ETV4_HOXB5
CAP-SELEX sample ETV4_HOXB5 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ATTCAAGAACCGTAAGTGACGCACCCACTTCCGGTCCATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:c5a03706fda1
|
40 | — | — | — |
|
TACACAGGACTACCGTATGTGTCACGCTGTACATCCGGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:b505963f6d9e
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTTCTCCCTGTAATTAGCGTTTTCTCCTAATTACAGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:9ec49ed00d33
|
40 | — | — | — |
|
TCACTTCCGGAACTCATTAACTACATTGACGCTGTGCCTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:01786a50769e
|
40 | — | — | — |
|
TGATCAGCACACTTCCGGTGATTACTAAGGCCATTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:573e93548752
|
40 | — | — | — |
|
TTTGAGTTTTCGCCACTTCCGGCGTACTGACCGTAAGTGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:2a14ffe1beef
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGTTCGTAGTTAACCGTAAGTTGCAAAGCTTCCGGTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:0682d68d3587
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGCGAACTTCCGGTACAACCGGAAATCGTTGTCCGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:b86c6c1737bf
|
40 | — | — | — |
|
CATTAACGCCGAACCGGAAGTCATTATCATTATCGCCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:77574cb56c50
|
40 | — | — | — |
|
AATCGGCCGGAAACTCATTGAACTTACGGACGGACGGTGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:a902bcb09555
|
40 | — | — | — |
|
GTTCCTCTTCTGTGCTAATTACCCTTAATTAGTTCACTGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:6bf02b800797
|
40 | — | — | — |
|
ACTTCCGGTCCATAATGACGCTTCGCGTTAGGCCGCAACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:b6534aff2691
|
40 | — | — | — |
|
GCTCGTTAACTGCCGGAAGCACCGGAAGTACAGTGTTTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:7f1b03e9494d
|
40 | — | — | — |
|
AGCCACTCATTAGCGCGTGACTCACTAATGAGCTTCGCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:09da6b3f68f1
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTAATGACACAATAATTGTCATTACTCACTTCCGGTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:0745ee91a80e
|
40 | — | — | — |
|
TAGAATACCGATGCAAACCGTAAGCCTCCCTTCCGGTTTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:e66159f4e6c9
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTGTCTCCGTAACTGTGACCAGTTTCCGGAACAATGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:02054d3a5e96
|
40 | — | — | — |
|
GGACGTAATTAGTGCATCCTCTGTGCTCACATCCGGCACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:e57ca9aae0c1
|
40 | — | — | — |
|
GGCAACTGAAATGATAGATGACGAGTACTATATATGTACT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:107dc3ff5dc6
|
40 | — | — | — |
|
CATAAATTGGCTTTCCGTCATTAATTAGCTTAATGATCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:9ac676e1f784
|
40 | — | — | — |
|
AGTACATAATTACCCTTAATTACGTCACTTCCGGGACCAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:02391ff2a92a
|
40 | — | — | — |
|
ATAGCTTCCGGTACGCGCATAACCGTAAGCTTTCGATCGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:dc8905891be6
|
40 | — | — | — |
|
CACTACTTCCGTTATACATTAGCGGAATAACGTGAAGTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:303b35767713
|
40 | — | — | — |
|
GGAAGTAATTAGAGCATTATCGCTCCTTCCGCCCACACCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:19bd246dbc5a
|
40 | — | — | — |
|
CATTAACGACCGGATGTTATCTAACGACCCCTCGCCCATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:b26aa75a4a7c
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCTTTTGCGCCCGTAAATAGCGCGGCTCATTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:a0e14924e1a7
|
40 | — | — | — |
|
GGAAATGTAAACTCATTTCCGGTTCGACGCCGACATCCCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:7a48d0ade5cd
|
40 | — | — | — |
|
TAGGACTTCCGGTGCAGCGACCATTAGCACCGTAAATATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:4bece99d1f48
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCCTGTCGCTCTGCTTCCGGTTGTCATTAGCCTGATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:ce95a014f2a0
|
40 | — | — | — |
|
CCGTGATTACTTCCGGTCATTAAGGCACTCCGATCCGCGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:3732692699d8
|
40 | — | — | — |
|
CTTGAACCGTAAGTGACAGTTTCATGGTACGCTATCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:0666e9a5e87f
|
40 | — | — | — |
|
AGGGTCAGACCGGAAATGGCTATTTACGTTAACGCGCGCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:6c92785ded7a
|
40 | — | — | — |
|
TTCCCCACTTGACGATACGCACCCGACCGGCCTAACACCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:9a20acb3017d
|
40 | — | — | — |
|
ATGCACGTAAACCAGTTTCCGGCGGTCCCTTTGTGCGCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:4a2e865e2eab
|
40 | — | — | — |
|
TCGTAATTACTACCGGACGTCCGGTCACCTTCATCCGCCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:399f230c4ceb
|
40 | — | — | — |
|
AGCGTGGAATCATTAGCGGGGTCGCTAATGACACGGACAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:8a11afabf989
|
40 | — | — | — |
|
CTTGGACGTCATTAGTGGCTTCCCTCACTTCCGGTCATCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:80d91790895c
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTACCTACCGGAAATGCAATCAAGCCAATCACCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:274830c8b0bb
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCGATGTCCCGTAAGGTACACCTTCCGGTACCCCGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:461db3bebe85
|
40 | — | — | — |
|
CGGCTTAGCTTCCGGTGTGCTGACCACCACCCCGTAAGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:ffbb34cd7fde
|
40 | — | — | — |
|
CTGAGTTGATATCCGGTGCGTAACGACCGGAACTCCGGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:d13822f2e538
|
40 | — | — | — |
|
CGCACGCCGTAAATTCTGAAACCTTCAGGCATTTCCGGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:517606549849
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTACTTCCGGTACCCTCCATTCCCACGTCAATCACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:7961d66d9b99
|
40 | — | — | — |
|
CTTCGCTGCATCCCGTTAATTACTTCCGGTCCCGTTGCAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:0eb9d43b0680
|
40 | — | — | — |
|
CACGAATTGCAAGTCGCTCGCTTCCGAATGCAATTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:d3e48c8fdd31
|
40 | — | — | — |
|
ATCATTTCCTAACACCGCTTCCGGTTGCCATTACGCAACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:da301ac298e4
|
40 | — | — | — |
|
GCGACCACGCAAATACGACCCTAATTACTTTCACTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:bed01313697a
|
40 | — | — | — |
|
CAAGTCATTAGCTGCATCACTAATGAGACATTTTCCTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:16778b6665e4
|
40 | — | — | — |
|
GCTAACCACTTCCGAAACCCATTAAGCCTTACACCCTTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:35de0c5bfb64
|
40 | — | — | — |
|
CGGAAGTACCTCTCCATTACGTACTTCCGGCTTCGGCCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB5:PRJEB66722:R3:ced8d50b48fc
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final