ETV1_HOXB13
CAP-SELEX sample HOXB13_ETV1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTTGGTACCGGAAATAACGTATTTCCGGTTGGCATTCATA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:e5c0b3262e71
|
40 | — | — | — |
|
GATCTTCCAATCACCGGAAAACGTTTTTCCGGTCATTTGG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:3acc41b759c6
|
40 | — | — | — |
|
TGCCCCATCCGCATCGTGGAATCACCTTTGCTTCCGGTGA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:610feb8deaa8
|
40 | — | — | — |
|
GGAACGCACTTCCGGCCGTACTGGCACGAAAGTGACGTCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:a91c87503eac
|
40 | — | — | — |
|
GGGCAAGTTTCCTGTCATCTAGACACGAAATTGTTATGCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:ecd7af758a94
|
40 | — | — | — |
|
ACTAGGTGAAAGGAAGACGGTCTTCCGTCCACCGTAACAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:edf488fb240a
|
40 | — | — | — |
|
GTCAACAGGAAGTGTTACGTATATCCACTTCCTGTTGCGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:b503ebdc22fc
|
40 | — | — | — |
|
ACTGACTGGGAAGGAAATGTGTAACATCCGTCCCGTAACG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:33261b6e03b1
|
40 | — | — | — |
|
CTCTGCGTAAGTTATCACTTCCGCTTAGCGAGCTGGGGTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:26909ac24806
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGGCACCGGAAGTGTAGGCACATCCGGTATTAGATAT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:61797c0aec31
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTCGCTTCCGGCGCTATCACCGGAAGGGGAGCTACCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:c238ab2071b3
|
40 | — | — | — |
|
ATGCATCTGGGCGTTCCGTCTGTGAAGTAAGCCCATGCAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:330d6cf91270
|
40 | — | — | — |
|
CTCACTTCCGGTACCGCCCCAACCCGGAAGTCGGACCACT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:36bada66636d
|
40 | — | — | — |
|
CATGTGATTTACGTTGCTTGACACCGGATATCCAGTATGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:dac3cc791868
|
40 | — | — | — |
|
ACGTGCTTCCGGAAGTAGACGCTTCCGGAACGGTAGCGTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:7aa94f22504f
|
40 | — | — | — |
|
GCTCACATCCGGCTTACCGAAAGTGTGCTAGCGTGCCGCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:6e8f71dcc26d
|
40 | — | — | — |
|
AGTGCTTGACTTCCGGATCAATCTATGTGCCGGAAGTAAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:bd8cf65e1ae0
|
40 | — | — | — |
|
GTAAAACACCGGAAGTCAGTGAGGTCTTCACGGTGTATGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:b194c6d55594
|
40 | — | — | — |
|
GACCGGCAGGATGTGGTATCCCGCATCCGGCCCGTGCACT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:e9455361c95c
|
40 | — | — | — |
|
GGGAGATTGTCGTAAACTGCGTGACGTTTCCGGCACTCTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:5a5521be15d3
|
40 | — | — | — |
|
GCCATGGCCGGATGTCCAAACGACTTCCGGTCAACTGGTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:6b2284df9ec5
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGGCAGGAAAAGCAGTACTACTTCCGGCCTGCTCCCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:dbd80f3312f3
|
40 | — | — | — |
|
TAAACCGTAACCGAAAATGGTGGATTCCGGTTCCGCTCCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:61b9917123fa
|
40 | — | — | — |
|
TCATCCCACCTACTTCCGGCATGCCTCCGGAAGTCATGCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:e1404f553901
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGACGTAAACAGGGTTTATTCCCCCGGTTTCCGCCCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:3f025f002116
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTGTCCGGAAGTTTGCAGAACTTACCGGCACGCACAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:189fa667380f
|
40 | — | — | — |
|
AGACTACGCCGTAGGCCACCGGGCATCCGGCGTGTCTCCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:7fd50cb80aad
|
40 | — | — | — |
|
GACTTTACGACGTCTCTCCTGCAAGTCGGATGTCGTAAAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:009179f9b04e
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGCGTCGTATGTATGTGGTGATGATACTTCCGACGTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:48c9a57d253f
|
40 | — | — | — |
|
TGCTTCCGGAAATACGTTTTATCGTCCTATTTCCGGACTT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:9f04b8bc765a
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGCACGTCCTCCGCGACTACCACGTATAGACGTGCGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:889b7a28437f
|
40 | — | — | — |
|
CTTAATTGACGCTATTTCACGGTGAAAACCGGAAATGCGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:118f43fe8b1a
|
40 | — | — | — |
|
TACGTCGACCGGAAACTCCCTTGTTGTTTCCGGTAACTAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:bdb3c7fb0593
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCGGACGTCCGGAATAGCATTACCGTATGTCCGGCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:c7b12666cb5a
|
40 | — | — | — |
|
GGTCACCGTACGTCCACTGGTTCACGTCCGGCGCAAACTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:6e65d29513de
|
40 | — | — | — |
|
AATTACACATCCGCTTGTAACGGAGCGAGCGGAAGTGGAT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:ef1fb939525e
|
40 | — | — | — |
|
TACATAACGCTCCCAGACCGGAAGTGCCTCTTCCGGCCTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:15a7b75db112
|
40 | — | — | — |
|
TTTGATACTTCCGCTGCCTTACATAGCGGAAGTGGTGTAT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:2543236b2b63
|
40 | — | — | — |
|
ACCCGCCAGAACCGTAAAACCTAACTTCCGGTTCTCGCCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:79d388bf74f0
|
40 | — | — | — |
|
CGAGCCGGAAGTAACGTACGGCTTCCGGTTCCAAGCGTCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:4fb5c4c9e1f7
|
40 | — | — | — |
|
CCTTGTCCATATCGCCACTTCCGGGATGGACGACAAGTGA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:73f5e22e96f3
|
40 | — | — | — |
|
TGAATGCCAGACCGGAAGCAGCGTAGCCTGTTTCCGGGCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:3a455b7adcce
|
40 | — | — | — |
|
TACGTACCGGAAACCCCCATTTCCGGTAGGCACTGCATGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:dc58333ab079
|
40 | — | — | — |
|
CACATCCGGCGTACCGGAAGTGTACATCATTTATAGATGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:dd75694e7c4e
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTCCGGAAGTACACTGCCGGTGCAACGTAAACTGGAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:28d79fabe495
|
40 | — | — | — |
|
ATTCGCCTCGCCCGTAAACACAGGTTTCCGGCCCGTCCAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:56a3edd76f29
|
40 | — | — | — |
|
TACCTCATGCTCGTATCCGGTAACGCCGGAAACAGGGCCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:c26aba0485e1
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCAGGAAGTAAGGTTGACCATTCCGTCCTTGCATCTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:28bb2c898fb6
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTATCCACCCGAACCGGATGTCACAACTTCCGGTACT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:4659d635b41e
|
40 | — | — | — |
|
TATGTTTCCGCTCGGGTTGACCGAACGTAAGCTGGACGTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXB13:PRJEB66722:R3:16013116f67e
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final