ETV4_HOXD9
CAP-SELEX sample HOXD9_ETV4 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACAGTAACGAAAGGACGTGAATACATCCGTCCGTTTACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:f11e71ae149d
|
40 | — | — | — |
|
CAACACAGGAAGCCACTTCAACAGACTCCTCATGCACGCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:19a7f99012b3
|
40 | — | — | — |
|
ACGCTTGGAATTTTATCACTCTAACCGTATTGCATCCGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:b4eb9de79956
|
40 | — | — | — |
|
CTATGACCGTACGTCCACGTCCGGTCACAGCGACTTCGCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:377393fb19d2
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTTCCCGCTAAACGAGATTTCCCGCGAAAGATGTTAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:695c34ae740c
|
40 | — | — | — |
|
AGACGCGGTGGTTAAGGAAGTAGTACTTCCGTCCTCCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:a99d5e627c0e
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGTAATCGTAAACCAGTTTCCGATTCCGGCGACGTGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:a7940e012add
|
40 | — | — | — |
|
GTCGCGATGGAAGGAACAAAGTTTCCGGCCGTCGCGCGCA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:b21b5f8a2aaf
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGCTGCAGTAACAGTGAAGCACAGCATCCTGTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:c6e132ba9124
|
40 | — | — | — |
|
ATAGCCAAGTCGTAAATTCGATATTGCCGTCTTGGCACTG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:015d394fd9a7
|
40 | — | — | — |
|
TTCAAACGTAAGGAAACGAGATGTCCTTCCGGTGCTCCAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:976d873f9652
|
40 | — | — | — |
|
CGCAGCACCGACGCCACTCGACGGAAGTCAACTTCCGGAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:f40b609f3134
|
40 | — | — | — |
|
GGTGAACCGGAAGGAAGACCACCTTCTCGTCCGGTTTTGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:e794eafd77c8
|
40 | — | — | — |
|
CGTATGCAGTAAGCGTAAAGGAGATGGCCATTCCGCTTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:e83de4550414
|
40 | — | — | — |
|
CACGGCAAGGCGGAAGGAAGACCCTCTTCCTTCCGGCCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:2781c2c9113b
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCATCCGTCCGGGCACGATGTATGGTTCCCGGAAGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:f8f59e276c5d
|
40 | — | — | — |
|
GGCCCGAACGAACTTCCGGCGTGATGCACCGGAAGTGACC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:0cc637ebee2b
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCGGATGCCCTACCATTATCCGAGCATCCTGTCGTAG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:5c4a6deb158a
|
40 | — | — | — |
|
TGCAGGAAGGAAGTGCACCCGAAGTCGCGTACTTCCGTCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:8d9f0c07b6ac
|
40 | — | — | — |
|
AGCACGCACACAGTCCGTCCGGCACATTGCACCGGAAGTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:5b8cf0f63fd2
|
40 | — | — | — |
|
CTCCGCGCGAACGAGAACGACACCGTAAGCAGGCTTCCGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:776b3f79d993
|
40 | — | — | — |
|
CGCATCGTGAGACGTAAACAGCCTGTTTCCGCTACCCGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:3768830c0d4a
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTAGACGTAAGTGAACGTTCCGTCAGCATGTTGGCGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:c2603f5b3a3c
|
40 | — | — | — |
|
CATTTGAGCGCGAAATCGTACATAGATATCCGTTTCCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:d20b4371c2f4
|
40 | — | — | — |
|
GATGGACCGAGAAGTACATTTAATGTCCGTCCGGCCTATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:de96ae98e874
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCATCCGACAATACGTAAGGCAACGATGGCCTTCCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:8440918d1a15
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAGCGTAAGGATGTATCTACACCCGTCCGCTTAATCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:09c2f38934db
|
40 | — | — | — |
|
CCACAGCGTAAGTATAATGTATCATCCGTCCGCCCTGAGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:2ca3ef9bcb9f
|
40 | — | — | — |
|
GGCAGTCCTGGTGCTTCCGGTGTTCCGTAAGCAGGCATGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:921c2cfc49a4
|
40 | — | — | — |
|
CGTAGCGTGGAATAAGGAAGTACTCTACTTCCGTCCCACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:59b7c3448c02
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTTCCGAGATCCGTACGCGGGACGATCCGGTTCCGGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:e37e9713647c
|
40 | — | — | — |
|
GTGGCCGAAGCGTAAATGAGCTCCTTTCCGCTTACCGCCT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:e00a9e1cc765
|
40 | — | — | — |
|
GGCGAAAGGAAGCTATCGCGTTCCGTCCGCCTTACGGGCC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:4fb5cd6d46c5
|
40 | — | — | — |
|
TGTCCCGTAAGCGAGTAAGCTTATCGCATCCGCTTCCGGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:399c165384df
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGCGAGAACTGAAGTTGTGTATACTTCCGTTCCGCTC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:e7cb8d7c4763
|
40 | — | — | — |
|
ACAGGAAGTAAGCACTAGCTTCCGTCCTGTTTCTTGCTGT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:d0b20f26c660
|
40 | — | — | — |
|
ACCGGCAGTCTACTTACGGTCCCGATCCTATTCCGCTCGC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:50a9fb007365
|
40 | — | — | — |
|
AGCGGAAAGGATATAAGAACAAATATCCGTCCGCTAGACA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:63775d704d2b
|
40 | — | — | — |
|
ATGCCCGAACCGTACGGTGGCGTCCGGTTCCGGCCCTTCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:43dbf6d35064
|
40 | — | — | — |
|
AACAACACGCGGTAACGAAGGACTGGCGTTCCGGTGTTGG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:4ab900b311fe
|
40 | — | — | — |
|
CTCGTTGAGCGTAACCTAAGTGAGGTTCCGTCACATGATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:057f70a47cf0
|
40 | — | — | — |
|
TGTTGCGTCACATCCGTAGAGACTAAGTATGTAACAGACG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:61e3d51a760a
|
40 | — | — | — |
|
CAGCCAGGCCGGAAGTAGCTAAGTCACTTCCGGCCATCTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:6bf06ec7fc07
|
40 | — | — | — |
|
GAGTTACTTCCGTTGATAAAACGACGGTAAGTTCTAGCAA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:9d2faa02b6c0
|
40 | — | — | — |
|
CTATTCTTCCGGTATGTCTCACATCCGGAAGTTTGATATG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:849f3e64b0c1
|
40 | — | — | — |
|
CCACGGTACTTCCGCATGCCAATACGGAAGTAGGCTATCG
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:dba55bcd184f
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGTAATCGCGAATCTAAGATTCCGGTTCCGCTATCAC
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:a702a6d9845f
|
40 | — | — | — |
|
GTGTGGATTAAGATCTATCGTAAGCTAGTGAAGCATCCGA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:7ff21fcb7145
|
40 | — | — | — |
|
AGAGCCACTCCACACCACAGCATATCGACTCGGCACGCAT
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:a12a8f99d10d
|
40 | — | — | — |
|
TACGATAGTTCCGCGTAAGCAAGGTGTTTCCGCCTAACTA
PANAPTA:P43268:ETV4_HOXD9:PRJEB66722:R3:948e6997be0f
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final