FOXD2_POU1F1
CAP-SELEX sample POU1F1_FOXD2 · 1 runs in PRJEB66722
Organism
—
Nucleic acid
DNA
Rounds available
R3
Selection-pool candidates
10,000
Top enriched selection-pool candidates
Candidate ranking reflects selection dynamics, not confirmed binding.
| Candidate sequence | Length | log2 FC | Class | Monotonicity |
|---|---|---|---|---|
|
GTCTAAACAAATGTTTGTTTAAGGTGATCAAATGACGCAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:381dda43135d
|
40 | — | — | — |
|
TGTTAATGAATTAGCTTAAACAAACACTGAATAATGTTTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:9719fa86cbce
|
40 | — | — | — |
|
ACACGTTAAACTAATATTTATTTAGCGTTACAGCTTGCAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:3f28a6ccda82
|
40 | — | — | — |
|
CTGCCTCACCTCATTTGCTTAAACAAACATAAAGCGCGAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:8e7cdc439055
|
40 | — | — | — |
|
TCACTCACGCCTAAACTAACATTATTTTAGCTGACGTACG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:eb7819af1e0f
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTGCTTAAGCTATGCAAATTACGGTGGTAATGCGTTT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:bc176d40b367
|
40 | — | — | — |
|
CATGCATAAACATGGGATGCTAACATAAACAATGCCCCAG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:63bb52877377
|
40 | — | — | — |
|
TCAACTCATTTGCTTAAATAAACATAGCGCGTTGCCGCTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:8f10db029bbd
|
40 | — | — | — |
|
GATGCACAAAACAAACAATGGCCAATTTACGCAAATTATG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:dde96794c4d6
|
40 | — | — | — |
|
CAGTTTGAATGTTAATGTTACAATAACAATAACATAGTGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:827500ef90b1
|
40 | — | — | — |
|
ATCTCGCGAATTTGCATAAACAAACACTACACGCAGCTTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:9a305515c1e6
|
40 | — | — | — |
|
CTATCTCATTGATTATCCTAAACAAACATTGGCCCTCATA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:ffe0a78a315e
|
40 | — | — | — |
|
GTTAAATGATTAGCATTACATAAACATACGTTGCTGTTGT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:508249ccc1d8
|
40 | — | — | — |
|
GGAAAACAAACAATAACATCACAGTTAATTAGCTTATTGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:c0e446579615
|
40 | — | — | — |
|
CTAGTATGTAAATTAGTCTCCTAGCTAAACAAACATGTGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:f0da2661cdbb
|
40 | — | — | — |
|
CCAATTTAAGATGCGTGCTTAATTGATGCAATTGTAGAAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:e95cbeac8c4e
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTAAACAAAGCTGTTTAATTGTAGGGTAAACAGTAAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:a43ee6539280
|
40 | — | — | — |
|
TGACGGGCTCAAAGCGTAAGATAATATTTGCTTTAGGCCA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:5c84e3bf8d12
|
40 | — | — | — |
|
CTTACTGAAACTAGACCGCCCTCACACAAGGCGTTCTACC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:48ee131c5ca6
|
40 | — | — | — |
|
AACCCTGTCTAGTACGTTTACAGTAGGCCTACGCTACGCG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:d1734e763798
|
40 | — | — | — |
|
CAGCAACGTTATTTATTCAGAACACTAAGTAAACATCGGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:b8da6f47eeb9
|
40 | — | — | — |
|
TCTGTGGGCGGGTAGACAAATGTTACAGCAGAGTTGGGCG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:543858afb645
|
40 | — | — | — |
|
CGAGGCCTCATTAGCTTAAAATAACATTATGCTTCATCAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:ef23922fcb4d
|
40 | — | — | — |
|
ATAGGTGCAGGATATGACGTGAACAGATTGAGCCACGCAC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:7f177fcc3f2f
