ETV4_HOXD1
CAP-SELEX sample HOXD1_ETV4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CTTCGCATCCGCTGCCCTGCACGAAGCCTACTTCCCACAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ecf61a823c4b
|
40 | — | — | — |
|
GCATCCGATCGCGCGCGCATCCGCCCGACGATCCCAGGAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:705075cbc386
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGACTCAACGCTGTTCCGGCAGGACATCCTTTTTTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ab0687472557
|
40 | — | — | — |
|
TGGAACACTGTTTCCGGTCCGTTGGCGAACACGAAACCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:d59399aace0f
|
40 | — | — | — |
|
AACGTCGTAAGCATGCACGCATCGCGATCGAACGGCAGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:2e29bf7833b8
|
40 | — | — | — |
|
TACAGTATGTCCTTCAACACCGGTACATCCTGTCATGTTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:5f622eb47053
|
40 | — | — | — |
|
GCATCCGTTCCCTCCCAGACCGGAACTACAGCTCACGTCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:9ad54f9ede06
|
40 | — | — | — |
|
CTAGATGTCGCATGTCCGGTTCCGCTGCCACCTACTATGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:edc86624db83
|
40 | — | — | — |
|
CTAGGTGTTCCGGCATTGTGCACGTAACACGGAACGTACT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:701904e47680
|
40 | — | — | — |
|
CGGCGGGCACCCGACCGACCGTACACTTGCCGCGCGTCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:2c076bb624ee
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCCGAGGCCGTATGCAGGCATCCCGACCCGGGTGAAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:bb695a3b6f06
|
40 | — | — | — |
|
CTAGAGTGACGATAACACAGCCGTGCATCCGATTGGAGGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:4712c47fea30
|
40 | — | — | — |
|
GTTATCGCACATATCCGGCCGGATAGAAACACGAGCTAAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ac56bae31e5d
|
40 | — | — | — |
|
GGGTTCCGGCAAGTATCGAGTCCGGCCATCGGAAGCACTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:034ffc84ad7b
|
40 | — | — | — |
|
CAGTCCCCCGCTGTACCCATCCTGCACCGGAACCGAACAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:716df4e13bc6
|
40 | — | — | — |
|
CATCCGCTTCCCTTCCCAGTAGTACTTCTGACCAGCCATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:a1064f8541a8
|
40 | — | — | — |
|
CTTATCCGTCGCCAACTTCCGGTCCGGAAGCGAACGGACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:3d8454fe7f23
|
40 | — | — | — |
|
GGGCTAGCGGAAATCAATTATGAAAAGGTGTTGTGTTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:e76ae2d79a04
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCCTCGAGCGTAAGTTGCGAACTTCCGGCATCCGATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:73378e033b6f
|
40 | — | — | — |
|
GGTTCCGCACGAGCCATTTCCGTTACGCAGTCCTGGCTAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:8204daa4efe5
|
40 | — | — | — |
|
ACTAACACATTGCGTCCACTGCCAACTTCCGCTTCCTGGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:763ddce948e0
|
40 | — | — | — |
|
ATGCTAGGCCTATGGACGCGCTTCCGTATACAGCGTAAGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:2d7f30ebc15e
|
40 | — | — | — |
|
ACGAAGTCTTCCCATCCGGTTCCGTCGCGCGACCCGAGGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:719b624b2807
|
40 | — | — | — |
|
CACCCGCTCACGTCACAGCTTGGCTCGCTAACTACATCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ebf5371b1400
|
40 | — | — | — |
|
TACATCTTCCGGTCACGGGACGCGGCGTAAGGGCGTTCTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:0d469d683d0f
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGGCTGCTCCGCGCCTTCGCGACCTGTTCTGTTTCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:6410cc7a52d7
|
40 | — | — | — |
|
GCCATTTGAACCGGAAATCAATTTCCGATTCAACATATTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:2e021e637b41
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCTAGCATCCGCTTCCGCCCCTACCTCGATAACCACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:e5b44fd5bc1e
|
40 | — | — | — |
|
GTCCACGTAGCCGATGTACCTGAAGTCCCACAGACATCCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ffcac7035018
|
40 | — | — | — |
|
GCGTAACGGACGTGATTGGGGTTACGCTTCCGCAACCCAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:5d6a9e4fe1ee
|
40 | — | — | — |
|
CCAAACCGGAGACGCACCAAACGGAACTGCCAAACCATTT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:86b5917c8039
|
40 | — | — | — |
|
TAACGGAATTGTGCTTAACTAAGGAACGCGACTTCCGTTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:47c9d6a6dad5
|
40 | — | — | — |
|
GTACATCCGACACGTTATCCTCGAGTGACCGGAAACTAGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:7a54e2815bad
|
40 | — | — | — |
|
CATGCCGACCTGATGCCTACCACATCCTGCCTGCCCCGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:bdc69cd80f38
|
40 | — | — | — |
|
TCCGACCACGGATGTAGCGATGCTGCGTCCGGGCTTCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:6105c4d7d256
|
40 | — | — | — |
|
CCTAACTTCCCGACAACTAACCGGCTACCATGCTACGGAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:760e89844d24
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCGGAGCAACAGCGCGTACGATATCCGGTGAAAACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:a08822f672ec
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTCCCGGACATCCGTGCATATCCGCCACCTTTTTATC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:bd0e6047cc1c
|
40 | — | — | — |
|
GCAATATACGCACGTATACCTCCTTCCGCGAACGATATCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:353b9d29ebea
|
40 | — | — | — |
|
TTCGCGTTCCCCTTTCCGACATCGCGATAAAGTCACTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:6125dc8db4b8
|
40 | — | — | — |
|
CCGGAAGTGGCAGAATGAATCGTCGCCAACGCTACCACAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:ff6186786a13
|
40 | — | — | — |
|
TCCATCCGTCCGCATCGTTCCCACTGTAACCGTTGTTACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:52f7d8999839
|
40 | — | — | — |
|
AGGTCGCATCCGATCTCGCCGGTACGTACTCGCATGTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:f09360514ee7
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCGAATCTAACATCCGGTGATGCATGCCTTCCTGTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:eb7c6f60d6cd
|
40 | — | — | — |
|
GCGCATAACATCCGCGACCCGAGCGGATGTTCCTACACAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:151623bad556
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCGTCCCATACGAACGATTTCCGGTCCCCTTCCTCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:d6b1c9a042d5
|
40 | — | — | — |
|
GCGATCGACACGCGATGCGGATTCCGCATCCGGTACAACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:328f88ed1763
|
40 | — | — | — |
|
TAAGGATGCCAAACTTCCGCTAATTCCTAATCTCTGTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:5682056f936a
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTAACAGTCCTTCCTCCCCAAGGAAGCACCTGGTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:262525d7e32e
|
40 | — | — | — |
|
ATCGAGTACGGAAATGATCATCATGCACTACCGGTTCTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD1:PRJEB66722:R3:32e28d9db111
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final