FOXA1_HSF5
CAP-SELEX sample HSF5_FOXA1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AGCGATGACTTGTTTACTTAGAACGAACGTACGTTCCATG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:6e3b9bdbf78b
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTCTATGTAAACATTGACACCCAATCCGACGTCGCAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:b6433c1cfe60
|
40 | — | — | — |
|
ATGTCAATGTTTACATAGAATGTTGGGCCTCCCTTGTGCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:39e664e930c3
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTCTAAGTAAACATTCCAACGCCCCTGCAAATATGAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:e505aa4f60fa
|
40 | — | — | — |
|
CCCCTACACTCTCGTCTATGTTTGTTTAGAACGTTCGTAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:5488623382ed
|
40 | — | — | — |
|
TGCATCATTGTTTGTTTAGAACGTTTGTTCGTCATGCCAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:a1071f2ff8ec
|
40 | — | — | — |
|
ACACAAACAACGCCCATTCATTAACATAAGTAAACATTAA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:3ea0b613dd23
|
40 | — | — | — |
|
ACCTTTACTTCGTGTTCTAAGTAAATATTGACAATAGCTA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:610980a544f8
|
40 | — | — | — |
|
GTACTGTTTACATAGAACGTTCAACCTGTGCTCTGTGCTG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:8c7ac68899e2
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCTGATAACGTTCTAAACAAACAAGCAAATCTTGCTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:6c255463ed6a
|
40 | — | — | — |
|
GTGTAAACAACGTCCATCGCAATGTATTTGCATATTCGTG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:6e6240913057
|
40 | — | — | — |
|
CCCGCTCAGCCCATTGTTTACTTAGAATGTTGACTTGCCG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:92da306cbb52
|
40 | — | — | — |
|
CATAATGATATGCAAATACGCACATTGTTTACTCAATGGA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:854a82548f33
|
40 | — | — | — |
|
GAATGTCCATACCACCACCGTTCTATGTAAACACAAACGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:04b03bb3bf05
|
40 | — | — | — |
|
CTGCAGGGTAAACATTCTAAGTAAACAAAACACCGCCACA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:dc4d9b06056a
|
40 | — | — | — |
|
CCCTAACATTTAATCTTCCTTTGTTTACATAGAACGTTCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:67ad78467774
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATCTCATTATCTGAGTACCGCGCTAGCCATTGTTTA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:f245dd52124b
|
40 | — | — | — |
|
AGCCAGGTTCACAACGTTCTAAACAAACATATCTATGTTA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:cf82f6de2ce9
|
40 | — | — | — |
|
CTATCGAAACAACCGAGTTATTTACTTAGAACGTTGCACT
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:849ab4b94046
|
40 | — | — | — |
|
CTCAGCATTCTAAACAAATAACTTCGTTGTTTGCATAAGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:899ec455624d
|
40 | — | — | — |
|
CACTATGTTTACTTAGAACGTTCGTGAAGGCTGTCTTTCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:e1ae22b6ba30
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTTACTTAGAACGTGAGACAATCTAGGCCAATCATAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:06c7c5b733ef
|
40 | — | — | — |
|
GTACATACACCATGGGCTGCGCCATGGTGCATATGCAGAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:19bcd67396d1
|
40 | — | — | — |
|
CACTACGTACTATTGACATAGAACGCAATGTTCGTTTGTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:2186eca516da
|
40 | — | — | — |
|
CCTTATTTGCTTTTACTGTTTACATAGAACGTCGTGCTTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:68e6993883fd
|
40 | — | — | — |
|
GTACTTCTAACCAATTCAACGTTCTATTGACATAGCACGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:386b7cef10b9
|
40 | — | — | — |
|
TTGTTTGCAGAGCTTTGCGTTCTATTTACCTAGAACGTTG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:dc4fe4021df1
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTCTAAGTAAATAAACGGCTTAGTTGTGAGTCACTGG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:94ffc325362f
|
40 | — | — | — |
|
TACACAGCGTTATGCAAATTAGCTAAAGCATCTCCCCCAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:21c6e2543c74
|
40 | — | — | — |
|
AGGCTGTCATGTTTACTTTACGTTTAGCATATGCAAATAA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:551518e32518
|
40 | — | — | — |
|
TTTAACGTTAATTTATGCGTACCCGTTGTTTACTTTTCCA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:537d064e86a9
|
40 | — | — | — |
|
AAACCACGACTACCAACCGTTTGTTTACATAGAATGCGGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:349a194c0790
|
40 | — | — | — |
|
TTCTCAACGATCGTTTGTTTACTTAGAATGCTTCGATTCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:81ebc46b5989
|
40 | — | — | — |
|
GTGTTCTTCACCTTGCGTTCTATGTAAACAAAGATTGTAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:64b3649508a0
|
40 | — | — | — |
|
CAACTCACGTCTATTAAACATGTTTACATAGAACGTTAGA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:94d8061c117e
|
40 | — | — | — |
|
ACGTTCTGTGTAAACATATGCTGATTCCAGCGTAAATCAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:94168b4a992d
|
40 | — | — | — |
|
CCATTCCCACGTCTACGCCGTTCTATTTACTTAGAACGCG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:09df91c1b1c8
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATTTGCATATGTAAACACACGCCCATGCTTGATGCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:88185e0fdf36
|
40 | — | — | — |
|
CACTTCATACTCGTCCAACATTCTAAGTAAACATTCTCTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:b8ab2f4ad493
|
40 | — | — | — |
|
ATCACCATCGGAAATTTTGAACGTTCTATGTAAACACTGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:86cbd3661eec
|
40 | — | — | — |
|
AACGTTCTAAGTAAACACGTCCAGGCTAATTATTGCTGAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:14c9688ea984
|
40 | — | — | — |
|
GCATAATTAGCATAATCTAATGTTTACTTAACCCCTCCCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:97c5f03d5f63
|
40 | — | — | — |
|
CTACCTCGTTCTAAGTAAACAAACTCGGTCTTTATGCACC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:04f78905904e
|
40 | — | — | — |
|
ATCCCTGTTTTTTGCCTTTGTTTACTTATGCTAATTGCTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:e765d5cf33a3
|
40 | — | — | — |
|
AGGAGTGTAGTGTGGGCATGTTTGTATAGAACGTTGGATA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:25ff15a5bd33
|
40 | — | — | — |
|
CACCGCTTATTTACTTATGCAAATCAAATACGCACTTTAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:ff27c1bb5e6a
|
40 | — | — | — |
|
AACCCACGTTCTAAACAAACAAAAGGTAGTAAACAGTAAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:652e4319f80c
|
40 | — | — | — |
|
CTTATCACCGTCCTAATATACCGTTCTGAACAAATATTGA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:46867ddd5025
|
40 | — | — | — |
|
CACGATCAAATGTTTGTTTATGTAAATTAAGACCATCGAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:5dc6bbe6e757
|
40 | — | — | — |
|
TCACCTTGCCGACCTGTGTTTACATAGAACGTTCGGCGTA
PANAPTA:P55317:FOXA1_HSF5:PRJEB66722:R3:c99adefd16ad
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final