FOXD2_OTX1
CAP-SELEX sample OTX1_FOXD2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
TTAGGTAAACACCCGACCCGCTAGAGATACAATTTGTGTC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:0218642a17c4
|
40 | — | — | — |
|
TTTATCACACCTCAATAGCCGTTTCTCGGGAACTTAAACC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:262bdbfed5f3
|
40 | — | — | — |
|
TAATATTATTCTTTGACGCACTATGCGTCCGATTGCCACG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:729975ad3bd3
|
40 | — | — | — |
|
GTTTACGCCCAGCTAAACAAACTGAAAGGCCTCAATACAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:7078ae4b59d8
|
40 | — | — | — |
|
TGGCACCAGGTACGCCAGCTATAAGCTCCCCCGCTGTGAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:a57f4d678d78
|
40 | — | — | — |
|
TAAGCTATCCCCTTATCCGCTTTATCATGACGAGTTAGAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:a02f8c284cd4
|
40 | — | — | — |
|
CGATGCTCCCCCCCTCGCACTTCCTTACGCAAACACTGAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:619dcf3ebfd9
|
40 | — | — | — |
|
CAGGTTAACTATATATAATAACAACGACATGTTATTCTCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:0f7e1eb74f10
|
40 | — | — | — |
|
TTTACGCTTCAGATATTTTAGCCTCTTCACCCTGGTTTGT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:895ce7885368
|
40 | — | — | — |
|
ACGCACTTAGCCTAATTAGACACCTTAACGGTATTGTTCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:faffd5eb68db
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTATAGCTAACCGATTACATCTCGCCCTTGAGATAAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:a8e4c17ed013
|
40 | — | — | — |
|
AGCGCAATGGCCGACAATGTTATCGTAAGGGATTAAAGGC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:82db0daee09b
|
40 | — | — | — |
|
TTATGCAATTCCACAACATTATGCTGCTTTCACTAATCCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:83a587ab071b
|
40 | — | — | — |
|
CGCGAAACCCCATAACCCCATCCCCTCTCCCCATGCCGTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:f33b2eeed9db
|
40 | — | — | — |
|
CAACTGTAAGGAGGAGCGCAACTCAGCAGGGGAAGGACCT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:7cf0c826fa98
|
40 | — | — | — |
|
CACATCTCCGCTCGCCCATTCAGAGACTCCGCGTATAGCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:37c330fb4699
|
40 | — | — | — |
|
CTTAGACACAACTGTAACCTCTCGTCTCATTCATTAATGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:0b9207a665c8
|
40 | — | — | — |
|
TGAGGCGGCATGCTGTACGGTCCATCTTGCTCCCTTCCAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:bc1003741037
|
40 | — | — | — |
|
CGATCCCGGACCCTCCACACGGTATGACTTCGTCACCACA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:890a37c59b16
|
40 | — | — | — |
|
CTTAAGTCCATTGTTTACGTAATGCCTAAACAAACATTCA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:183a2f99a0c3
|
40 | — | — | — |
|
AACTGCGGAGTGTTAATGCCTTTCGCAGTCTTTCCCTTCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:a94b744ea9fc
|
40 | — | — | — |
|
TAACGAAGCGTTACGGCTTCCACAAGCAGCTATCATTACG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:5a3c654296dd
|
40 | — | — | — |
|
CCAATTACTAGCGACGAACCCCCTTGCACCGCCACACTCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:6aa56924ab69
|
40 | — | — | — |
|
ACTAATGTAATCCGTTAAACAAACAAGGCAATGCGTCCTC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:373b8384e6de
|
40 | — | — | — |
|
TGGTATTGTTTGTTTAAGCGGATAATCCAACACTGCCCGT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:2c6cdcd6eb12
|
40 | — | — | — |
|
GCACCAGCCCCGCGATTCGTCCACGCGTATTGCCCCAGCT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:4240054c130a
|
40 | — | — | — |
|
TACTCGTTAAACAAATGTTATTACAAGGCGTGACAACACG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:5312e63697e0
|
40 | — | — | — |
|
AAACAAAACTTTCTCAACACTCGACAACTGAGGCACGGCT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:2c0a8eec840c
|
40 | — | — | — |
|
CCTACGAAAAATAAATCTAATCACCGTGACACGCACATAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:6f884ae98fe0
|
40 | — | — | — |
|
TAAAGTTGTTTACTTAAGCTTCCTAATCCGTTAGACCAAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:030e1ac9b1a9
|
40 | — | — | — |
|
AAAGTAAATATTGGTTTAAGCGAATACGTGAACCCGTCAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:55a254be92c3
|
40 | — | — | — |
|
TCTCACACTGTCCACTAAATATCTCGAAAGCAGTTCGCAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:0e7d3022a207
|
40 | — | — | — |
|
ATCGCGTTTACGCAAACAAGTACGATACCAACTGCAGCAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:50e16f124e14
|
40 | — | — | — |
|
TCCTGAACCCTATCCATAACCGACCATCATCGCAATTGTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:e69dadf650b9
|
40 | — | — | — |
|
ACGCCACAATCGTCATGTAACCGCTAGCGAGTACGAAAAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:b91e419e2c3d
|
40 | — | — | — |
|
ATTCTCTGTTCGCTTTTCATGTCAACTATTATGCCTCCTT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:05319955a60a
|
40 | — | — | — |
|
CAATGGCAGGCATGTCCGTCCTCGCACCGCCCATTAATGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:2338538671e6
|
40 | — | — | — |
|
CATCTAGAACCCAAACCACGAAGTATGTAAACTAGACAAG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:72077ca89c9f
|
40 | — | — | — |
|
TTTATCGACCTGCTCCCGTTAGCCTCTAGTCGCTCCGCGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:65e9decf768f
|
40 | — | — | — |
|
CACTACGCCATGCTTAATGATCGCTCCTCCCTAGATGTCA
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:cbd5258ff63a
|
40 | — | — | — |
|
CACCGCCCCCCCTACCCCTTCATCTTTTAAGGATCTGAAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:81dd9660d985
|
40 | — | — | — |
|
GAGGGACGCAATTAGCATAATATTATCCTTACAACAACGC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:99db077f475b
|
40 | — | — | — |
|
GCTTAGCATAATATTTGCGTAACGATGTGGCTTATGTTGC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:8f4098a7ac04
|
40 | — | — | — |
|
GGCGCACTTACGTTATGGGCATAATCCCTTAAGTAAACAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:00b4030fbb62
|
40 | — | — | — |
|
TGCCTTGCGCCCTATGTCAATATTATCATAACGCGAGCAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:f13bc4fd8a8a
|
40 | — | — | — |
|
TACTCCCGTCGTTCGCTAAGGCCTCAAATCTCCCCTTATG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:04aeb767721a
|
40 | — | — | — |
|
CCCAGCGGTCACTTTTATACCACAGCCAACCACAGCCTCT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:96a7b3d7b7d0
|
40 | — | — | — |
|
TACACTTCACCATTAAACTAATATTATCGTAGTGAGCGAG
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:47b250f37e5f
|
40 | — | — | — |
|
GGCTTACGATCATCGTACATAATTCACGCCTTCCAGGCAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:b2190806cfcc
|
40 | — | — | — |
|
TTATTGATTTATATATCAAGCGCATATTCTCCTTGCTTCC
PANAPTA:O60548:FOXD2_OTX1:PRJEB66722:R3:ac52340a6010
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final