50f2c52
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final