FLI1_HOXC10

CAP-SELEX sample HOXC10_FLI1 · 1 runs in PRJEB66722

Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000

Top enriched selection-pool candidates

Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.

Candidate data via API →
Candidate sequence Length log2 FC Class Monotonicity
TGCTGATGTGAAGTATTATCCCGTAAACTCATTTCCGGTA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:828a8b3cab93
40 — — —
GTGACGCGAGGCCGCGTCGCTTTCATCATTTACCCATTGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:22db1de9c3d7
40 — — —
TGCTTCGAGTACTATGTAACCCTGACTCCTACATACCAGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:d2463b2d944e
40 — — —
TACGCACATCCGCTACGTTAAGTGTGACTTCCGCACCGGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:d48f7e94ee56
40 — — —
GTCTATTTCCCCATCACGTCTTATCCCACTGGCCATGCTA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:e5e59ecbf410
40 — — —
CATCACATCCGGTCCCACATGCACCGTAAGTCATTGCCGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:4f9a9970f3da
40 — — —
ATCCTCCCCCTTTCCTGCCTGACGATGTGTGCCAGGACGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:f0682a9424b3
40 — — —
TGTTTTTTTATTCCCACCCTCTATTTTGTTGTTGAACAGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:547bbbc40ee5
40 — — —
TTCAAACTAATGTACGCTCACGATCTCCAGATTTCGCTCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:0e540f00106e
40 — — —
GACGCTGGGCCGGACGCCGCCCTCGTTTCCGGCCCGACCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:90ee1f780993
40 — — —
CTACCTCAACGACTGCGAAGAAATAGTACGACTTGTCGTG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:4a14faf9f408
40 — — —
CGTTACTACGTACCGTAATTAAGATCTTCCGGTTCGTACA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:1ca6b278a218
40 — — —
CGCCAAACAGGGCACTTCCGGTGAAACGCGTAAGCCGTGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:e088d428dabc
40 — — —
CCTATGCTCTAAAGGCTCGCACTATTACAAACTGCCTATA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:2eb8d4d188af
40 — — —
CTCAAGGGACTGGGTATCGAGCGTAAGTCTACAGCACACG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:3f4f37a326d0
40 — — —
ACACCGTAAATTGATGGACACTTCCGGTACGGAAACGTAA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:afa5b8e21c0e
40 — — —
CCTGTTTTACGACTACTTCCGGTGGCGTCAGGATATGCCG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:f13820d21fef
40 — — —
AGCGGTTACAAGGGGCGTAAATGCCTAGCACGTCCGCCCG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:5ce9064ce049
40 — — —
ACGTAAGCATGCCGGGAAGTGATCGTAAAGTTACTTCCTG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:fe5887c2bb50
40 — — —
ACAACGTCATACTACGAATACCGGAAATGCGGTGTTATGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:b3e797f694f8
40 — — —
CAGGAAACACATCGTTAAGTTCAGACTTCCGTGTGTCACG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:e826723ddb20
40 — — —
CGGAAGGAGAGCAGCAGGATGTGGTTCACATCCGGTGCAA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:1d6bf96ece32
40 — — —
GAGCGGTCAACGGAAATGGCAATTTACGTTGCCCAATGGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:c5b7ae14b739
40 — — —
CGTCCTCATTGTCCCGAACCCCTCCCATCTCCCACACTGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:bf46962b57a1
40 — — —
GAATACTCATATTTCCGGAGCCACTTGTTCCGGAAATGTG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:cf984eecc12e
40 — — —
TGAACAGGACGGATGTCTAACATCCTTACTGACCTGGTTA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:24061121b9c8
40 — — —
GAGTCAGACCGTAAGGAAGCGCACCTTCCCTTCCGGTTGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:126c1948f910
40 — — —
CGTTTAGCGCGGCACCGGAAGTTGTTACGTACATTTACGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:c218e0160ff6
40 — — —
TAAAAGTAACTCGATGACTTACTTAATTGCTTATTCAGTG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:a2e2e7a79f71
40 — — —
TAAGTACCCGAAATTAATTATTTCCGGTACTTTTTAGCGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:4b9cbf67fb73
40 — — —
GTCAACCCGTAAATTGCGATCGGCTGATAACAATTTCCGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:6f71b6d31af7
40 — — —
GATATCATCCAATGTTTGAGATCACCACACTGCCTTACGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:9e7be3b6decc
40 — — —
CACGCGCGATATATAGGTCTACATTAATAATGCTTCTTTT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:73c71758209a
40 — — —
CTGCGTTCACCACTGTTTCCGGTCGTTAATGCCGTGTCGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:e857edbbd7ce
40 — — —
ATATCGTAAAACGTAACCGGAAGTCTCACATCCGGTACGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:bb2ce4f47539
40 — — —
AAGGTGCCGTATATGTTATATCCGGTACATATCGCCTACG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:ead4a8a8e5c7
40 — — —
CCATCCGGTAAGTCGCTACTTCCGGAAGATACTACCGAGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:bc1a9fde92d8
40 — — —
CGGTGATATATCCGGTATTTGGATGTATCACTACTAATGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:37e6c69ac000
40 — — —
GCAGTAAAAATGCAAGGTCCGTAAGCTGCGAGCTTCCGGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:29910d72cf71
40 — — —
CACATCCGCACACGGTCGAGGCACCGTAACGACTTCCGGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:3404aeed380f
40 — — —
AGGCGTAAGTCCTTTACTTCCGCCCACGTAAGACGATGTG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:e9d74e148726
40 — — —
CGGTGTGGATGTTACGCAAACCGGAAGGAAATCGTAAGGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:d923ce0020c5
40 — — —
TTTTGCTTTTAAATTCTTATGATATTTGTTTATGATTCGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:55096815c880
40 — — —
CGGATGTCATTAATGGAGCATAGCGGATGCGGCACATCAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:a38944d0eabf
40 — — —
TAAACCGAGTAAGCTGAGATAACCTCCGCTTCCGGTTCTT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:d993316e39c5
40 — — —
CGACAATTGGCATTTCCGGTCGTTAATCCACGACAGTAAG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:a735649bcc8f
40 — — —
CGGTTGAGCAATTGCACTTTCCATGTATCGAAGCGCTTAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:572a4c6c0b29
40 — — —
CCCCCAGACCACTCATGTTTACCACTTCCTAATTTTGCAT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:413783c205db
40 — — —
CGCCGGATGAAGCTGAATTGCATCCTGTATAACAACCATT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:963a444eeb14
40 — — —
CATGACCGGAAGCCGCCCACTTACGGTTGACCGTCATGAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXC10:PRJEB66722:R3:29144b63abfb
40 — — —

SELEX rounds

R3 ·final