ETV4_HOXC11
CAP-SELEX sample HOXC11_ETV4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GTAAAGTACCGCGAAGTACTACATCCGGTACTTACTGGGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:0dc77021a872
|
40 | — | — | — |
|
GTGGTATGAGCACGGAAATGGCTGCATTAAGACATTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:b5f231383497
|
40 | — | — | — |
|
TTGGGCTAGCCGTAAACACGTTTCCGCCTCGCGATATCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:1b82e2bdf8e1
|
40 | — | — | — |
|
TAGGACATCCGGAACACACTGTTACCGGATGTGGGAATCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:dd00f319fc08
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGCCATCGTAAACAGCGTGCTTCCGATGACATGCACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:6c583b1f833b
|
40 | — | — | — |
|
GTGCCGGAAGTCATCACTTGCCGGTACACTTGCGGCCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:46c7a306ac29
|
40 | — | — | — |
|
CAGTACATCCGCGTAACACTCATGTTCCGCCTATGTCCTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:9a5a798a29bf
|
40 | — | — | — |
|
TCTCATGTGCGTAAACTTGTTTCCGCACCTATTCAAGGAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:2aa5409687c7
|
40 | — | — | — |
|
TGCCGTATATACCGGATGCTCTTCCCGCTCGCATCCGGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:da2a812b9844
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGGAAGATCAGCTTCCTTACGGCTACGTTACAGAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:d91884af975e
|
40 | — | — | — |
|
CCACCGGCGGACAGGAAATGGAGCAACATCCGGCCCGCCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:d5c746f2cd73
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCCGGGCGTTACCACCATAACGCCACTGAAGTAGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:b1ee85193af2
|
40 | — | — | — |
|
TCCCACCTTGCTACCGGACTGCGCTACACACATCCGGTCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:c375a54fe47b
|
40 | — | — | — |
|
CGTAAATGAGTATTCGGTAAATAAACATTTCCGTCCGGGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:02afb6dc533c
|
40 | — | — | — |
|
CGTGGACGCACGGTAATAAACGTACTTCCGGAAACGAACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:64a313edf0b2
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCTCACTTCCGCCATCCTCGACGGAAGTTTGTCGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:cfd135b1c22e
|
40 | — | — | — |
|
GCACACCGTTCATCCGGCGGAATCAAGTCTTCCGCCGTAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:729d035428b8
|
40 | — | — | — |
|
AATGCGCGACGGAAGTAGTTATGCATGCTTCCTGTCTGCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:346a11490c19
|
40 | — | — | — |
|
TTCCGATTTCCGGAAGTCTGCCCACCATCCACCACTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:91af3e26b2be
|
40 | — | — | — |
|
TAAACGCGGAAGGAAGCTAAGTAGCTCTCCGTCCGGTTTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:cebaaf23d60c
|
40 | — | — | — |
|
GCCGATAAGTAATTAATGCACAGTCGCATTCTTCACTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:637986f0de44
|
40 | — | — | — |
|
GTCATGGACCAGGAAACATTGCACGTACGTAGGACGTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:002bd1430e9d
|
40 | — | — | — |
|
TCACAGCTTACGACTGGTCGGAAGCGAGACACATCCGGTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:fad46195b3be
|
40 | — | — | — |
|
TTCTGCTGCGGATACACCCAATCGTGCCTTCCGCCAGCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:a16724e7bde1
|
40 | — | — | — |
|
CATTTAACGACGCGACTGGTAAGTTAACTTCCGGTAACGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:9c5990afeafa
|
40 | — | — | — |
|
GTTATCGGCACTACCACGTCCGGTCCACCTACCGTACGTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:202d4c3980a5
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACCACTTCCGGTACCTATGTCGACTTCCCGTAAGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:0176421273c3
|
40 | — | — | — |
|
TGCGGACCGGAAGACGTTTAATGGCCATCCGGTCCAAATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:9324af40caa7
|
40 | — | — | — |
|
CCAGCAATCGTAAATTGACTTCCGCTTCCTGTTGGCTACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:27daf8f1ba8f
|
40 | — | — | — |
|
CTACCGTAAATGTTTGCTCAACGTACGAAATCATTTCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:2882c25c5b51
|
40 | — | — | — |
|
CCCTTACGTTTCCGGAAGACGTTCTTCCGGCACGTTCCAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:4239a6ccca71
|
40 | — | — | — |
|
ACCACCGGCAGGATACTTGCATCCGGCCGCTGGTCACTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:4d98164cc7ee
|
40 | — | — | — |
|
CGCCACCAAATCGTAAGGATGTCGTGGAACAGTCCTTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:82b6122bdcd4
|
40 | — | — | — |
|
CCAATGTGCGAATCGTAAATGGTTCAGCTTCCGATGCACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:5012c685ce9d
|
40 | — | — | — |
|
TGTCACGTTAAGTTCCTAAAGCGAACTTCCGCTCAGCGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:08dc3ce0f0d6
|
40 | — | — | — |
|
TGCACATCGTTAAGCACTTCCCTGCTTCCGATCGAGTAAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:ae63c611cfbc
|
40 | — | — | — |
|
TTAACGATTAAACTTAGTTTAACTGACAGTTTCCGCTATT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:994fd9f9ee4d
|
40 | — | — | — |
|
GCGGTCTCCGGTAAGTAAGAGACATCCGGATACCACTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:b8d7df96e40a
|
40 | — | — | — |
|
GCTGCTAGGAGGGATCCGCAATACATACGTAACCACCGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:7652e476318f
|
40 | — | — | — |
|
AGTTTTAGACAGAGGGCTGCTCGATGTTGCCCGTGTAACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:b33e2c9c1022
|
40 | — | — | — |
|
CCCCACGCACTATCGCTCCGCCTGACCCTTTACCCCTCTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:7ce86103c69d
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCTTATACCGGAGGCAGGTCATCGATTCGCTTCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:ad9273d0064a
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGGTTTTCCGGAAGTATTGGATCACTTCCGGACTTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:8622c801f465
|
40 | — | — | — |
|
CATTATTTCCTTAACATTTACGACGTAACATCCGGTATCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:a3cdbabd4dd3
|
40 | — | — | — |
|
CCCACCAAATCGCGGATACGGACGTGGGACGTCCGTTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:af27560b94bd
|
40 | — | — | — |
|
CCATGCAAATTAGCAAACCCGTTATGCGTACGCACACTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:97abac4fe001
|
40 | — | — | — |
|
AATCCGGCCGGATACGTGGTATACGGCCAGACGACGAAAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:8401b40af2af
|
40 | — | — | — |
|
CACACATCGCAAGTAAGTCCACTTCCGTCCGCTGTTTTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:9ab2f60a7863
|
40 | — | — | — |
|
CAAAAGCGGAAATCCTCGTAACATGCGTGGCATCCGTCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:0c45026a1c30
|
40 | — | — | — |
|
GAGGACCGAGATGCAGGGACGTAGGTATTTACCTCCGTCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXC11:PRJEB66722:R3:669dc5bba578
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final