|
40 | — | — | — |
|
AACAATGTTTATTTAGCTTTACAATGATGTAGCACGTTGT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:b56be8f7cf31
|
40 | — | — | — |
|
GGGTGCTAAACAAACAGCAGCAATTCGTTATGCAAATTTG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:6ef046bab40c
|
40 | — | — | — |
|
AGTCAACACTCATTTACATAAATAAACAATGCCCCGTATG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:9c05f5492c93
|
40 | — | — | — |
|
TTTACTTAGTCATGAGGATAATGTTTGTTTACCCATCAGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:9280ccc52eeb
|
40 | — | — | — |
|
CTGCGAGCTAAGTAAATATTATCATAACGACAATGGCATC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:b9869d11fe72
|
40 | — | — | — |
|
CATAATTTGCATAGTTAGTGTTACGTTAATATGGTGTTTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:9462d9d221b7
|
40 | — | — | — |
|
CCTAATCATAATATTGACATAGCTGCAGCACTACGTACAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:d69ab0ed63cc
|
40 | — | — | — |
|
CGCATTGTTTGTTTAGCCTAATTATTCCACTATTTACGGG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:bd440eef22fd
|
40 | — | — | — |
|
CGCATGAAAAGAAACTTATTTGCCTAAAATAACATGCGCA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:d9b57a3b0040
|
40 | — | — | — |
|
TCAATGGCACTGCCCACTAAGTCAATATTTGCTTAGCTGC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:ef5d45bf2df1
|
40 | — | — | — |
|
CGTGCAAGCTTACAATAACATGGCAACGCTTAAGCAAACA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:49554db5d5b3
|
40 | — | — | — |
|
AATCGCCCATGTTTATTTAACGAACGCAATGTTTACTTAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:68eee58c900c
|
40 | — | — | — |
|
AAAAGTAAACTCATGTGTCCGTAAGTCAACAACCACTGTA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:579b58b87d1d
|
40 | — | — | — |
|
TGTTTATTTAGGCTAATTCTGCGATCTGCTACACATACGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:85b8a95c1f51
|
40 | — | — | — |
|
TCGATTATCTTAAACAAACATTCCACAGCATTATGCTAAT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:1fa150e85076
|
40 | — | — | — |
|
GCCGTCGTATGTTGCATACATTAGCTTACAATAACAATGC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:7cd6fee01f6a
|
40 | — | — | — |
|
CGCGAAGACATTGCTTAAGATAATGTTTGCTTAATGGCAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:30877c69167d
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTTTATGCTAAGATTACGTAAACATTCAGAGTCCTC
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:533e9fe13973
|
40 | — | — | — |
|
AAATCGATTACGCAATCAACAGATGACAACTTTAGACGAA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:75f75f9b0ee2
|
40 | — | — | — |
|
AGCATGCTTAAACAAACATCATTAATTGGCGGAGACAACA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:0931c6d68eaa
|
40 | — | — | — |
|
GCTAAACATAATATTTACGTAGTCCATGCGTGTGGTTCGT
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:4bd3e7dae91b
|
40 | — | — | — |
|
AGACCACCGCTTAAAACAACATCATTAACGAAAGCATCGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:3698605e813d
|
40 | — | — | — |
|
TAATGTAAACTATGTGATTTGCGTAAGTAAACATATGGGA
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:af76e174a617
|
40 | — | — | — |
|
GGACGATACCCGCAATGTTATGATAAGGTAATGAGCAGGG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:482be2131dc2
|
40 | — | — | — |
|
AACGGCTTAAACAAACATAATCACGATCGGAACATTGTCG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:093eb33bf9fe
|
40 | — | — | — |
|
ACTGGTGCCTAAATAAACATCGTTAGCATAAGGAAATTAG
PANAPTA:O60548:FOXD2_POU1F1:PRJEB66722:R3:0f9a58038fe7
|
40 | — | — | — |
SELEX rounds
R3 ·final