FOXB1_ISL2
CAP-SELEX sample FOXB1_ISL2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTCGCGCATACGGGGGCACTGCATTAACTGAGCCAGCCAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:aa9f5a285709
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGCTAATTGATCACGTTATGTCAACACCTAATGTAAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:a2cc58a10b97
|
40 | — | — | — |
|
TATGGCGTACACAAATATTGACATTAATGGGTACGTACCA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:89d6fe6f0d35
|
40 | — | — | — |
|
TGACTCGTTAGCTTACGTAAATATTTGCATATGCTTGACG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:5089ddfc3155
|
40 | — | — | — |
|
ACAAGGTTTAAGTACATATTGACACGGTAAACAGCATTCG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:ca53d182ef36
|
40 | — | — | — |
|
AAACGTGTTAAGTGGCTATTGTAATGCTAATATTGACTCA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:a420ca52364c
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTGTACATTGGCAGTAAGATGGAGTTAAGTACACAG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:b5bc82f6795a
|
40 | — | — | — |
|
AACGATCTCCATTGACAGTGCAAATATTGACTCAGGCACT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:4b41af96f8a4
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCCCCCACGTAACCCGTAAGCAAATATTGACACGTCG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:814bca5f5bd0
|
40 | — | — | — |
|
TGGCTCGATAACACGAACTGTAAATATTGACTCGTTAATG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:abe4bda9de72
|
40 | — | — | — |
|
TTGGTAAATATTGACATAGTGCCCTATTACGCATCATAGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:f01976f7ff9f
|
40 | — | — | — |
|
ACGATGTGTCTAATATGCAATCTTAGATACATCTCGTTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:ca747f0be0af
|
40 | — | — | — |
|
TAGTTGTTTATATAGCATGCTAATGCAAACAGCCCTTTCG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:42621d4273c6
|
40 | — | — | — |
|
ATTAAGATGCAAATATTGACACAACATAGTGTTGGTGATG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:69d7fca84ae9
|
40 | — | — | — |
|
TGCATTAACGTGCTAATGGAACGAGACAATGTAAACAAGG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:ea346c32b417
|
40 | — | — | — |
|
ACATCATAAGTGCAAAGGCAAGTGCAAATATTGACTTGCG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:2eea36e3fdb6
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGACGCAAGGTGTATTACCATCATTATGTCAACAAG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:1944e4857622
|
40 | — | — | — |
|
ACACGTTGGTATGTGTACACACACCATTAGTGTACATTAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:d3f1b7abb5a2
|
40 | — | — | — |
|
GACTAAGTAAATATTGTCACTAAGTGAGATGAAGCAAACA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:fd9c72fb0e95
|
40 | — | — | — |
|
CTGATGCGTAAACAATGCCTCAGTTTACATTACTGACGGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:7c573bff43f1
|
40 | — | — | — |
|
TGAGAATGTGTGTAATTAGCAGTCCCATTTCGCGTGTAAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:770cc92a725b
|
40 | — | — | — |
|
GATACACGCTGCGACTAAGATCAATATGTACCTAATGCGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:61037a7d168e
|
40 | — | — | — |
|
TCGATACCATCAGGCCCACGCAATGTAAATATTGACGTAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:d5f170720d15
|
40 | — | — | — |
|
CTGAGCAATTAGCGTATCAATTACTGCCTAGTGTAAACAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:dcac8c44655b
|
40 | — | — | — |
|
TGAATCAATATTGACGTATGACCACGGCGTCCACCTATTT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:55abc30c5ec7
|
40 | — | — | — |
|
GCTAATGGTCAATATTGATATAGCTCGCTATGTCGACAAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:d00e7f58b446
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGCCAAAAACAAACAGTCGGTGCATGATGGTGTAAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:a820b2b9123d
|
40 | — | — | — |
|
GATCCAATGTTGACACTATTAGCACAATCAGTTGTGCAAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:c45c224e8dd5
|
40 | — | — | — |
|
TCATTACATAGTGTGTCAATATTGATTGTTGTGTACATCC
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:e783ce5ab228
|
40 | — | — | — |
|
GTGCATACCCAAATATTGACACGCGGTAATGAGGTACGTA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:aea77554e0fb
|
40 | — | — | — |
|
GATAACGCCAATAATTAGTGTACATAGCAAAAACAAACAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:53c895070027
|
40 | — | — | — |
|
TGTGAATTGATGTTGACCCACGTCGCACTATGTCCACAGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:f862a12f93a8
|
40 | — | — | — |
|
ACGTACGTAGCCTTTGTCAATATTTGCATAGTGCTGGTTT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:3d8339082f59
|
40 | — | — | — |
|
TGTACAAATATTGATTTACGGCCTAAGTGCTTGGATAGCA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:b2801ade85f0
|
40 | — | — | — |
|
TAGTGTGAGGCATAGCACTTAAGTCAATATTTGTGACTAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:3d9339d3e1a4
|
40 | — | — | — |
|
CCTGACAAGCAAATATTGACATTAGTCTTACGTCCACTTA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:39c6b1303151
|
40 | — | — | — |
|
AATGTAAACATTTGCTCAAGGGAGAGCGTATATGCACGTT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:b8932e3a8dbe
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCAACGTCAATATTTATGGAAGGGCTAAGTGCTTTAG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:3317113bb7fd
|
40 | — | — | — |
|
TCATTAAGTAAACGTCAAAGCCAAGTGTGTTTACTTAACC
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:c86cdc9e4073
|
40 | — | — | — |
|
TCACTAAGCGTTCAGTGTACACAAGCGAGAATGTCAACAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:9eae9aa555ee
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGCAAATATTGACTAATGAGTCAACCTAGGGATCGAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:bd04ce44638e
|
40 | — | — | — |
|
GCATTAACAACACCATCAGCAATGTCAATATTTGCACAGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:785d8d6ba4f3
|
40 | — | — | — |
|
TACATGTCCGTATTCGCAATGTCAATATGGACATAGCTTT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:d5d5f3a9f622
|
40 | — | — | — |
|
GGCACTCGTAATGCTATTAGATCAATATTTGCATAGCGCT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:42943591e2dd
|
40 | — | — | — |
|
TATCCTCTAAGTACACTTACCTAAGTAAACACGGCCCATT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:77c57d17a872
|
40 | — | — | — |
|
TGAAATGTATGGATGTACTATGCACATATTGACAAATGAA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:f796ba3933ec
|
40 | — | — | — |
|
ACTTATTGACACACTCTACCAGAGTGTAAACACGTGCAGG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:e32cf476d4fb
|
40 | — | — | — |
|
CGATAATGACACTTGATTGTTTACATAGGTGGCCTATTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:6b6bd7f53a36
|
40 | — | — | — |
|
TGTGATAGCCAAATATTGACATTGACTTACATAGAGGACG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:bf30b3226c4f
|
40 | — | — | — |
|
AACGCAACTTAACGTAAACAAACAGTAATACGCAAACATT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_ISL2:PRJEB66722:R3:ca7277c3716a
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final