ETV4_HOXB7
CAP-SELEX sample HOXB7_ETV4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CGGATGTGGTCCACGTGAGTCACATCCGCCCTCGCCCGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:16b949e2f57c
|
40 | — | — | — |
|
TGAACCGTAACGAATCGCTTCCGGTATCGACGATGTTCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:455189cb53f9
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCATCCGGCATGGCATTTCCCTCCTCTCCGACTGTGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:6a8a5a1b19f8
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTTTGCTACCTACATCCGGTCCCTGCCCGGAAGTTAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:191e4749f393
|
40 | — | — | — |
|
TCGACGTTGTGGAGGTACTTCCGGTGGCTGCTTGTACAGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:1b531bd8edbe
|
40 | — | — | — |
|
TTACTTCCGTAAGACGATACCGCATTTCCGGACGCATGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:639b8aa6fb61
|
40 | — | — | — |
|
GACAAGTTCCGCCGGATGTGCAACATCGCGGCGAGTGCAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:79690df4f685
|
40 | — | — | — |
|
TTGCGTTGCTTTACGACTCGTCCCTCCGTATCCACTTAAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:e95b552356a2
|
40 | — | — | — |
|
ACAACAGGACGTCGTATGGCACCATCCGCTGTCCTGTCGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:d08712616214
|
40 | — | — | — |
|
ACACGTATTTCCGGTCTACGGCACACCGGAAACGCGTTGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:ebd6a66a5d8e
|
40 | — | — | — |
|
TTGACGCCGGAAGTGAGCTTCCAGCGCGCAACCCTCCTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:85f6b2f8dc7d
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGTCGTCCCCAAGGCCGGATGAGCGCATGCTACATCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:abc6ea830023
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCGCAGGATGTTCTTCATCCGGCCCAGCCGAAAGCAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:ef2c9adf2638
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTAACCGTAACCAGCCGAGTTCCGGTGCCGGTTGAGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:78e3d33fe1e5
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGGCTTGTGACCGGCATACCATACGCTTAGTGGTAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:12eae50a7687
|
40 | — | — | — |
|
CGTTTTTAACTTCCTGTTGTTGCAGGAAGTACTGCACTGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:82ca7fceda03
|
40 | — | — | — |
|
CCGGATACTTGTGTACGCCGTTAGATTGATGACCTCCGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:7d73ed202642
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGTATCTTTTCCGCTTGTGTGGCGTAAATGACGATTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:59c7e9721761
|
40 | — | — | — |
|
CATCCGCCGGCAAGCACGACGTTACTAATAACAAGAGGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:8dfb1d37fdeb
|
40 | — | — | — |
|
ATTCACATCCGATCCGGTGCCACTGCACCGGAGACGTGTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:12156c681682
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTTGTAGCACTTTGGAACACAGTTACATCCGCCTTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:1b807e44a36e
|
40 | — | — | — |
|
GCACATAGTCCGTTAGACATAGCTCTACCGGCCATGTAAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:80ceb3352552
|
40 | — | — | — |
|
AACCACCTATCGATAAGGTTACGGGAGTCCTTCCGATACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:5d8b3d320f60
|
40 | — | — | — |
|
CATCCCGGAAATGCTCGCAATTTACGTTATGGTTGAGCCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:026526f943a3
|
40 | — | — | — |
|
CGACGCGACCCTGCCGTAAGTGTCTCGTCACTTTCCGGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:844e5a8bc4bf
|
40 | — | — | — |
|
GCACGATTCCGTGGGAGGTGGCCTGAAGTAAATACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:e9d77253929f
|
40 | — | — | — |
|
CTGACGACGTAATTAAACCCGGATGCTTCAGGCTCAATGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:fb1b1b8d6979
|
40 | — | — | — |
|
TACCGAAAATCCGGTTTCTGCGCGTTATTCCTAATTGTGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:08ffd17c1d0f
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTTCGCCGTGCATTTTCCGGTTCGTGGCCGTAAAATT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:732ae41c4407
|
40 | — | — | — |
|
CCAGCTGATCCGTAAGTAGCCACTTCCGGTGCCTTGTGGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:ec68656b97d7
|
40 | — | — | — |
|
CGATCGTGCCGTTTCCGCTGCCCGGTCACAACGTAAACTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:b57da02a481f
|
40 | — | — | — |
|
GCCGCGTCATTGACGTAAACTGACCCACAGCATCCGGTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:e86267760232
|
40 | — | — | — |
|
TCACACACCTGATCGTAAGTTCGTATCTGATACTTCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:db2fcaadc158
|
40 | — | — | — |
|
GACATCGCCAGCAACCCTCTGAAGAACACGCCCATAAACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:4dd3c6ed9106
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGGTGCGTTGTCACCGGAATTCTCCACGATGGAGGGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:19077f2e548e
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCCTGCCACCGTATGTAATGCATCCGGCGGAATAGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:791f8b46fd83
|
40 | — | — | — |
|
CGCGACAGCAGCCGTAACTTTAAGTTCCGCTGGACACCGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:7d6041eb310c
|
40 | — | — | — |
|
ATGCAATTACGCAGTATGTCCTGACATCCGGCTGGGTTGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:3b7ef98d782a
|
40 | — | — | — |
|
ATCATCTTGCACGTCCGGCAGCGACCGATACGTGCGCAAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:d570c7df1d48
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAATAATGCCATTTTGCGACAATTTCCGGATACGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:d17ca5dbceea
|
40 | — | — | — |
|
CCGCATCCGGCACCATGGGCTGGGGTACCTCCCTGCCCAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:3c56851fb428
|
40 | — | — | — |
|
TGATGCTGACATCCGGTTTACCACGCTGCATTTCCGCGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:d6b488cb694f
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTATTGATTTACTTCCGTCCCCTACTTCGAGACCCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:745d5123843d
|
40 | — | — | — |
|
TGACACAACACTTCCTTACTACATGTAGGCCGCCCCGGAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:be17e36e5fb6
|
40 | — | — | — |
|
TACTCAGCTCCGCTTCCAGGGTTTCACACTTGAGTCTACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:6c138a7c7332
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGCCTGTTAACAGGATCCTGCCCGTCTACCGTCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:d15bd9d11813
|
40 | — | — | — |
|
TAGCATTGTCTTAATGTACGCTGCAGTATGTGCTTGTAGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:aa7acdbf0641
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGGAAATGCACCTACTTTGTAATCACTTACTCTTGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:022931748065
|
40 | — | — | — |
|
CGTCGAGCGGAAACGTATGGATGTTTCCGCTCAGAAAGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:2160c6c23096
|
40 | — | — | — |
|
CATATTCATTATCCGTTGCCGCATTGCCGCTCCACTTCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXB7:PRJEB66722:R3:1dc3b84b26dc
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final