ETV1_HOXD10
CAP-SELEX sample HOXD10_ETV1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCGGACAAGCTTGAACCTTCCGCTACGTATGTCCCTGTAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:84307ce949ee
|
40 | — | — | — |
|
AAACGACCGGATGTCCGTAACACATCCGGGCGTACGTCGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:87e17c1d320f
|
40 | — | — | — |
|
CATATTCCCACTCGGGTACGCCGGAAGAGATGTTCCCATC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:1c631e17bb75
|
40 | — | — | — |
|
CAACGTGTGACGATATCCGTTCTGAGCCAAAACGACACCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:f1659903c426
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTACATGCGAAATGTCCGGCAGGAAGCAGCGTGTCGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:5b4b0aef8c85
|
40 | — | — | — |
|
TGCAATCGTTTCCGCTGTATTGACGGAAACGTCCTGCCAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ad9bc5abfec4
|
40 | — | — | — |
|
CTCGAAGCCTGCACATGCCACATCCGCTCTTAAAAAGCCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:01e3342ce99e
|
40 | — | — | — |
|
TGAAGACCGGAAGTGGTTCAACTTCCGGTGCCTAGCTAGG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:65672a250ba2
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTATGTCCGGTGAGGTCAATACCGGAAATGGCGAGAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:b83ea113107d
|
40 | — | — | — |
|
TTGCCGGCGGACGGTAAGTCGCCACTTCCTTCCGCTATAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:d597bae53e70
|
40 | — | — | — |
|
CACGTGCGGATGCGTACTGCGGTAACATGCCCGCTTCCGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:7b41efa58aa3
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGGCCGTTACATCCGGTAAACAGGAAGTTTGGACCGG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:85095147cbb7
|
40 | — | — | — |
|
CAACTGAACCGTGATACGTCATGCGTATCCGGTCTATTCC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:c386ac6bf47c
|
40 | — | — | — |
|
CACACTTCCGGCAGACAACCGGAAGTACACTCCCCGCTGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:969731ad2692
|
40 | — | — | — |
|
CCTTAACCCTGCCGGGACCGGATGTCGCGACTTCCGGTTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:41c9285e9ccf
|
40 | — | — | — |
|
GCTCCCAGGGGTTGATACATCCGGACATTACGGATGTTAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:c37764b6cc2b
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCCTCCGTTCTCTCGAACCGTAAACGTGCCTCCCTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:91df0175d230
|
40 | — | — | — |
|
TGTCGTCTTAACCGGATGTCAAAGTGCGCAACATCCGGTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:f6d83cfb66ad
|
40 | — | — | — |
|
AGACGTGTTTCCGCTCTGAGGAAGTGGAAACACCCATCCA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:cdc516954c58
|
40 | — | — | — |
|
TGCTAGTCCGGTACCAAAACCGGATGCACGCATCCCGGTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ebfde0bca726
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGTATTTCCGCTCGAAGACGGAAATGCCACTTTCCAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:06a316c31f4d
|
40 | — | — | — |
|
AAGTAGATACTCCCTGCTTCCGTAGTCCCACCGTAAGCGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:767f797a8528
|
40 | — | — | — |
|
GGACGATGTGCCGGAAGTGAGCGACGACCTTCCGTGGAGA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:46a0a4439b75
|
40 | — | — | — |
|
CACTGCGCATGTCGTGGAACCGGAAGATACACTTCCGGTA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ff15541a3895
|
40 | — | — | — |
|
CAATTCGTTATCCGCCGACATGTCATGGTTGCTTCCGGCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:cdaf3890b9e8
|
40 | — | — | — |
|
TACGCGACATCCGGAAGTATCCGGCTATGGCGCAATAGTC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:8133d4e15fe0
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGCTTCCGCAGAGCATGCGTGGAGGCAAGTACTTCCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:521e61dba4a8
|
40 | — | — | — |
|
AACAACGGAAATCAGCCCTCAATTTCCGGTGGCTGTAATT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:5c4d24102a6c
|
40 | — | — | — |
|
AAGAAGGATGTTAACGTAAGAACACTTCCGCTCTAATAGG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:05eafab16c9a
|
40 | — | — | — |
|
TTCAGCAGGGTACACGGAAACGCATATGCCGGTACCCACG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:1061e2041f1e
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTAACAGCGGGAACGGCGGTCGTAAGCTGGCATCCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:659ad0d30a85
|
40 | — | — | — |
|
CACCACTTCCGTAGTGGCAGCCATGCTCTACATCCGCTAC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:f1bc09231ffc
|
40 | — | — | — |
|
CCGTACATCCGCCCAAAGCCGTAAGCTACTCCTCGCGAAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:88d44ab4df28
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGATGTTCCGGTGGGGCCAGGAACTGAGCGACGTCCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:d36f00fba8db
|
40 | — | — | — |
|
GAATGCGGCATCCGGTCCATCCTACCTAACCGGATACCGT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:1214b5052b28
|
40 | — | — | — |
|
CAACCATATTGGCCAGGGACGTCCGGAAAGGCGGATATGG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:eb90fc9fd02e
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGATGATTCCGCTTCCGCCATCCGTTGGCTTCCTGCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:5008f17bf539
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTGATAATCCGGCGGAAGCGATAAGCGCGTATTTCCG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ee2391beb71b
|
40 | — | — | — |
|
CGTGTCGCCTGTACCGGATCATTACTGATATCCGGAACGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:c324c26d777c
|
40 | — | — | — |
|
CCACGCGATATGTCCGTAGAGTTCCCTACGTACATCCGCT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:0cf5f9dda865
|
40 | — | — | — |
|
CATTGGCAGCGATGGGAGGCATCCGGCCAGACCTACCAAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:cd05a77bb72f
|
40 | — | — | — |
|
ACGGATGTAGCGTAGGACGCACGTCGTAAAGCCGCGGAAA
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:26310ad67f76
|
40 | — | — | — |
|
TGAATAGACGTTAGACGTGGTTGATACTACTTCCGCTTCC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:f754eaf32b1c
|
40 | — | — | — |
|
TAGTAGTCCCAGGTTATTGCATCCTACGGAAGCAGCGGTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ca1076f9c6c8
|
40 | — | — | — |
|
TTACGACAATACCGTGAAATAGCCGGACATCCGTTCCCGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:c8652a418dff
|
40 | — | — | — |
|
CCAAGTGGGCAGGAAGTGATGACTTCCTGCTTCGCCATGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:d11c5930928c
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTAACGATCCTATTCCGGTCCCTTCCGGACACGCTG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:b66cde08ba90
|
40 | — | — | — |
|
TCGGAACGATATGCACGGCATCCGTTCTCTCCACACTTAT
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ab830c0ccff9
|
40 | — | — | — |
|
CCAGATCCGTGTAACGACACCGGAAAAGTACCGTCGGAAG
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:ea4f4b001a9b
|
40 | — | — | — |
|
CGCGGATGTCGTAACTGCAAGACACCGGAAATGACCGTGC
PANAPTA:P50549:ETV1_HOXD10:PRJEB66722:R3:45e98f58703c
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final