FOXA1_PITX3
CAP-SELEX sample PITX3_FOXA1 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
AAAAGCCATATATACGTCAGCCGTATCCATAGCTCGTTTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:6728f39d6855
|
40 | — | — | — |
|
AATGCATATAACCTTGAATTCCCAAAGTGACATACATTGT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:60463234ab82
|
40 | — | — | — |
|
CATGGTCATAAACAATGCACGATTAGTTCATATCCATGAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:7110edebcb2a
|
40 | — | — | — |
|
TACCCGACCATATAACCAAAATAGGTGACATAGTCGTACC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:54159f508350
|
40 | — | — | — |
|
TAGATTTGTGCATAAATACGTAACGTATGCATACACATAA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:57282c7e96cc
|
40 | — | — | — |
|
CTAATTCATACACTCGATCACGAGGTGCATAAACTTGGAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:7b260ff43ca6
|
40 | — | — | — |
|
AAACAACGCATATAACCGTTCGCCGCTTACATACGTTCGT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:9b4b39e34f2d
|
40 | — | — | — |
|
ATGCATGCTTACATAGCGAGAGTACAGCCATATAAGCTAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:7cbc4fba95e5
|
40 | — | — | — |
|
TTGATTCTTGGGTGCATAAATGAAACATGTCATACACCCA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:a8662715b908
|
40 | — | — | — |
|
AAGTACTCAATCCAACGCTGATAGCTTAACGGCTCTCCGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:10d96acd77d6
|
40 | — | — | — |
|
TTCTAGAATATCATACACTTACGTTCTAAGTGCATAAATT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:098d093c5c53
|
40 | — | — | — |
|
GCTACACCACTGCATATAAGGCCTACTTACATACAGTAGG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:fd6895db2505
|
40 | — | — | — |
|
TGTGCATAAATTTTAGGGAAGCTAAAGTTCATACACCTAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:648ef7d0b9c5
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCAATTACATATAATGGGTAACCATTACATATAAGAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:4e807a8219c9
|
40 | — | — | — |
|
CACCCCGTCTCCCCCGCCTGCACTGCCCTCCCTCCCTCTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:714d95fcee07
|
40 | — | — | — |
|
GTTCACATATAACTATGACGATAATTACATATGAAGCAAA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:cc9a080340b6
|
40 | — | — | — |
|
GCATGCTGGTACGTACATATAATGGTCGTTACATATACGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:ceae7af5b0ae
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATATAAACCGCCTTTCTTTGCGGCTTTACATACACA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:9fba1f8504ea
|
40 | — | — | — |
|
AAGCTGGGATTATGTCGTAGTATCGATAATCCCATATGAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:084988f1195e
|
40 | — | — | — |
|
GTTCATTACATACACAAATAATTGTGCATATAATCCACAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:d77d700ce57f
|
40 | — | — | — |
|
GCAAGTACATATAGCTACTAAAAGGCAACATATACTTACT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:25dbe5045e34
|
40 | — | — | — |
|
CCTACCGAAAACTTAGGCAGCCCTGTACAGCAAGTCAACG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:8a5a43fb75ac
|
40 | — | — | — |
|
GTCTTCTCCCCCGAGAAGCGAATCAGTGATTCGCACCTAT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:d6dabcdf99ff
|
40 | — | — | — |
|
CAAGACCACCGGGTTACCGGGATTATGAACGATAATCCCA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:a7be7849a0d6
|
40 | — | — | — |
|
CGCCTTCATCCGCTCTCCCTGCTTGCTGCCAACGCTCCAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:fa431a33515e
|
40 | — | — | — |
|
AACCTGACATATATTCAGCTTTAATACATATAAGGTGTGT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:257b1b18fa96
|
40 | — | — | — |
|
TTACGCACTGCACGGCCTGGCACTACCTTCCTCAACGCTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:2cd88af05672
|
40 | — | — | — |
|
ACGCATACTACGTGTCTTCATGTATTAAGAAGTGAATGTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:7a9ac6a3b489
|
40 | — | — | — |
|
CCACTCACTGCCTCCGCACCACCCTTTAGTCGCCCCTACC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:bcccaa92b34d
|
40 | — | — | — |
|
ACTTACATATACGCATCCATTAGCGTACATATAATTAACA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:4864c1c91681
|
40 | — | — | — |
|
TTCCCTTATCGCTTACCGTTTGTATCCTCTCTACTTACAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:710685fb97e0
|
40 | — | — | — |
|
GATCAACTTTGCTATATCCGTTAGTTAGGACCATCCATTG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:3c5115d7452b
|
40 | — | — | — |
|
CCCTCATGACATATCCAAATTCATTTGGACATATAACGAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:2bd86c1bedc2
|
40 | — | — | — |
|
AGTAAGTTCATATACACTTATGTGTACATAAATTGGAATC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:d80aab512950
|
40 | — | — | — |
|
TGGCGGTCTACATACAATCGAGCATTGCATATAGAATGTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:90686adf5e85
|
40 | — | — | — |
|
GCTCTCCACCTTTACACTTACCGCCATCTCACCTTCCACC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:4240f02e583f
|
40 | — | — | — |
|
AAGTGCATATATAAGTTGCTTTCATTATACATACACAGCA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:d846df754a20
|
40 | — | — | — |
|
TTGCTCCCGCACCATACTCATGAGCTGCCACTACCGTCCC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:54a021c1392b
|
40 | — | — | — |
|
AGGGCCAAAAGACCATCGTGGAGCTGCCCTTCACTTTATG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:cdc8e71e5e0a
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGCGTCACCTGATAGGCGCCCGTTCTGAACACCTCAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:e36782149e23
|
40 | — | — | — |
|
CCCTGACCCCCCCCTGGATTAACGTAACCTTAATCCGCGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:d8e20ecb7c50
|
40 | — | — | — |
|
CGCTTCTCGAGCCACCCCTCTTTCATTCTACTTGCCGTAG
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:5bb8f8b818f3
|
40 | — | — | — |
|
GCGACCCTAAGGATTAAGGCACATAATTCGCACTTTCCCT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:fd69b4924432
|
40 | — | — | — |
|
ATAAACGAGGACCAAGGAATGAAATTTGATTCACAAATAC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:6b12ead0aab6
|
40 | — | — | — |
|
CCTCCCTCACTTCCGTCACGCGCTGGCCCACTATGTCGTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:42791d80f6bf
|
40 | — | — | — |
|
ACTCCATCTCCTCTTCCGCCATCCTAACAACGATCTCAGT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:27280e9a2311
|
40 | — | — | — |
|
CATCACTGATCCACTTGGTTCCCCGCGCTTCATCCACGTC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:ccdb46f5e7ad
|
40 | — | — | — |
|
CGCCGCTTATCTCCAATCACACCTGACCCTCACGCATAAA
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:3ce91b976057
|
40 | — | — | — |
|
CCTCGTACATATACAAGTCGATTCTCGTACATATACGTTT
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:bed087957a5c
|
40 | — | — | — |
|
GCGCCTTACTAGAGTACACATGATACGGACTTCTTCTTGC
PANAPTA:P55317:FOXA1_PITX3:PRJEB66722:R3:054668582cf4
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final