ETV4_HOXC10
CAP-SELEX sample ETV4_HOXC10 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TGGTTTGGGGAGAGAAGGCTACGAATCCTTGCGTCCATAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:fdf1d19acb59
|
40 | — | — | — |
|
TTCACACCGTAAATCGTATTTCCGGTACTGAGGTCGTCCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:cdd25b4bc896
|
40 | — | — | — |
|
CACGCCACACTTCGTACTGCAAAACCCATGCCTACCAGAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:5a27ffefe562
|
40 | — | — | — |
|
CGAAGCTGCCCGTAAGCGCGCTTCCGGGCGTAGGCCGCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:af6104cb6c40
|
40 | — | — | — |
|
TACGACTCCAATCTCGTACCTCGCTACGAAGCGAACAGAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:b61464a9b6fc
|
40 | — | — | — |
|
AAGTACCGGATGTAGACAAGTGGTACTTCCGGTACTCAAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:8afd65258368
|
40 | — | — | — |
|
GAAAGGGACAGCCGTAAAGCGTTTTAGCCTTCCGGCGTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:d769a88434fe
|
40 | — | — | — |
|
AACGAACGCAGCACCGTAAGATAACTTCCGGCCGTGCTAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:1011ca2ca734
|
40 | — | — | — |
|
CCACGCGTAAGTCTAACTTCCGGTGCCTTGACCCCGCCGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:38c204409554
|
40 | — | — | — |
|
ATGACCATCTCAATAATATCGATCGTAAACTGCATTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:863b7b63fc70
|
40 | — | — | — |
|
ACCCTGCCTCAGACCTGATGGTTGTGGCATTGCTTTGTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:e51c3797a09a
|
40 | — | — | — |
|
AGTTAGGTGTCAGTATGAGAATCATCCGGACATCCAAAAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:bf84d7c21abe
|
40 | — | — | — |
|
ATAGGCTTACCGTAAGTCAATAGACTCTCCGGTCCACCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:7449bc225f46
|
40 | — | — | — |
|
GTTTCACCGTAAGTTTTACCTCCGGTGAAGTTGCTAGACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:2787498218fb
|
40 | — | — | — |
|
GAATTAAGCACCGTAAGCGTATATTCGATGTGCTTCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:3809a5ee6904
|
40 | — | — | — |
|
TAAAACCGATAAGTAAAGCTAATGACATCCGGTTAAGCTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:0f8b416db054
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTAATGACCGTATGGGCCCGTAAGCTTCGCGCTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:1bc35df2cab2
|
40 | — | — | — |
|
TACCGCTAGCGTAAGTGGCACTTCCGCTTGCGATCAGAAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:719244b2cb18
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGACAGCCCAGACGGAAGCGGTACACACACGCTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:1ce69d4df3df
|
40 | — | — | — |
|
TGGAAAGAACACCGTGTAAATCATCATTTCCGGTCTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:22623b2b0154
|
40 | — | — | — |
|
GAGTGGGTTTGCCGATAAGTACACGAGTAAACTTCCGGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:f89d601c1d3d
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTGTGATTTCCGGTGCTATGCGCGCGTAAAAAGCCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:95da6bfb5b1d
|
40 | — | — | — |
|
GAAATCTTACATGACATATCCGGCTTGCCGTAAATGGCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:8c8a9d3a0fc9
|
40 | — | — | — |
|
GCATCTCAGTCACACCGGAAGTACGTTAACTTCCGCGTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:31bb39651466
|
40 | — | — | — |
|
TTTTAACCGGATGTCAAGACATACTGTTACTCTCTTGTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:eb7d077a3dd5
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGAACGCGAAAGTCGTAGCATACCTCCTCGACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:70020712c765
|
40 | — | — | — |
|
GTCCGCCGTAAACAAAGTGAAATGTTGCCGGCGTGAGTCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:200abc6f16a7
|
40 | — | — | — |
|
TCGTATGGGGTGACTGGGGCCGTAAGTCAAACTTCCGGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:739d694c175c
|
40 | — | — | — |
|
TATGGACATGGATTCAGCGCGCCCCATACATTACGCAGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:27082d00b3fe
|
40 | — | — | — |
|
TGGACACAGGTCACAAATGAGAACGTAAGCGAGGCTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:17d05bc07116
|
40 | — | — | — |
|
GGTAAAATTTAATTACAGAACATAAAAATGTTTACGTCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:952ce293e45b
|
40 | — | — | — |
|
CGTATGTAAGGGCAGTCGCTACGTAAATGTATCATTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:50f7820eb36e
|
40 | — | — | — |
|
CAAATACCGAGAAGTCCCAACTTCCGGTAGGCGAATGATT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:1463160fdd84
|
40 | — | — | — |
|
GGTCGACCGGATGCGTGTGCTTCCTGTCGTATCAGATACT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:f58657e1ad7f
|
40 | — | — | — |
|
CGGCGGTAGCGTAAGTGTATGTTGAACCACTTCCGGTCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:a4781e4e3cb1
|
40 | — | — | — |
|
CTATCTAATTGGTTCCGGTATGTAACCGTAACCTGGGGAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:74c27e82dce4
|
40 | — | — | — |
|
ACGCGTGGTCCATAGAACGTAAGTCCTTGAAGGCACTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:11d0897cd3f1
|
40 | — | — | — |
|
TCAACGTAAGTGTACTTCCGGAGCCTGATCCAGGTGGACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:3bde3329e951
|
40 | — | — | — |
|
GACCGGATTATTATGATGATGCGTAAGTTTATGACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:493fa124231e
|
40 | — | — | — |
|
ATTATTCGCTCAACGGAAATGATGTGTTAGACCATTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:3a27d1bd0def
|
40 | — | — | — |
|
TGGACAGTGTATTATGCAATACATGCCAGTGTGCACGTAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:8aee7c4d2e11
|
40 | — | — | — |
|
AAAAGGATCAGGTTCCTAAACCGGAAACTCTGGCACAGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:17b7bd3806b9
|
40 | — | — | — |
|
AATGGTAAACAGGAAGCTGCCTACTCTGCTTCCGGTTTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:1a35897c28f0
|
40 | — | — | — |
|
GCGTAGGGTGGAACCGATAAATCAGGCACATCCGGTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:2d98b3e81d0b
|
40 | — | — | — |
|
TAGGGCAGGAAGCTGGAGCTTCCGGCCGCTCCTTTAACAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:f253ef73437a
|
40 | — | — | — |
|
TATTGGATAACGTAACTAGCAGTTCCGTTATCGCTAGTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:6db41b96a43b
|
40 | — | — | — |
|
GTCAAGGTTGACCGTACGTTTCGTCACGTCCGGTCGTGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:effaaff3f052
|
40 | — | — | — |
|
ATCCGGAAAGTAAGTACGGACTTCCGTTCCGCAGAGCTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:10651afcb3c4
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAGTGCGTTATCTTGTCAATGATCCTTCGCACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:c22579e9aee7
|
40 | — | — | — |
|
CCTGCCAGTCTACCGCAGGCGGAAGTACTTTGTACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC10:PRJEB66722:R3:03e25c9ee7b3
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final