ETV4_HOXD10
CAP-SELEX sample HOXD10_ETV4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCATATCTACAATTACTAACGTCCGGGTAGCACTTCCCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:12fef0dec09d
|
40 | — | — | — |
|
CCATCAATCCGCGTAAGGAAGTCAGACGTCCATCCGCGCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:5ad437190d17
|
40 | — | — | — |
|
ACCACAACGGTAAGCGGTGCTTCCGGTGGACACGAACGCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:d8ec50f23b70
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGCCCACGTATGTTAACATCCGCGGGCGTCATCGTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:7ca8cd30112b
|
40 | — | — | — |
|
ACCACATGCGGACGGATGCAACGCGTCCTTCCTCACCGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:4a2cad105a08
|
40 | — | — | — |
|
CTCACTCCGCGGCTAACGTAACCAAGGTGCCGCTCGCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:eaf3b7c0f632
|
40 | — | — | — |
|
CACAAATGGCGGCATGATACGTAAGTTAACTTCCGACATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:b87cbab3cedc
|
40 | — | — | — |
|
TGGTTCCGTCCTCCGTCGTCACGGTGTAAGGAACCTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:755acf76df34
|
40 | — | — | — |
|
GGTCATGAGCTGTAAGTCTGTGACTTCCGGCACACGCTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:c024d209f15f
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTGACGTAAGTGAGGGCATTCATGTCCGTTAACTGCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:86dcf602c291
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCACGGGTAGCCCGTACGTTCACGTCCGGCCTTGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:37d5beb06b2c
|
40 | — | — | — |
|
CCACTCCCATCATAAGCGTAAAAAGACCAAAACAATGTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:f12eeb90a7a8
|
40 | — | — | — |
|
ACGTCATCCGGAAGTGCGTAAGCCGCTCTTCCGCACTTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:c69538f6ecf9
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTAACGCAGCAGAGCATCACGTGGTACTTCCGGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:00218d7d2fad
|
40 | — | — | — |
|
GCACGTTTCCGGTGATAGAGACCGGAAATCGTTTAACGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:ec9373b4c0be
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCAGCGGTAAGGACGTTCAACCACTACGTCCGTCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:117262494031
|
40 | — | — | — |
|
ATCGTTAGGCCGTAACAAAGCGTATCCGGCCACGCAACGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:e049deff8381
|
40 | — | — | — |
|
TATTCCTTCCGTAAGCGAGCGTCCGGAGAGCAATAAGGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:15c73114e320
|
40 | — | — | — |
|
TTGTACTCCGGAAGTGTTCTCTTGCCACTTCCGGTGATGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:ed66001f00d3
|
40 | — | — | — |
|
CAGGTGCGTAACCGCGTGAACCTCCGCCCCGGTTCCGCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:76626a6b76dc
|
40 | — | — | — |
|
CATCAGCCGTAAATTCGGTTACTCCATTTCCGTATGACGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:92a562564d22
|
40 | — | — | — |
|
CCACTGCCTTCCGGCCCTCCCGCCGCCGGAAGGTGTTGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:c9f3d02e400b
|
40 | — | — | — |
|
AAGGGACAGCGTAAGTTCTCACTCCCGCTGTTACGGCTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:1b7959310590
|
40 | — | — | — |
|
TTCAACCAAAGGAAGTGGACTTCCGTTGTAACGACGACAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:dc3be8f59f69
|
40 | — | — | — |
|
AGGACGTAAATTACTTAGACTTGAGCTAAGCCGTTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:10b79ab66337
|
40 | — | — | — |
|
GCATGGGTATGGACTAAACCGAGCCGCCAACATCTTTGCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:9012097aeb25
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAATAAAGTAAGTAGTGATACTTCCGTTTTAGACGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:4b658dcb0601
|
40 | — | — | — |
|
TGTACCCGAATACGTGAAACCAGTTTCCGATTCGAGATGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:7db33bc9453d
|
40 | — | — | — |
|
GCCATTTCACGAGACACGGCGTGTCCGGTAATGGCCTTAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:eb5c60ca8f38
|
40 | — | — | — |
|
TAAGGGTACGTAAGTAGCACGTGCCGTACCCGGACCTTCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:8e42a829c875
|
40 | — | — | — |
|
GGGATCTGCCGGTAAGCTGGACTTCCGGCAGTCACGCTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:f93dfa0e57ec
|
40 | — | — | — |
|
CCTTCCGCATCCGTTATAAGTAAAACGTATGCGTGCTACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:9f71a67bfe16
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTGCCGTACTGTCCGTAAACACTGTTTCCGGCGCGCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:367a66ffd2ed
|
40 | — | — | — |
|
CTTGCTTCCGTACACGTGTGTGTCCGGATGTCAGGCATTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:ce9a6b4bfd02
|
40 | — | — | — |
|
ATAGGACATCCGTTGTTTGCGGATGTCAGTCCGTGAACGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:434af098dea9
|
40 | — | — | — |
|
GGCATCCGGTACTAAACACAGACCGGATGCCTTTCGCGTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:19966ceb4acd
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCCTGCGATATCGCCGGAAACGCTATGGTAGCCACT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:a1793e18566a
|
40 | — | — | — |
|
GACTGTGTAATTAACCTCGCCGGACTACGGGAACAACCGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:d33e4a279b3f
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGTAACCTGCTTACTTCCCGCCGGTTCCGGGGAATCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:5df5c994ec84
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCTACCTCCGTGCGTAAATCGTAATCTCCGCCCGAAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:9e0e089c66bb
|
40 | — | — | — |
|
GGTCCGGCGCGTTAAACTAGTCGTTTCCGGCCTCGAGGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:5fa499d0b63a
|
40 | — | — | — |
|
AATCCGTTGCGCTAAGTTGGCACTTCCGCCCGGAGATGAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:d9e15606b3db
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAGCTTCCGCGTAATGACCCATTTCCGCAACGAACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:24a3a1dd1176
|
40 | — | — | — |
|
GGTACCGCTCCCGACGTTCCGGGGTAACCACGTAACGGAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:52ee1757fc72
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGAAGGCCGTAACAACGATGAGCTCCGGCCTTCGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:470267728e87
|
40 | — | — | — |
|
CGGTCGCTTCCGGCCATGTCAGGAAGCATGCTTGCCCTTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:4076bec01569
|
40 | — | — | — |
|
CAACGCCCGACGAGAAGGAACCCTGCCGTCGATACGTGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:b78eb38eccf0
|
40 | — | — | — |
|
AACCGTAAAGATACCGTAAGCACGCACGTCCTTCCGGTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:19d2cf95c00f
|
40 | — | — | — |
|
GATGATGAACGTAAATCTACTCGCTTTCCGCATCATCTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:e811c5c10cd9
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCGGAACCGTAGGTACACCTCCGGTCCGACTGTATTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD10:PRJEB66722:R3:e70be8b1a472
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final