ERG_VAX2
CAP-SELEX sample VAX2_ERG · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACATTGACGCGCATTCACTATCCTACAACTACTTACACT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:288a35c8c447
|
40 | — | — | — |
|
TTACGGCATTATTGAATAGCCCCTACACCGTCAATATCGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:c3d46ce23243
|
40 | — | — | — |
|
ACAACACCGCACCATGAACCCGTACCCCGTGCCTAAACCA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:929d5143120c
|
40 | — | — | — |
|
CGATTTAGTACGCATCACACGTTCCAACCTTCCACACTGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:dd8f8336626d
|
40 | — | — | — |
|
CGTGACCGTAACTCATAGACTTCCGGTCAGCCTGACTGTG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:1372d155f9c2
|
40 | — | — | — |
|
ACACCGTATCGAGCGTGATGTCTCGCCATAATCGGTATAT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:132ec0645dd1
|
40 | — | — | — |
|
AGAGTACCTCGCTTCATGCTGCGATACGAAGCACCCCATG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:796c9a1d81c2
|
40 | — | — | — |
|
CACCTACCCAATCTGACCGAGACATTTACGTTAATTGATA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:ee530c8c87dc
|
40 | — | — | — |
|
TCCATTTATATCGAAGGCTAGTTGAACTTGCAAGATCAAG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:7bdcf5866fb5
|
40 | — | — | — |
|
CGCTCACCTACGCACAAAATAAGTAGCGCTAACCAACGTT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:1dada856a045
|
40 | — | — | — |
|
CATATACTCTGTGAATAGCTAACAGCACCTCACTTTCACG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:da92d84a5eb2
|
40 | — | — | — |
|
ATACTGACGTCTAATCGCAAAGAGGCCATGTGCGTTACAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:db6178598d81
|
40 | — | — | — |
|
ACACTCCGTAAGTCATGTGTCGCGTGACTTCCGGACAGCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:74cf4e2e0ff4
|
40 | — | — | — |
|
CGTGACCGGAAGTCTTGCGTAAACGTCCGGTCGAGCACCC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:ae4eae3679de
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAGGGACCGTAAGCTCTTACGCGTCCGGTCCATGTCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:ef7448b2148b
|
40 | — | — | — |
|
CCATTCCGGGCAGCGTTCTCAACGCTTGCGCCTACGTAAA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:4637d3e841d9
|
40 | — | — | — |
|
AGACACGCTATTCTTGATTATAACCACCCATTGCCACTTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:15cc59928ba1
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGTGGCGCACCCCGTAAGCGTGACTTCCGGTGCCGCT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:5e38b7d07ce0
|
40 | — | — | — |
|
CTTTGCTTCCGGCAAGTGCACAGGTACCGGAAGCACAATT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:48193659e6f0
|
40 | — | — | — |
|
CAAAGCGCAAATTTTATGCAGGACGATGCCAATAGCTTGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:9ff082d2da8d
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGACACCTCTTCGCGTGGTCCCCTCCAGGCATTAATC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:7237a74e69c2
|
40 | — | — | — |
|
CGCCATTCCCGTCCCTCGCTGGCAAAGACTCACTCCCACG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:bad693b06df6
|
40 | — | — | — |
|
CTGATATCTGTTGATACATAATGACAGGACGCTATGTGAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:39fface14589
|
40 | — | — | — |
|
CGAACGTAAGCGAGTGAGGTATGAACACCGCTTCCGCCTC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:23d63a7406f3
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTGCACTTCCGCCTGAAGATAAGGACGTAAGTTGTGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:526ffeb27e91
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCTTCCGCTACTAACCTAGTAACGTAAGCTATGCTAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:a832a55e4b2a
|
40 | — | — | — |
|
CACGTATCACACTCATCACTCGTATTAACCTTGAGACCGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:4398399c590f
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTTAGCCGTTATGTGACATAGTAACATCCGGCAGTGC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:245a4e5c4d67
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGTGGGGCACCACTTACGCTAGCCATAAGGCCGCTA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:2bdb5a6a6640
|
40 | — | — | — |
|
GCGGAAGCTAGAGCAGTTTCCGGTTTGGCCACAACTTCCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:47cb16dec5fb
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTCATTAATCGATACACCCCAATCGATCGTATTAATT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:26162a9bc4de
|
40 | — | — | — |
|
ATTACGAACTCGCAATAGGCCATCCCCGCGAGCGTTTGTC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:5bf101048d90
|
40 | — | — | — |
|
CAGGCAGCATACAACCACCCGACCTAATGACCCTTATCCC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:d417a9a0c00d
|
40 | — | — | — |
|
GAAGTCAACACATAAAGACCGAATTGCCAAGGTGAATGAC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:9de78695359b
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAGTGGACATCCGTTAGCATTGCAACCTTTAACACCT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:fd871a9aba65
|
40 | — | — | — |
|
TTTGCCGTCGCTGACACATTCATTAGCAATAAGCGCACGT
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:e5a9c331f21f
|
40 | — | — | — |
|
ACACAGTCTACATCCATCCACGTTTCACGTAAACAACACC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:233922966673
|
40 | — | — | — |
|
GCACCGGAAGACATGTTTTACGGTAACATCTCGACTGGTG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:1ed96c687b83
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCGACGACCGGAAGTAGACTGACTTCCGGTCCTTCC
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:c3388f748605
|
40 | — | — | — |
|
TTCCAATTAGCACTATCAAGGACTAATAGCACAGCATTGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:1e01c00f4eb5
|
40 | — | — | — |
|
GCAACATCCGGTCCCTCCCCGGAGACCGTATGTAGTGCGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:c8f1d88340dd
|
40 | — | — | — |
|
GCGGTGAACGTAAATTGTGCATTGGTCCGTTCAGCGGGCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:3dd107847e4d
|
40 | — | — | — |
|
TTCATGCCTAATCGATACTCGGTTACCGTTCATGGTATCA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:39dcdfa53b24
|
40 | — | — | — |
|
GGACGCGAATGCGATTGCATCCGGTCCACATCGCACCGCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:71e55f73d0ba
|
40 | — | — | — |
|
ATGAAAGCCAGAAATGGTGGATAAGCATGAGTGGCTGAAG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:8cf05c316be2
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCACATCCGGCGGTCATACCGTCCGTATGTGATAAGA
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:ad47cddc5e41
|
40 | — | — | — |
|
CCGGATACGCGAGCATCCGGTAGACATGCACACTCTACCG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:e9b4d5184010
|
40 | — | — | — |
|
CACGAAAGCACAACACAGACAACCCAATCCGCCTAAACTG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:d09ad9e57516
|
40 | — | — | — |
|
TGAAACGCGTAAGTCAGCACTTCCGGTTACGTCTTCAGGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:0a86a64ed53f
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTCCGTTAAGCTGTACTAACACACCTTCCGGCGTCGG
PANAPTA:P11308:ERG_VAX2:PRJEB66722:R3:cd13ae0e02c7
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final