EVX2_PKNOX1
CAP-SELEX sample PKNOX1_EVX2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CCTAATTACGTTAATTAGCGTGCTAATTACTGTTGTCTAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:c614f90068e3
|
40 | — | — | — |
|
CGCTGACCGAATGAAGTATGATGCCGAGTCACTACGAAGG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:5e588bb1a3e3
|
40 | — | — | — |
|
GCCAAGTACGCTAATTACCGCTAATTACGTGCTAATGTCA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:6ce78352c848
|
40 | — | — | — |
|
AAGTCAACGTCTAGATAAACCGCTTAGACGTGCCAAATTA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:605a59f1c684
|
40 | — | — | — |
|
TGCAACTTTGCACCGGCGCCGTATGTATCAGCTCGAATAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:a72882cce808
|
40 | — | — | — |
|
CTTACGAGTTTTATCACAATCGATGATTAGTTTCATTCGG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:d720935c444b
|
40 | — | — | — |
|
TTGGCAAGTCATTAGCTGCTAATGATCCTAATTAGTGCAA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:7ba0a65e002d
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCCTTACATAACACTACTCTGATCCTACTAGCATTC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:aa8bb9e3ea8b
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAGCGCTAATTAGCATCTAATTATCTTCACCTGCTG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:fda4cbee9f08
|
40 | — | — | — |
|
CATGATGAGCACAGGTAATTAGGCACTAATGACCTAACGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:f721914bbd74
|
40 | — | — | — |
|
ATAAATGCTGCAACCACTAATTAGCATTTGCCTAATTAGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:73ea39bd6e60
|
40 | — | — | — |
|
AAGGTAATTAGGCCCTAATTACACCGTCCAATGCGTGACG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:21b2ff226431
|
40 | — | — | — |
|
ACTCATTAGTGCATTAATTACCTTAATTAGCGCGTGGCTA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:db74abb31a42
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTTTCAGGCTGACGGTCTCTTCACTCTCCGGGCATCG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:ed6c56c66997
|
40 | — | — | — |
|
AACATTACTTATCACCCCTTAATTAGCCACTAATTACCTT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:a714d283f84b
|
40 | — | — | — |
|
AGTCAATGCTAATTAGCACCTAATTAGACCTCGACTTGGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:4c05bdd5228a
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGCTCCCCTAATTACACACTAATTATCCTCCGTAAGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:2a9a4b2a4771
|
40 | — | — | — |
|
GCGGTAATTAGTTAGCGCTAATTACTGCGTCGTAGTGCAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:f073d91063b4
|
40 | — | — | — |
|
ATCATTCCTTACGTGGATACGTAATTAGTACTAATGATGT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:fe9b303ffdd1
|
40 | — | — | — |
|
GCATGAATTCTGACCAGTGGTGACGCTCTCATGACCCCTC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:4214b0482c44
|
40 | — | — | — |
|
GTACTAATTACCCTAATTAATGTCGTTCGTACCGACATCG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:d00bc2d634c6
|
40 | — | — | — |
|
CATAAGTCATGATAGCCCACTAATTACCCTTAATTACTCT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:62dbc271e735
|
40 | — | — | — |
|
CCCCCGCCACCTAATTACACTAATTAGCGCTCCGACATAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:3d3e1177fb8b
|
40 | — | — | — |
|
TCGCGACGCTAATTACCGTAATTAGTACCGACCCTGCCAG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:c4be57e3a104
|
40 | — | — | — |
|
CCTGGATCCACTGGCTCCCGCTTACCAACAGCCCTCCGCT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:fe96cfeb080a
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGTGACTAATTACCCTTACAACTACGGATCCAGTAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:d25c9f703b83
|
40 | — | — | — |
|
AATTAGCATTAATTACGCCTAATTATCATTTGCTACACTT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:2844844993e7
|
40 | — | — | — |
|
CGACCTATGCTAATTAGCTCTAATTACCCACTTACAACAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:9213710d9cdc
|
40 | — | — | — |
|
TGACAGCCACTGTCAAAACGTCATGGCTGTCAAATTACGG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:ed954bfa9ba5
|
40 | — | — | — |
|
GCGACATACTAATTACAGTAATTAACGTCCGCGTCCTAAC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:6187ace5e786
|
40 | — | — | — |
|
AAGCCTGCCTAATTAGGGCTTAATTATCACTAATTACGGT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:a3bf950c04d7
|
40 | — | — | — |
|
CCTCATTAGCAAATTAATTACTGTACCTTAGCTGTATGCC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:1b655a6d70ee
|
40 | — | — | — |
|
ATCATGACTTTCTCTTGTACCACACTAATTACCGTAATTA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:99f8b39242f7
|
40 | — | — | — |
|
GCGCTCCTTCAACGACTAATTACACTAATTAGTGATGCGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:834b89205851
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGACGTAATTAGACACTAATTAAAAGTGCTAATTAGT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:1afc4845849a
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTATGCAATTAGCGCTAATTAGCGACGTTGTCCGGTA
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:adc2bb7abb5c
|
40 | — | — | — |
|
CAGGGTCATTAGGCACTAATTACTAGTGTTGTCAAACTCC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:a5732a23f752
|
40 | — | — | — |
|
TAGACGCGTATGTAATTAAGTACTAATTAGGCTAATCACG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:83a7d120289f
|
40 | — | — | — |
|
TACATAATTACCCTAATTAGCATTGTCGCCCTACTCTGGC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:628f28a30101
|
40 | — | — | — |
|
CTCCCTAATTACACAAGTCATTACTACCCTAATTACGTCC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:037338717c6a
|
40 | — | — | — |
|
TGAGTAATTAGCTACTAATTACTGTCAAAGTGGACAGCAT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:64316f872cae
|
40 | — | — | — |
|
AACGCAGGACGCAACTGTTACTAATTAGCTAATTAGCGTC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:2d16a60858ad
|
40 | — | — | — |
|
GCAACCACGATACGAACGTGATTAGTGGTACTAATTAGTG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:ec9a82567234
|
40 | — | — | — |
|
CTCATTAGCGTGCTAATTACGCGTCTGTGCTTGTCACGCG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:6e4b498c80c7
|
40 | — | — | — |
|
CGTTCGAGCGATACTTCTTAAATTCTGACTGAAATCTTTT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:806b6bc89a78
|
40 | — | — | — |
|
GGGACGCGTTGCTAATTAGGCTAATTAGTAGACTAATATC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:5f9dbaca11a4
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTAACTAACGAGTATCTAATTATCACTAATTAATGTC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:eaa9858c4644
|
40 | — | — | — |
|
TCATTTCACTAATTATTCTCATTAGTGACGCATACGGACG
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:a85a6db40a39
|
40 | — | — | — |
|
TTGACGTCACCGCGCAACGCTAATTAACCTTAATTACGCT
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:eb9f7aca4e71
|
40 | — | — | — |
|
GATAAGATCGTTAATGTGCTAATTAATCTAATTACGAACC
PANAPTA:Q03828:EVX2_PKNOX1:PRJEB66722:R3:8996f7ba3535
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final