FOXB1_TGIF2LX
CAP-SELEX sample FOXB1_TGIF2LX · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACGTAATAGTGTATGTACATACGACAGCGAGCAATTAGGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3f1f4a032cd2
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGTCAATACAACTGACATGTATTGACATAGCAGTTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:dc73807f9a5b
|
40 | — | — | — |
|
AGCAGATATGTCAATATTGACCGAACGCCACGTGAGCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e89f6437b93f
|
40 | — | — | — |
|
TCGCAGCATTGACGTACGGATGACGTATGTCAGTGTCACC
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:67afd5572b3f
|
40 | — | — | — |
|
ATGATTTGACAATGTAAATATACACCTGTCATTTGAGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:38aaf8daf6fb
|
40 | — | — | — |
|
TCAACTCCAATCACTCGCGTCAGGACTGCCATATCGCGCA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:be54fbfbf5e5
|
40 | — | — | — |
|
GCCTGGTATCTGTCACCTGACAGACGTTGACAGCAAGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:b81370e83a30
|
40 | — | — | — |
|
ACACTAAGTACACAATGTCAACAAACTGTCACGGCCCTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9236533d372c
|
40 | — | — | — |
|
GTGTCATTAGCAAATATTGACACGATTGTACGTCATCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:5423530a6e9a
|
40 | — | — | — |
|
CTACGTCAATATTTGCCTAATCTTGACACGTTTGGCGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:1113324f5069
|
40 | — | — | — |
|
GCGAATGTTTACTTACTTCCCTTATGTGACAGGTCGTTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ff4348841542
|
40 | — | — | — |
|
GAAATAGACAGAGAGGCGTCAACGCGTATGTCAATATTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:13c84f49708c
|
40 | — | — | — |
|
ACACGCGTCATCCCGCTGTCAATAATATTGACTTTAGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:11f92e8cf5d1
|
40 | — | — | — |
|
CTAAACAAACATTAACATGACATAATCAATGACACAATGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:662c791dcee6
|
40 | — | — | — |
|
TCGGGGAACGTTGTTGACACAACGAGATGTCACAAACTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c85b0233e2c4
|
40 | — | — | — |
|
AATCGGTAAAGCGGTATGTTGACATATGTCATAGTGGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:322d3f6ae76d
|
40 | — | — | — |
|
GACTGGCATTAAGTCAATAGGGACCTGTCAGACTGGCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:06a238e827cf
|
40 | — | — | — |
|
GATGTTGCGTTATGTCAACACACTTCTGACAGCGACGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:fc867e1d03ec
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGACTTGACAGTATGTCAATTCTGTGACACTTTGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:bb4363eb209f
|
40 | — | — | — |
|
CAGCATCCATCTTAGTGTTGACATAACAATTGACATGTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2028928c7e26
|
40 | — | — | — |
|
ATTGTGTAAATAGTCAAGACTGTCAAGTGACATCTTGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:8f73f173cc01
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTCACTGATAGCTGTCAATGTAGCTGACAGCGACTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:d5a827442a0d
|
40 | — | — | — |
|
GCATGAATCAATATTGACATGACGTATGCACGCGCCGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0bf27107b881
|
40 | — | — | — |
|
ACCCCCGCGATGACAGCTGTCACGTTATAGTGACAGCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:c713510d39ec
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGCCGCGACACTGTCAACAACGATGACAGCTTCCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:1cb011e402f4
|
40 | — | — | — |
|
CCTAGAATGACAGCTGTCAACTGCTGTCATACTCTGACGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:7e021b2edd8e
|
40 | — | — | — |
|
ATCTATTGACATTGCCTAACTTATAACTGTCACGATATGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:12e0b2b33c5f
|
40 | — | — | — |
|
CGCTATTGACAAGCTGAACTGTCACTATGTGTCATTTTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:34e02f81f181
|
40 | — | — | — |
|
AGATACCCTTATTTGGATAGCCTGACAGCTGTCAACGGGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:baf8190bd3eb
|
40 | — | — | — |
|
CCTGTCATTACCTTGACAGCGCTAATCAAACATGACAGCA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:54b9a9d01cbe
|
40 | — | — | — |
|
GTGCTGTCAACATCCAGCTGTCAAAACTGACTGCTCGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:867efb360013
|
40 | — | — | — |
|
CTGTGTATTGACACAGCATGACACTGACAGGTCTCCCGAT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:72832d9b57ef
|
40 | — | — | — |
|
CCGCGATGCGTGACATATGTAAATAATACATGACAGATCG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:32170d492c16
|
40 | — | — | — |
|
CACTATCCTGACAGCTGTCACCCGCTCGCCTGTCATCTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:2f4f412d4c81
|
40 | — | — | — |
|
CCCGTGCACGTCAAAAAAGTCAATATTGACATTGCGGTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e954e17f64df
|
40 | — | — | — |
|
TATGACACACCTAAATGTCACAGACTATTGACATAGCTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:bb3d7d709791
|
40 | — | — | — |
|
CCCATACATTGGAGCTGTCACCAAAAGTAAACATTGCTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:ba59be37230e
|
40 | — | — | — |
|
AATGTATCGATGAGGATGGATAATAATGCGGTACACGAAC
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0add9da87c56
|
40 | — | — | — |
|
ATGTGAACTTACCTTACCAAACGCAAATATTGACACACGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:840cc99c985f
|
40 | — | — | — |
|
CAAGACTATGACAGTTCTGTCAGTGCCTGTCAGGAAATGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:425c81e87007
|
40 | — | — | — |
|
CTGGAAACGCTATTGACACCTGTCAGAGCATGTGTAAATA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:e7c221d985e8
|
40 | — | — | — |
|
AGGGTGACAGAACACTGTCAGTATTGCGACAGCCCAATGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:36a5dc9a76d8
|
40 | — | — | — |
|
TGCGATCTTGCACAGTGTTTACTTATGTCAATTCGGTTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:fe9b4791c260
|
40 | — | — | — |
|
GACGCGATACTTGTCCAAATATTGACACTGAGACGTCAAG
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:0dddc7ef849c
|
40 | — | — | — |
|
AGCTGTCACATTCTGACAGCCCCGCGCTCTGTCACACTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3b780a48f4c0
|
40 | — | — | — |
|
ACAACCTTAAGCACACATGACACTTATTGACATAAGGTGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:396ac89d8b8d
|
40 | — | — | — |
|
CCGACATGTCATGTTGACTTTGGATTGTTGACACGAGTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:54fe5f920dd7
|
40 | — | — | — |
|
TGTCAACTGGTGTCAAAATGTTATGTCAATAAATGGTTGA
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:9a7b89b843ae
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGGAGTTTAAAGTCAATAAGCGTGACAGCTGTCAGCC
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:3f1d8aec58e3
|
40 | — | — | — |
|
CACTGTGCACCCTATGTAAACAAAATGTCACGTGGCACGT
PANAPTA:Q99853:FOXB1_TGIF2LX:PRJEB66722:R3:dcfead49e8db
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final