FOXC2_OTP
CAP-SELEX sample FOXC2_OTP · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
ACTGGAAACCACGTAATTACTCGTTAATTACTTACATAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:37b32fa5b421
|
40 | — | — | — |
|
GTAAACAATCGTCCATAATGACTTAAATGACTTATGTCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:3171a4460cd1
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTTGCTTAATTGATAGTGTAAACAATGCTGTGACAT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:332ad1f2a34b
|
40 | — | — | — |
|
AGTGTACTTCCCTCTCTAATTAGGTGCCGCTAATTAGTGT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:04f6b635cd95
|
40 | — | — | — |
|
AATCGAGTATGTTTACGTAAAGGCATAACGTAAACACAAT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:fa9b5f763c98
|
40 | — | — | — |
|
TACCATATACTGGTCACCTCTTCCCCAGTACATAGTAGAG
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:470d6313531e
|
40 | — | — | — |
|
ATTAGCATCGAATTAGGACTAAACAAACAGCTGAAGTCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:bf459d660cd3
|
40 | — | — | — |
|
GGTAACTCCGCAACAATAACACGCTAATTAGTAGGAATAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:3e1ab3f43e35
|
40 | — | — | — |
|
TAGGGTAAACGTAAACAACGCACATGGGATGGTAAACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:45ebdf28fd63
|
40 | — | — | — |
|
TAATTGGCTGGGAGTGACTACTCCTAATTGATTGAGCAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:180e23457274
|
40 | — | — | — |
|
GCGACCTCGTTAATTATCGTAATTTCGCTAATTAAGAGCT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:a594b327ad6a
|
40 | — | — | — |
|
TAGTGTTTACTCAAACAATTAGGAGATGATTAGGAAAACA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:8d796eb00b83
|
40 | — | — | — |
|
GCACAAACTGCTATTGTTGACACATGCGTTCTTATGTCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:c4177290e5a3
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCTCGCGATATTGCTTATTTACACCAATGTCAATAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:1465100737dc
|
40 | — | — | — |
|
ATCTGCCAAATTAAGCTAATATCGCAAACAAACAAACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:f8b710be87b2
|
40 | — | — | — |
|
ACACGTTATGTCAACAAACCCTTAATTACCGCATTAACGC
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:f375fe4bd8e7
|
40 | — | — | — |
|
TCTAATGCCCGCTAATTTGTTAAGTCAACAACACGATCCT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:bfc1490ad958
|
40 | — | — | — |
|
CTCTAGACCGCCGCCCAATAACAAGCCCATATTACCACCA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:b0ab70abb6a5
|
40 | — | — | — |
|
CGAGTCATTACGCCACAAATTACTAAAGTAAACATTGTTA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:5c9240ea128b
|
40 | — | — | — |
|
AAAACGTAAGTAGAGCCACAAGAGCATTGTAGCTCACTGG
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:6cafbf92b996
|
40 | — | — | — |
|
ACTTGATATAGCTCTTTCGCCTGTAAGATCCATATCAGAC
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:0c9ed8c42727
|
40 | — | — | — |
|
GCAGGCCACAGATGCTGGCATGTGTAGCCCTTTGCGCGCA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:a49b1bb3a55c
|
40 | — | — | — |
|
GCACTAATGACTAGAGTCAATACAAGCCCAATAATGTAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:d5706bc828f9
|
40 | — | — | — |
|
ACGGGCCAGCCTAATCATAACATTTAACACGTTAAAACAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:580810449aeb
|
40 | — | — | — |
|
GAAAAGTAGCACAAACTGTTGTTATGTACGTACTTAATGG
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:a69425d7caa2
|
40 | — | — | — |
|
CATTATTGATCGTTGTATACGCACTTATTAGTTACACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:96d59683a951
|
40 | — | — | — |
|
GATTTGTTGTGGTATTTGATACATAAACACTACAACGGTA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:a65a7ec5f335
|
40 | — | — | — |
|
TAATTAGTGTAACCTAATTAGACTCGTGACGTCATGGCCT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:854e5ac839bc
|
40 | — | — | — |
|
ACTGTGCAAACAGCATGTTTACATGAGGCTACAGCGTAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:e450edde7056
|
40 | — | — | — |
|
ATTCAATTAAGTGTTCGCATCCCCTTAATTGCAAACATAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:d8c79f9738ea
|
40 | — | — | — |
|
ATTACCTAATGTTTATACTATCCTTACGTAAACAAGCTCG
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:9edee71d4f8f
|
40 | — | — | — |
|
GCCCAAATAGTCTACATTAGGGTTAAAGCTAATGTGGCTT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:759150bdf64d
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCACCACGGGTCAATGTTTACTTAGCATATCAATCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:cfa3f27e9d54
|
40 | — | — | — |
|
AATGTAAACAAACAAACACAAGTCCGTCATTGCTAAAGCA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:399cb3a16a57
|
40 | — | — | — |
|
ACACACACTATTCTTTGTTATCTTTATCAATTAGCGGCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:d6fdc58a7ec9
|
40 | — | — | — |
|
AAACAACATACCTTGTTTGTCCTATTAGGCTAATTAAGCT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:ca322afbb5bd
|
40 | — | — | — |
|
ATTTCACGAACCCATCAATATTGCTCATCAGTTAAGTAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:3babd2a386a5
|
40 | — | — | — |
|
GATGCCTCCAACGTAAATAAACAATCACACAGCGTTCCCT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:c5fcfa3f41a0
|
40 | — | — | — |
|
TCTGCGACACCCTAATTAAGTACACCCAGTTAATTAGTAG
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:dd63e195bbbb
|
40 | — | — | — |
|
AGATCCACGTCTAATTGAGTTAACCAATTAGCTCTCGTTT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:5744ac5d2886
|
40 | — | — | — |
|
GCGTACCCCGAGATGTGTTTGTATAGGCATGCTATACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:c202e9022950
|
40 | — | — | — |
|
TTAATTATGCAATCATCCCTGACATCACAATGTCAATAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:3e9ae07619e7
|
40 | — | — | — |
|
TCACGTAATTACATTAGTGCTCTAAGCAGCACTAATTAAT
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:4c41c507cf91
|
40 | — | — | — |
|
TGCGTGTTAACAATTCCTCACCTTGCCCAATGTAAACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:b0f3d8d334e4
|
40 | — | — | — |
|
CTGGCTAGGTAATTGCCGCGTAATGCCTTACATACACAAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:ce4ccea9278d
|
40 | — | — | — |
|
GTTATGTACATAAGTACGCGATTATTTACATAACAGCTAC
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:2bd0e5b60c7e
|
40 | — | — | — |
|
CGATGATACTAATTGGACGTCCCATTAACGCTTGTATCAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:170871039162
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCTTCACGGAGCTTAATTGGATGGAATAACAATAACA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:ec54738263a9
|
40 | — | — | — |
|
GATGCCATGTGCATTACCATCGTATTGTTTACATAAACAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:bdbe6f947dd2
|
40 | — | — | — |
|
ACACTCGCCTCACCCATGTTGACCTTAAGGCTAAGAATAA
PANAPTA:Q99958:FOXC2_OTP:PRJEB66722:R3:73c7d47bcb46
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final