ESRRB_HOXA2
CAP-SELEX sample ESRRB_HOXA2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
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GTGTCTGATACCTTAATTAATGATAGTATTATGAGTTTCT
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:d88146f2ee97
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40 | — | — | — |
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ATGCCGATGCGATGCGCGAATTGACCTTCTAATGACCTTG
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40 | — | — | — |
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CCTCACCCTCCACCTCCCCCTGCCCCCCGCCACAGCTCAA
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40 | — | — | — |
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ATCCCTGACCGCCCTCCCCCGTCCGCCCGACCCACCCAAC
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40 | — | — | — |
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CCCGCCCACCTCCTCCCGCCTCCACCCCACGGCGTATGGC
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40 | — | — | — |
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CGCACATGCCCGCGCCACCGCCCCCGCCTCCTCCCGGGCC
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40 | — | — | — |
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GACTCCCCTCGCCGCCTCCCCCCTCCGCCACCCTACTCCC
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40 | — | — | — |
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AACCCTCCTCCACGCCCCCACCCTCCCCATAGCCCCAGCA
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40 | — | — | — |
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CCCCCCGCCCTGCCTCCCCACCACCCCGCCCACGAAAATG
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40 | — | — | — |
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GTAATTAGTCTACGATTAGCGAATTAATGTGCGTTTAATG
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40 | — | — | — |
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TCGCGCGACCTTGACTGTCAAGGTCATGTGTACTTAAGCC
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40 | — | — | — |
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GCCCACCACCGACCCCGTCCCCACCGCCCGCCAACCCCGG
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CTGCACCCTCCACGTCCCCCCATCCGCCCATCCCCGTCCG
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CGTACCCACCAGGCCACGCCCCCTGCCTCCCACCCAACCA
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40 | — | — | — |
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CGCCACCACCTCCCCCCACCCACCCGCGCCGCGCGACCGT
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40 | — | — | — |
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TTCGTCCCTTCCCCCTCCCTTCCCCCCACCCGCCGCCCAT
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40 | — | — | — |
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TACCCCGCCCACTCAACCCAAACCGCCCCCGCCCCGCGCG
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40 | — | — | — |
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GCCCGGTACGACCACCGCCGCCCCCCCACCGCCGAGACAC
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40 | — | — | — |
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GCGCCCCTTAACCCCCCTCCCCCAACCACCACCCACGGCC
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40 | — | — | — |
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TTGCCCCCCCATCCGCCTCCCAGCCGCCCGCCCGCAACGC
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40 | — | — | — |
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GCGACTAAGCCACCCTCCTCCCGCCGCCCCCCGCCCGCGC
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40 | — | — | — |
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CCCTTTTCCCTTCCCTCCGCCCCCTACCAGCCACCCGACC
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40 | — | — | — |
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GCCGCACCACCCACCACCCCACCCGCACACCACAACACCT
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40 | — | — | — |
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TCACACCCTCCCTCCTCGCCCCCTCCCACACCGCCCCATC
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40 | — | — | — |
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GACATTGACGTGACCTTGGGTTAATTACCGTACTCGGCGT
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:cec269fc6694
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40 | — | — | — |
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ACCCCACCCTCGCCGCCCCGCCGCCCCGACCCGCCCTCGC
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40 | — | — | — |
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GCATCCACCCCCCCACCTCCCCGCCACCACCGCACCGCGA
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:b63453961ef2
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40 | — | — | — |
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GACCTTGACGTCGAGGGCACGTGACCTTCTTGTTCTCAGT
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:5900144e4b68
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40 | — | — | — |
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CCCTCCCCTCGCCGCCCCCCGTCCCTGCCACCCTGTGAGG
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40 | — | — | — |
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CAACCCACCTCCTCCCCCGGCACAACCCGCCCCTCCACAC
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40 | — | — | — |
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TAACCCGCCACCCTCCCGGTATGCCCCCACCGCCCTTGGC
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:e5cacf008dcd
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40 | — | — | — |
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CCTACCTCCCTCCCGCTTGCCCCCGCCTCCCACCCCCGTA
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:af50c0627a5b
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40 | — | — | — |
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CACCTCCGCCCCGCCCCCTCCCGCCTCCCACCGCCAGGCC
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40 | — | — | — |
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TCGCCCTCTCCTCCGCCCCCCGCCGCCACCCCACCCTGTT
PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:9d177f63a373
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40 | — | — | — |
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TCCGCCCACCAGGCCCCCTCCCACTACCGCCCCGACCTTC
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40 | — | — | — |
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40 | — | — | — |
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40 | — | — | — |
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PANAPTA:O95718:ESRRB_HOXA2:PRJEB66722:R3:31616e6d6f34
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40 | — | — | — |
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AGTTCCACCGCCACCCCCGCCCGCCCCGACTGCCGCGGGA
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40 | — | — | — |
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CGCCACCCACCCCCAGCCTCGCCCCTCGCCCAACCCACAG
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ACAGCCCACCCCCTCCGCACCCCCGCCACCAATCCCCGAC
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40 | — | — | — |
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40 | — | — | — |
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GACCTTTTAATGACCTTGCTAACACCTTGAACGCGTGGTC
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GGCACACCGCCCTCCCCCGTTCAGAGAGCCCCCGCCCACC
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CACTCTCCGCCCACCGCCCCCCCATCCCCCCGCCACAGGG
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40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final