FLI1_HOXD4
CAP-SELEX sample HOXD4_FLI1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
CACAGGAAATGCGCATTTCCGGTAGGCACTTAGTCACAGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:045cfa73b8e6
|
40 | — | — | — |
|
AGCTTATGTACACGCGAGAAATGACAGGCATTTCCGGTGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:bdd11d72c293
|
40 | — | — | — |
|
GGCCATCGTAAGTCGAGACATGCCGATGGCGTTCGCGACT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:24f752294421
|
40 | — | — | — |
|
GTTACCGTACGTGGCGCACGTCCGGTCCGCCAGTCGAGGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:62bad8965c1f
|
40 | — | — | — |
|
TGCAACTTACGGTGGTCGCGTAAGCTAAGCTTCCGGACTC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:4890deb90da9
|
40 | — | — | — |
|
TACCGGAAATGTGAATTTCCGGTCTTATCCAATACGCCAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:bc5f766727dd
|
40 | — | — | — |
|
TCCGCCTTGCACCGGAAACGGAAATCGCTTTCCGGTGGGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:2b935cbc1175
|
40 | — | — | — |
|
ACGGCGGTGATTCGTTTCCGCCGGAACCCTCACTTCCGGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:0a9142748103
|
40 | — | — | — |
|
GCACGACGGATATCCGGAGCGGAAGTAAGTACCACCTGCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:0d4165dbcb5f
|
40 | — | — | — |
|
CGCGCGACGGAACCGGACGCAATTAAAGCACTTCCGCCCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:97b365ba6675
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAGTACCGGAAATTGGCATATTTCCGGTTACGAATGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:7e7f13f41f5a
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTGGCCTTGACCGTAACCCTAGTTCCGGTATATTCAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:13fece06efe1
|
40 | — | — | — |
|
GTCGTCGCCGTAAATACAAAATTTCCGGTTACGTCGCCGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:000fc3e2d2eb
|
40 | — | — | — |
|
GAGTCCGTAAGCTGTCTCTTCCGGATGCAGGCAGGACAAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:81b006e4011b
|
40 | — | — | — |
|
CCGGTGCCGGTATGTTAAGCACATCCGGTACATATTGTCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:75b5d14624a1
|
40 | — | — | — |
|
ATCACTGATGCTATCCGGAAGCTGGCTTCCGGAGATGCGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:ef5c624ebb15
|
40 | — | — | — |
|
AGATTTCCGGTTCGTGAACGCGTAAATTGACTCATCTATT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:63074a8a30fe
|
40 | — | — | — |
|
AGGACCGGTGAAATTGCTATTTCCGGTCACGCTAATTTGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:0e8b9f735910
|
40 | — | — | — |
|
ACCCACTTCCGGCTACAACCGCGTAAGTGGAGCTCCATTC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:bd9e61ce2778
|
40 | — | — | — |
|
GCGTGCGTAAACTAGTTTCCGCCCCCTGGCACGTAAGTGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:f2550d00d208
|
40 | — | — | — |
|
GCATGGGTGCTTCCTCCCCGTAAGTGCCATCACATCCGGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:8df40593f9eb
|
40 | — | — | — |
|
AGGTGGCCACTTCCGGCACTCGCGCCGTAAGTGTAACTGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:1ccf2fdb99d2
|
40 | — | — | — |
|
TCGAACCGGAAGCAAGACATCCGGTTAAGGACGTACCCGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:ed0ef4ab6ecc
|
40 | — | — | — |
|
TACAGCATCAGTAAACGTGTTTCCGGTTGCGTGCGCATAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:146c71e683c9
|
40 | — | — | — |
|
GTTTCCGTAAATTAGGACGTTTCCGGAAACCGCCCATTGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:965449dff8d4
|
40 | — | — | — |
|
CCGTAAGTACGAGTAACTTCCGGTGGGTGACCACAGCAGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:6be1abcdca01
|
40 | — | — | — |
|
ACGGGTACTTCCGCTAGTGGCTAGCGATAAGTCCAAGCTT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:f3f589ea7707
|
40 | — | — | — |
|
ATTGACCGGAAGTCTTCTCACTTCCGGTCCCACCATCGGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:60d9dd6f5e55
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGGATGTTGCATAATGACTGTGACATCCGTTCGGAAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:723d1b88040d
|
40 | — | — | — |
|
CCGGCGGAAATGCACGCAATTACATGACGGCACACTTGCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:e863745212b7
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCGACGAATACCGATAATTGCAGTGCATTTCCGGAAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:fad388e96b58
|
40 | — | — | — |
|
CCGTCCCGTAATTACCAAGCACTTCCGGCACGTCCACAGA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:fb91cdb3af2b
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTGCTTCCGCTTCCGGTGCTCATTTCCGCAGCTCTGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:c63e2b8ba85b
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTCCGGCTACGTAAATACACATTTCCGTTGCCCATG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:4a12ae1df9d6
|
40 | — | — | — |
|
CCGCTTCCTGTTTAGGACCGGAAATCCGACTCCCATTAGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:4de29bb896c6
|
40 | — | — | — |
|
TCCCGCTTCCGGTGAGACCGTAAACGCGCCACGCCCAGGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:fb12799118c8
|
40 | — | — | — |
|
ATTGTGCTGCCGTTACACTGCAACGTAAGCATGTATGTAC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:701dc755a0bd
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTCAAAGCAACCGATAAACCATGTCTCCGGTCGATGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:a50003af2773
|
40 | — | — | — |
|
GCGCGATGAAGAAAGGAAATGAGCCTCATTATCCGTCCTT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:6df915084e1a
|
40 | — | — | — |
|
GGAGCAGGAAGTTACCAGTTACTTCCGGCCAAGAACGCCC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:af4f241553b4
|
40 | — | — | — |
|
AGAACAGGAAACAAGATCTCGTTTCCGGTTCTCGCACAAG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:4b70edc9cc70
|
40 | — | — | — |
|
TCCGTTTCCACTTAAGGACACATCCTGTTCCGTCGGCGAT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:ea76b9dd9ba9
|
40 | — | — | — |
|
CGGTTCCGGTACTTAGGCGTGCCGTAACCACGAAAAAGCA
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:f9f4a178b981
|
40 | — | — | — |
|
CGCACAGCACTTCCGGTGGGAGTACCGTAAGTAACTCAGT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:fa7353c2414f
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCCCCTAAATGTCCATTTCCGGGGCGTGCCGGTACGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:2f382530f907
|
40 | — | — | — |
|
TGGACTGACTGCCGCCCCGTCTGAACCGTGACGTAAGTCG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:3c8a3d86ba18
|
40 | — | — | — |
|
CCGCCCATCATTCCGGCGGAAACGGCAATATCCGCTCGGC
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:e942ae6c20d6
|
40 | — | — | — |
|
ATGACGGAATGCAAACGGAAGGAAGTCTCATTTCCGGTCG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:2e40f565e5bb
|
40 | — | — | — |
|
CAGGTGACATCCGGTGTTACTTACCGTAAGTGCAGCAAAT
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:2af2905d85c1
|
40 | — | — | — |
|
ATCGACGCGAAACCTGACCGGAAGACACCGCTTCCGCCGG
PANAPTA:Q01543:FLI1_HOXD4:PRJEB66722:R3:ce65649cfb72
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final