ETV5_HOXB13
CAP-SELEX sample HOXB13_ETV5 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GCAAAACACTGAAATGATGACGTCAGCACAGTGACGCACA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:aa145ba4bced
|
40 | — | — | — |
|
CTGCTACCAAGTACGACATTCTCGCGTGCACACGGGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:8ef9647cd2d7
|
40 | — | — | — |
|
CGGCCCCAGCTTCCGGCCGACACTGTTGTTTCCGGTTGCA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:5295ceb1adbd
|
40 | — | — | — |
|
AGAATCACGCGCCACGTACCGCACAAAAGGCGTTGTATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:91a66c289ff1
|
40 | — | — | — |
|
ACCATCCTGATTCCTCATGAACACAATGACGCCATTGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:986fbf45fc0d
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTATACGCCTTACCTTCCGCTGACGTCACCAGACTCA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:979f49326266
|
40 | — | — | — |
|
ACAGCCTGTCGCTGCATAGCCGGTATCATGTCCTCGGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:f11fd8d61aac
|
40 | — | — | — |
|
CCCCGATATGAATGCGGCCTACCGAAATACGGTACGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:a03aed4cc4e5
|
40 | — | — | — |
|
GCACGATTACGCATCCCGGAAGCTAGACTAAGCTTCCGGT
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:bc6bf5a60a96
|
40 | — | — | — |
|
GACGTCGCAGCTCGGTCCCTGCATGACGTCACCGAGACAC
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3cdd49b26ad1
|
40 | — | — | — |
|
TATGGCGTATGACGTCATAGGGTGGCGTACTCAATAACGC
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:84821ae27520
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGCGTGACCAGACCTTTATGACGTCACCTCATCAGCG
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:d56b1b167546
|
40 | — | — | — |
|
CAGCGAACCGACGTTACATACACTAATTCTCACCCTATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3112954bcb45
|
40 | — | — | — |
|
CTAGCAGTAACATAGAAATCCGTTTATGCAGTGGTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:538233851293
|
40 | — | — | — |
|
TTCCTTTTATCGGGATGAGAGCACACGCCCCATAAAAGGT
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:4d962e2312ce
|
40 | — | — | — |
|
TATTCATAACGAACTAGTGACCAACCCTGTGAATGTATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:427d73a16e00
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTTTACGAGCCCACATCTAACTCTCGTAAACATCCAC
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:ce6c08c393ae
|
40 | — | — | — |
|
CGCCATAGCACCTATAATGTGGATTGCCACCTAATCATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:50aa70fb9fcd
|
40 | — | — | — |
|
AAACAGTGCGGAACTGAACCACACATGGAACGGAATATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3cb4b68ce3b1
|
40 | — | — | — |
|
TAAACGTATGACGTCACCATCGGCCCTTAGCCTCTCTTAT
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:638328902780
|
40 | — | — | — |
|
GTGACCATTATCCAAGGAAAGACGTGAATACTCGTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:a077b59dbf78
|
40 | — | — | — |
|
GCCAACGGACCAGAACTCCAATAGAATACCGCATTACACA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:8d49906d61b6
|
40 | — | — | — |
|
TCTCGTAAAAACACTACCTCTGTTTTACGAGCGGAACAGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:ee099d8e66ca
|
40 | — | — | — |
|
GTTCTGCTTGCCGCGCTGTCTCCAGATGTAGATGCTATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:feeab8f5c2dc
|
40 | — | — | — |
|
CAATGTCACACTCCCAGCTATAATTCCTACACATTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:faeffc60c091
|
40 | — | — | — |
|
TACGTATCGTTAAATCAATGAATTTCGTTTAACGATGCGC
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:596a922d7a07
|
40 | — | — | — |
|
TTACATGGCAAGCAACTTGTGTCCAAGCAATTAAGCGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:c2de22b2fec8
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCCTGCTCCGTCACCCCCCTCCCGCTTACGTCACCGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:af00c2eafcc7
|
40 | — | — | — |
|
TCATTTACGAGCTACAACTAGCTCGTAAATACATTACCCC
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3faf2764486e
|
40 | — | — | — |
|
AATCCGACCTTGACACGAGCCCTACCGATGCGCTAGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:9494ca2b3a7c
|
40 | — | — | — |
|
CAATCGGTGACGTAAGCCGCCTTTAGCAATCAATGGCACA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:98a3f2b4d699
|
40 | — | — | — |
|
GGGCCCTGACGCAGCTCAGGCCCAGAACCACGTTCGGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:5e5d014e9f2e
|
40 | — | — | — |
|
TATGGGCTTAACGAGTTAAGTTCCTCGTTAAATGCAACGG
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:c51756b2ece1
|
40 | — | — | — |
|
GACCACTACGACCCCAGTAAAAGCGATGAACGCATGGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:a766b64f4a0b
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGTTAGGCCAGTCTTGCTTCTGAGTTACCTGTGGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:4531588623c7
|
40 | — | — | — |
|
TGGACGTTTCCCTTGTTATGATACCGTCGCTCACTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:a39bc9507440
|
40 | — | — | — |
|
TGTGTCCCCCCGAAAATAAGCTCAACACGCGTTATGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:aa1d0de52b49
|
40 | — | — | — |
|
GTTTAACAGCATTCATTGGTGTTAGATCGTAAGTTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:95d5ae707aa2
|
40 | — | — | — |
|
TCCCCGAACATGCTCTGCAAGAAGCTGGCAACAGTGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:999d7d0cb793
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGCACTTCCGGTCGCGACGTTGGCGCATATCGGTCTA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:0dce33e2666f
|
40 | — | — | — |
|
CCAGGACTATGCGCGATAGCGTAAACATTATGTTCGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:c43a5f7f12d6
|
40 | — | — | — |
|
TACATGTTTATGGGGCTGACGTACCACATAAACTGATTGG
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:108856bb140e
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTCGTAAAAATGCGTGCAAGATTTTTAGCGAGTTACA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:043e4d36281c
|
40 | — | — | — |
|
CTACCTTAACGCGTACACAGGCCAGTCCATGAACCAATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:efbe354ab8aa
|
40 | — | — | — |
|
CACGCATGCCCATCCGCTCGAAAGCCCCAAGCAGTCATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:cecb3dc360cd
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGACCAATAAATCACGTGACATTTATAGGCTGCTCCG
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:ea315e28ddf4
|
40 | — | — | — |
|
TCACCTCGTTAATGTAAAGATTAACGAGGAACAACGGTGT
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3f8193ec6de3
|
40 | — | — | — |
|
GCGTTAGCCCGCCTATCCCTCAGATGACCCCCGCAGATGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:838e9fc5a7d0
|
40 | — | — | — |
|
AGCTTGTCCTACTCCGATCCACCTGTAGGTCGTGACGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:3ff547afea14
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTCGACCGTAACGTTTCCCAGCCTTGCGTATCAGTGA
PANAPTA:P41161:ETV5_HOXB13:PRJEB66722:R3:db792bb24bc3
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final